EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000003197 (Gene tree)
Gene ID: 105985031
Gene Symbol: Nrde2
Alias: 6720454P05Rik|BC002230
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38771 bases
Position: chrKN672348.1:10904223-10942993
Accession: 105985031
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000002992	NRDE-2	PF08424.10	2.5e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000003198	-	3697	XM_013015447	ENSDORP00000002992	933 (aa)	XP_012870901	UPI000BAD07D2

Gene Model

Click here to download ENSDORG00000003197's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDORG00000003197's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.816	ENSG00000119720	NRDE2	100	91.667	Homo_sapiens
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	47.546	ENSAPOG00000009202	nrde2	80	47.265	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	79.827	ENSAMEG00000001807	NRDE2	79	79.827	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	49.465	ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.058	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	48.025	ENSAOCG00000015576	nrde2	79	47.744	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	48.589	ENSAPEG00000001711	nrde2	79	48.312	Amphiprion_percula
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	47.536	ENSATEG00000010247	nrde2	80	47.407	Anabas_testudineus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	62.699	ENSAPLG00000015870	NRDE2	81	62.379	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	59.203	ENSACAG00000014571	NRDE2	79	59.311	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	80.301	ENSANAG00000025313	NRDE2	79	80.150	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.970	ENSACLG00000025154	nrde2	77	47.141	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000003197	Nrde2	92	61.538	ENSAMXG00000034642	nrde2	83	42.431	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	75.705	ENSBTAG00000005427	NRDE2	77	78.125	Bos_taurus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.045	ENSCJAG00000017711	NRDE2	79	82.885	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	77.180	ENSCAFG00000017515	NRDE2	80	76.857	Canis_familiaris
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	79.849	ENSCAFG00020016346	NRDE2	79	79.957	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	74.729	ENSCHIG00000005876	NRDE2	79	74.703	Capra_hircus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	78.850	ENSTSYG00000000161	NRDE2	79	78.788	Carlito_syrichta
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.382	ENSCAPG00000012039	NRDE2	81	84.216	Cavia_aperea
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.382	ENSCPOG00000002428	NRDE2	79	84.216	Cavia_porcellus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.153	ENSCCAG00000024917	NRDE2	79	82.992	Cebus_capucinus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.273	ENSCLAG00000015185	NRDE2	79	84.108	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	85.141	ENSCSAG00000011451	NRDE2	79	84.973	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000003197	Nrde2	73	78.509	ENSCHOG00000006165	NRDE2	59	78.509	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	66.379	ENSCPBG00000008537	NRDE2	77	66.379	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.490	ENSCANG00000029067	NRDE2	79	84.324	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	82.922	ENSCGRG00001015658	Nrde2	80	82.548	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.731	ENSCGRG00000005062	Nrde2	79	83.568	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	46.315	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	46.456	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	46.764	ENSCVAG00000023105	nrde2	80	46.575	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	52.915	ENSDARG00000074726	nrde2	77	53.000	Danio_rerio
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.405	ENSDNOG00000024057	NRDE2	79	81.405	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000003197	Nrde2	73	69.062	ENSETEG00000000198	NRDE2	59	68.905	Echinops_telfairi
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	42.782	ENSEBUG00000014552	nrde2	78	42.721	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.080	ENSEASG00005020675	NRDE2	79	82.919	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.027	ENSECAG00000003862	NRDE2	79	83.027	Equus_caballus
ENSDORG00000003197	Nrde2	59	82.386	ENSEEUG00000004026	-	53	81.452	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000003197	Nrde2	100	50.571	ENSELUG00000005973	nrde2	81	50.628	Esox_lucius
ENSDORG00000003197	Nrde2	100	80.407	ENSFCAG00000011312	NRDE2	79	80.324	Felis_catus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	63.404	ENSFALG00000012260	NRDE2	79	63.197	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.839	ENSFDAG00000021350	NRDE2	79	83.676	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	48.265	ENSFHEG00000021385	nrde2	79	48.144	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000003197	Nrde2	80	53.719	ENSGMOG00000015815	nrde2	88	54.624	Gadus_morhua
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	62.274	ENSGALG00000010677	NRDE2	80	62.058	Gallus_gallus
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	48.398	ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.053	Gambusia_affinis
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	49.579	ENSGACG00000012619	nrde2	79	48.459	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	65.841	ENSGAGG00000003252	NRDE2	79	65.841	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.707	ENSGGOG00000008835	NRDE2	80	84.541	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.817	ENSHBUG00000016736	nrde2	77	46.882	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	85.358	ENSHGLG00000006731	NRDE2	80	85.189	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	85.358	ENSHGLG00100017736	NRDE2	80	85.189	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	43.631	ENSHCOG00000009559	nrde2	83	43.301	Hippocampus_comes
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	47.863	ENSIPUG00000016129	nrde2	79	47.249	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.165	ENSSTOG00000001678	NRDE2	79	84.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.632	ENSJJAG00000000907	Nrde2	79	84.541	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	48.020	ENSKMAG00000008647	nrde2	80	47.131	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	49.101	ENSLBEG00000021428	nrde2	83	48.825	Labrus_bergylta
ENSDORG00000003197	Nrde2	88	59.855	ENSLACG00000013921	NRDE2	95	59.466	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000003197	Nrde2	100	56.443	ENSLOCG00000009037	nrde2	79	56.237	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	80.432	ENSLAFG00000004966	NRDE2	81	80.432	Loxodonta_africana
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	85.033	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	91.176	Macaca_mulatta
