EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000001274 (Gene tree)
Gene ID: 106000351
Gene Symbol: Syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7070 bases
Position: chrKN672352.1:13124438-13131507
Accession: 106000351
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000001193	SYF2	PF08231.12	1.6e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000001274	-	999	XM_013035608	ENSDORP00000001193	244 (aa)	XP_012891062	A0A1S3GSZ2

Gene Model

Click here to download ENSDORG00000001274's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDORG00000001274's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	ENSG00000117614	SYF2	99	91.736	Homo_sapiens
ENSDORG00000001274	Syf2	91	84.685	ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.328	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000001274	Syf2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000001274	Syf2	97	91.597	ENSAMEG00000010115	-	98	91.597	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000001274	Syf2	95	80.087	ENSACIG00000023688	syf2	91	80.087	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000001274	Syf2	93	79.295	ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.295	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.738	ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.983	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.738	ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.738	Amphiprion_percula
ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	100	78.689	Anabas_testudineus
ENSDORG00000001274	Syf2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000001274	Syf2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000001274	Syf2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.562	ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.562	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	ENSACLG00000019916	syf2	99	78.481	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000001274	Syf2	100	77.459	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.459	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.837	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	93.162	Bos_taurus
ENSDORG00000001274	Syf2	85	50.476	WBGene00019402	syf-2	99	46.352	Caenorhabditis_elegans
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.562	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.562	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.463	ENSCAFG00000012895	-	100	91.463	Canis_familiaris
ENSDORG00000001274	Syf2	93	87.168	ENSCAFG00000030331	-	96	87.168	Canis_familiaris
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.463	ENSCAFG00020021091	-	100	91.463	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000001274	Syf2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.213	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.213	Capra_hircus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.213	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	Carlito_syrichta
ENSDORG00000001274	Syf2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.803	Cavia_porcellus
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.562	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	92.562	Cebus_capucinus
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	ENSCATG00000026917	SYF2	99	91.322	Cercocebus_atys
ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.443	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.322	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000001274	Syf2	71	78.736	ENSCHOG00000005273	-	96	78.736	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000001274	Syf2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	100	83.468	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000001274	Syf2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSDORG00000001274	Syf2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSDORG00000001274	Syf2	99	78.512	ENSCANG00000037322	SYF2	99	78.512	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.984	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.984	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000001274	Syf2	82	96.482	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000001274	Syf2	89	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	95	76.957	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.049	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.279	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.279	Danio_rerio
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.245	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	92.245	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000001274	Syf2	89	57.273	FBgn0033556	CG12343	97	57.273	Drosophila_melanogaster
ENSDORG00000001274	Syf2	91	77.376	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.087	Echinops_telfairi
ENSDORG00000001274	Syf2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000001274	Syf2	100	82.377	ENSEASG00005004232	-	100	82.377	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.429	ENSEASG00005004224	-	100	91.429	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.061	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSDORG00000001274	Syf2	96	93.590	ENSECAG00000010440	-	98	93.590	Equus_caballus
ENSDORG00000001274	Syf2	75	80.874	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000001274	Syf2	91	85.135	ENSELUG00000003465	syf2	93	85.135	Esox_lucius
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.057	ENSFCAG00000043095	-	100	91.057	Felis_catus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.870	ENSFCAG00000010324	-	85	91.870	Felis_catus
ENSDORG00000001274	Syf2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	92	82.969	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.393	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	91.393	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000001274	Syf2	91	67.411	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.945	ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.116	Gadus_morhua
ENSDORG00000001274	Syf2	92	88.393	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	Gallus_gallus
ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.788	ENSGAFG00000019435	syf2	96	78.788	Gambusia_affinis
ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.982	ENSGACG00000007305	syf2	98	79.487	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000001274	Syf2	92	89.732	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	86.752	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	92.149	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000001274	Syf2	95	80.087	ENSHBUG00000020477	syf2	98	80.087	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000001274	Syf2	92	83.929	ENSHGLG00000004304	-	99	79.747	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.623	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.623	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000001274	Syf2	92	82.222	ENSHCOG00000012904	syf2	74	82.222	Hippocampus_comes
ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	ENSIPUG00000019859	syf2	100	78.689	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000001274	Syf2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000001274	Syf2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.390	ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.390	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000001274	Syf2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.689	Labrus_bergylta
ENSDORG00000001274	Syf2	89	86.239	ENSLACG00000012064	SYF2	92	86.239	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000001274	Syf2	100	79.508	ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.508	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.061	ENSLAFG00000023150	-	100	93.061	Loxodonta_africana
ENSDORG00000001274	Syf2	75	64.130	ENSLAFG00000030814	-	100	64.130	Loxodonta_africana
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	91.736	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	91.322	Macaca_mulatta
