EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000099080 (Gene tree)
Gene ID: 100005813
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45538 bases
Position: chr10:44309997-44355534
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000141425	ResIII	PF04851.15	3.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000160231	-	4158	-	ENSDARP00000141425	1385 (aa)	-	A0A0G2L9F7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDARG00000099080	sbno1	74	60.159	ENSDARG00000016188	SBNO2	68	63.383
ENSDARG00000099080	sbno1	71	65.688	ENSDARG00000098801	sbno2a	68	65.688

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.586	ENSG00000139697	SBNO1	99	79.214	Homo_sapiens
ENSDARG00000099080	sbno1	83	86.470	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.036	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.558	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	79.131	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000099080	sbno1	100	79.462	ENSACIG00000008088	sbno1	99	78.820	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.108	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.037	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.108	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	81.037	Amphiprion_percula
ENSDARG00000099080	sbno1	99	82.575	ENSATEG00000006667	sbno1	99	81.863	Anabas_testudineus
ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.506	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	79.199	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000099080	sbno1	98	77.874	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	77.454	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000099080	sbno1	94	86.679	ENSANAG00000029958	-	99	86.570	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000099080	sbno1	100	79.023	ENSACLG00000024913	sbno1	100	78.951	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000099080	sbno1	99	88.354	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	88.210	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.557	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	79.485	Bos_taurus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.515	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	78.801	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.615	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	87.302	Canis_familiaris
ENSDARG00000099080	sbno1	95	84.268	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	84.268	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.570	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	86.570	Capra_hircus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.657	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.581	Carlito_syrichta
ENSDARG00000099080	sbno1	96	80.896	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	86.438	Cavia_aperea
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.438	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	86.438	Cavia_porcellus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	75.375	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	75.226	Cebus_capucinus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	78.823	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	86.438	Cercocebus_atys
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.799	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	86.799	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000099080	sbno1	83	84.788	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	84.270	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000099080	sbno1	96	76.476	ENSCHOG00000008814	SBNO1	95	75.905	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.418	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	79.041	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000099080	sbno1	99	75.535	ENSCANG00000042688	-	99	74.893	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.172	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	85.172	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.172	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	85.172	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000099080	sbno1	100	80.567	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	80.611	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000099080	sbno1	99	81.779	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	81.495	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	83.466	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	83.466	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	72.760	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	83.559	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000099080	sbno1	93	74.921	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	74.603	Echinops_telfairi
ENSDARG00000099080	sbno1	75	63.526	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.935	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000099080	sbno1	51	76.685	ENSEASG00005012595	-	92	76.078	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.943	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	79.839	Equus_caballus
ENSDARG00000099080	sbno1	82	81.564	ENSEEUG00000003793	SBNO1	81	81.564	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	85.114	ENSELUG00000002886	sbno1	99	84.687	Esox_lucius
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.800	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	79.372	Felis_catus
ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.506	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	79.342	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000099080	sbno1	94	83.759	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	83.485	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000099080	sbno1	99	81.598	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	81.228	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000099080	sbno1	94	85.377	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.627	Gadus_morhua
ENSDARG00000099080	sbno1	88	79.822	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	79.500	Gallus_gallus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	82.290	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	82.064	Gambusia_affinis
ENSDARG00000099080	sbno1	94	84.043	ENSGACG00000015633	sbno1	99	84.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.767	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	85.461	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.618	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	86.618	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000099080	sbno1	100	73.118	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	72.552	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000099080	sbno1	94	87.044	ENSHGLG00000014165	-	99	86.933	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000099080	sbno1	92	85.328	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	85.328	Hippocampus_comes
ENSDARG00000099080	sbno1	99	88.273	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	89.353	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.076	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.076	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.729	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	82.640	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.747	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	81.676	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.799	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	81.445	Labrus_bergylta
ENSDARG00000099080	sbno1	99	76.835	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	77.456	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000099080	sbno1	99	85.591	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	85.520	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.372	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	78.801	Loxodonta_africana
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.515	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	83.005	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.515	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	83.005	Macaca_mulatta
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.438	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	86.438	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.831	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	81.476	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.840	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	79.528	Meleagris_gallopavo
ENSDARG00000099080	sbno1	94	83.759	ENSMICG00000006573	-	99	78.016	Microcebus_murinus
ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.714	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	85.714	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000099080	sbno1	99	77.094	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	77.039	Mola_mola
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.628	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	79.128	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.786	ENSMALG00000001056	sbno1	100	81.432	Monopterus_albus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.100	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	93.421	Mus_caroli
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.401	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	93.421	Mus_musculus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.043	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	93.421	Mus_pahari
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.315	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	93.421	Mus_spretus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.943	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	79.515	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.271	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	79.128	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.000	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	86.888	Nannospalax_galili
ENSDARG00000099080	sbno1	100	79.023	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	78.951	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000099080	sbno1	99	76.500	ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	81.641	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000099080	sbno1	62	77.358	ENSMEUG00000008768	-	93	75.472	Notamacropus_eugenii
ENSDARG00000099080	sbno1	99	77.643	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	77.627	Ochotona_princeps
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.438	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	86.438	Octodon_degus
ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.760	ENSONIG00000015348	sbno1	100	81.547	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	77.817	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	79.161	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.569	ENSORLG00000001593	sbno1	99	80.000	Oryzias_latipes
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.912	ENSORLG00020015216	sbno1	99	80.114	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000099080	sbno1	99	80.840	ENSORLG00015002726	sbno1	99	80.114	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000099080	sbno1	100	80.952	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	80.583	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.714	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	79.429	Ovis_aries
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.618	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	86.618	Pan_paniscus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.800	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	79.372	Panthera_pardus
ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.757	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	79.399	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.618	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	86.618	Pan_troglodytes
ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.438	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	86.438	Papio_anubis
ENSDARG00000099080	sbno1	99	84.709	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	84.781	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000099080	sbno1	92	75.694	ENSPSIG00000009256	-	99	75.772	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.290	ENSPSIG00000009572	-	99	78.561	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.714	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	85.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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