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.858	ENSMAMG00000013452	nrde2	78	47.468	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.970	ENSMZEG00005008319	nrde2	77	47.033	Maylandia_zebra
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	62.633	ENSMGAG00000013052	NRDE2	94	62.420	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	82.863	ENSMAUG00000018578	Nrde2	79	82.703	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.165	ENSMICG00000016741	NRDE2	79	84.000	Microcebus_murinus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	80.152	ENSMOCG00000014472	Nrde2	79	80.000	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000003197	Nrde2	91	47.260	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	46.804	Mola_mola
ENSDORG00000003197	Nrde2	93	72.203	ENSMODG00000002711	NRDE2	77	72.203	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	47.374	ENSMALG00000021869	nrde2	81	47.351	Monopterus_albus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.779	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	79	81.622	Mus_caroli
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.887	ENSMUSG00000021179	Nrde2	79	81.730	Mus_musculus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.996	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	79	81.838	Mus_pahari
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.996	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	98	78.836	Mus_spretus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	76.948	ENSMPUG00000008135	NRDE2	79	76.807	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.297	ENSMLUG00000007484	NRDE2	79	83.135	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.273	ENSNGAG00000002993	Nrde2	79	84.324	Nannospalax_galili
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	48.528	ENSNBRG00000010184	nrde2	95	47.293	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	84.564	ENSNLEG00000017032	NRDE2	79	84.546	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	62.765	ENSMEUG00000011097	NRDE2	78	62.500	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000003197	Nrde2	65	82.828	ENSOPRG00000001375	-	53	81.373	Ochotona_princeps
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.948	ENSODEG00000012422	NRDE2	81	83.784	Octodon_degus
ENSDORG00000003197	Nrde2	97	48.387	ENSONIG00000019512	nrde2	77	47.557	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	80.303	ENSOCUG00000010083	NRDE2	80	80.151	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	49.073	ENSORLG00000017730	nrde2	89	46.659	Oryzias_latipes
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	48.254	ENSORLG00020015965	nrde2	81	47.650	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.937	ENSORLG00015012437	nrde2	81	47.650	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	47.570	ENSOMEG00000010890	nrde2	79	47.390	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.225	ENSOGAG00000006624	NRDE2	79	83.064	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	73.501	ENSOARG00000003475	NRDE2	81	73.610	Ovis_aries
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	84.816	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	84.649	Pan_paniscus
ENSDORG00000003197	Nrde2	100	80.407	ENSPPRG00000006422	NRDE2	79	80.324	Panthera_pardus
ENSDORG00000003197	Nrde2	100	80.300	ENSPTIG00000009989	NRDE2	79	80.216	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	85.033	ENSPTRG00000023399	NRDE2	80	84.865	Pan_troglodytes
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	50.107	ENSPKIG00000009331	nrde2	79	49.946	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	65.086	ENSPSIG00000005588	NRDE2	79	65.086	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.581	ENSPMGG00000024089	nrde2	82	46.170	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.189	ENSPEMG00000023707	Nrde2	85	83.027	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	72.473	ENSPCIG00000018567	NRDE2	85	72.473	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.097	ENSPFOG00000013217	nrde2	78	45.793	Poecilia_formosa
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.625	ENSPLAG00000022350	nrde2	79	46.170	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.611	ENSPMEG00000000778	nrde2	79	46.105	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.451	ENSPREG00000009066	nrde2	79	46.154	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	82.646	ENSPPYG00000006245	NRDE2	94	82.486	Pongo_abelii
ENSDORG00000003197	Nrde2	77	87.692	ENSPCAG00000016399	NRDE2	61	87.500	Procavia_capensis
ENSDORG00000003197	Nrde2	93	82.624	ENSPCOG00000024684	NRDE2	79	82.624	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	79.195	ENSPVAG00000010023	NRDE2	80	79.195	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	47.609	ENSPNYG00000022833	nrde2	94	46.696	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	48.666	ENSPNAG00000015807	nrde2	83	48.707	Pygocentrus_nattereri
ENSDORG00000003197	Nrde2	88	79.951	ENSRNOG00000004004	Nrde2	78	79.951	Rattus_norvegicus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.623	ENSSBOG00000024346	NRDE2	79	83.459	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	72.060	ENSSHAG00000016736	NRDE2	77	72.060	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	51.974	ENSSFOG00015011794	nrde2	79	51.616	Scleropages_formosus
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	46.786	ENSSMAG00000011671	nrde2	77	46.539	Scophthalmus_maximus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.598	ENSSDUG00000017948	nrde2	79	46.514	Seriola_dumerili
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.852	ENSSLDG00000023798	nrde2	98	47.802	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	64.224	ENSSPUG00000006348	NRDE2	88	64.116	Sphenodon_punctatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	48.704	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.072	Stegastes_partitus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	82.774	ENSSSCG00000002434	NRDE2	79	82.613	Sus_scrofa
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	63.714	ENSTGUG00000012462	-	81	63.588	Taeniopygia_guttata
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	48.039	ENSTRUG00000002798	nrde2	96	47.305	Takifugu_rubripes
ENSDORG00000003197	Nrde2	92	84.308	ENSTBEG00000011834	NRDE2	74	84.259	Tupaia_belangeri
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.996	ENSTTRG00000013583	NRDE2	79	81.838	Tursiops_truncatus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	80.216	ENSUAMG00000004159	NRDE2	83	80.216	Ursus_americanus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	78.162	ENSUMAG00000006393	NRDE2	82	78.162	Ursus_maritimus
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	79.957	ENSVVUG00000018202	NRDE2	79	79.957	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000003197	Nrde2	99	57.573	ENSXETG00000015708	nrde2	81	57.725	Xenopus_tropicalis
ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.403	ENSXCOG00000013298	nrde2	84	46.366	Xiphophorus_couchianus
ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.458	ENSXMAG00000009320	nrde2	79	46.154	Xiphophorus_maculatus