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	91.736	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	91.322	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000001274	Syf2	89	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	97	78.814	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.723	ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.723	Maylandia_zebra
ENSDORG00000001274	Syf2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.393	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.393	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000001274	Syf2	82	98.492	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.623	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000001274	Syf2	91	79.730	ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	Mola_mola
ENSDORG00000001274	Syf2	93	88.596	ENSMODG00000013951	-	99	88.596	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000001274	Syf2	94	80.519	ENSMALG00000010706	syf2	95	80.603	Monopterus_albus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.803	Mus_caroli
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.803	Mus_musculus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.803	Mus_pahari
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.803	Mus_spretus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	89.837	ENSMPUG00000015801	-	100	89.837	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.057	ENSMPUG00000015802	-	100	91.057	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000001274	Syf2	97	92.827	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	92.827	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.089	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.089	Nannospalax_galili
ENSDORG00000001274	Syf2	95	73.593	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.782	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	92.149	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.623	Ochotona_princeps
ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.738	ENSODEG00000014338	-	100	80.738	Octodon_degus
ENSDORG00000001274	Syf2	98	91.597	ENSODEG00000017664	-	100	91.597	Octodon_degus
ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	ENSONIG00000008213	syf2	99	78.481	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000001274	Syf2	83	91.584	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000001274	Syf2	91	82.432	ENSORLG00000028820	syf2	95	82.432	Oryzias_latipes
ENSDORG00000001274	Syf2	100	76.230	ENSORLG00020018333	syf2	100	76.230	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000001274	Syf2	98	77.917	ENSORLG00015014665	syf2	98	77.917	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000001274	Syf2	91	83.333	ENSOMEG00000013911	syf2	93	83.333	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000001274	Syf2	100	94.262	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.262	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000001274	Syf2	80	66.667	ENSOARG00000006269	-	100	66.667	Ovis_aries
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.093	ENSOARG00000006348	-	100	91.093	Ovis_aries
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	92.149	Pan_paniscus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.057	ENSPPRG00000001638	-	100	91.057	Panthera_pardus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.057	ENSPPRG00000001651	-	100	91.057	Panthera_pardus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.057	ENSPTIG00000007036	-	100	91.057	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000001274	Syf2	93	95.595	ENSPTIG00000005711	-	83	95.595	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	92.149	Pan_troglodytes
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	ENSPANG00000008139	SYF2	99	91.736	Papio_anubis
ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.689	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000001274	Syf2	95	86.638	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.638	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000001274	Syf2	92	81.333	ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.213	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.213	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000001274	Syf2	92	93.750	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	93.013	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000001274	Syf2	94	79.565	ENSPFOG00000004116	syf2	94	79.565	Poecilia_formosa
ENSDORG00000001274	Syf2	95	79.221	ENSPLAG00000006691	syf2	98	79.221	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000001274	Syf2	100	72.131	ENSPMEG00000011684	syf2	98	76.623	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000001274	Syf2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	96	78.788	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	92.149	Pongo_abelii
ENSDORG00000001274	Syf2	100	63.115	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.705	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.408	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	ENSPNYG00000004979	syf2	96	80.087	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.689	Pygocentrus_nattereri
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.803	Rattus_norvegicus
ENSDORG00000001274	Syf2	99	89.256	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	89.256	Rhinopithecus_bieti
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	ENSRROG00000001347	SYF2	99	91.736	Rhinopithecus_roxellana
ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.736	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000001274	Syf2	93	92.478	ENSSHAG00000015630	-	92	92.105	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000001274	Syf2	84	94.175	ENSSHAG00000007152	-	100	94.175	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.689	Scleropages_formosus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	75.820	ENSSMAG00000009867	syf2	100	75.820	Scophthalmus_maximus
ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	99	78.423	Seriola_dumerili
ENSDORG00000001274	Syf2	89	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	97	80.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDORG00000001274	Syf2	100	75.102	ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.102	Sorex_araneus
ENSDORG00000001274	Syf2	99	83.058	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	83.058	Sphenodon_punctatus
ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.903	ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.903	Stegastes_partitus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.061	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.061	Sus_scrofa
ENSDORG00000001274	Syf2	70	60.694	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	61.047	Taeniopygia_guttata
ENSDORG00000001274	Syf2	100	75.410	ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.631	Takifugu_rubripes
ENSDORG00000001274	Syf2	91	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSDORG00000001274	Syf2	100	70.082	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	Tupaia_belangeri
ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.984	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	90.984	Tursiops_truncatus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.244	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.244	Ursus_americanus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.650	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.650	Ursus_maritimus
ENSDORG00000001274	Syf2	100	89.754	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	89.754	Vicugna_pacos
ENSDORG00000001274	Syf2	84	96.585	ENSVVUG00000027181	-	100	88.306	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.463	ENSVVUG00000027175	-	100	91.463	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000001274	Syf2	93	85.526	ENSXETG00000022797	syf2	92	85.526	Xenopus_tropicalis
ENSDORG00000001274	Syf2	88	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	96	78.355	Xiphophorus_maculatus