EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000003221 (Gene tree)
Gene ID: 105987612
Gene Symbol: Ctif
Alias: -
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 239411 bases
Position: chrKN672389.1:1063400-1302810
Accession: 105987612
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000025322	MIF4G	PF02854.19	7.9e-28	1	1
ENSDORP00000003015	MIF4G	PF02854.19	8.3e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000024763	-	2170	XM_013018910	ENSDORP00000025322	600 (aa)	XP_012874364	A0A1S3FEH2
ENSDORT00000003221	-	1845	-	ENSDORP00000003015	614 (aa)	-	UPI000BAD29FF

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.000	ENSG00000134030	CTIF	100	93.478	Homo_sapiens
ENSDORG00000003221	Ctif	99	58.387	ENSAPOG00000020192	ctif	99	59.032	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000003221	Ctif	87	92.161	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	92.161	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000003221	Ctif	100	51.040	ENSACIG00000017099	ctif	99	53.201	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	53.790	ENSAOCG00000014275	ctif	99	53.644	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000003221	Ctif	99	54.481	ENSAPEG00000016975	ctif	99	56.076	Amphiprion_percula
ENSDORG00000003221	Ctif	99	54.891	ENSATEG00000016752	ctif	99	55.051	Anabas_testudineus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	74.264	ENSACAG00000018006	CTIF	100	74.419	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.013	ENSANAG00000024925	CTIF	100	92.013	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.117	ENSACLG00000005956	ctif	99	55.263	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000003221	Ctif	63	58.098	ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.983	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	90.500	Bos_taurus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.346	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.346	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000003221	Ctif	97	92.808	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	92.833	Canis_familiaris
ENSDORG00000003221	Ctif	97	92.808	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	92.833	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.183	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	90.183	Capra_hircus
ENSDORG00000003221	Ctif	90	82.963	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	82.963	Carlito_syrichta
ENSDORG00000003221	Ctif	100	84.359	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	83.993	Cavia_aperea
ENSDORG00000003221	Ctif	100	89.431	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	89.431	Cavia_porcellus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.512	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	92.512	Cebus_capucinus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.833	ENSCATG00000038134	CTIF	100	92.833	Cercocebus_atys
ENSDORG00000003221	Ctif	100	91.348	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	91.348	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.422	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	90.422	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	81.322	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	81.322	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.167	ENSCANG00000030916	CTIF	100	93.167	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.500	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	92.500	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000003221	Ctif	100	86.334	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	86.334	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000003221	Ctif	91	61.725	ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.546	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000003221	Ctif	94	61.376	ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.473	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	54.131	ENSDARG00000090617	ctif	100	56.000	Danio_rerio
ENSDORG00000003221	Ctif	72	90.278	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	90.278	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.167	ENSEASG00005016094	CTIF	100	92.167	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.333	ENSECAG00000020473	CTIF	100	92.333	Equus_caballus
ENSDORG00000003221	Ctif	90	82.037	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	82.037	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	61.905	ENSELUG00000008733	ctif	99	61.111	Esox_lucius
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.500	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	92.500	Felis_catus
ENSDORG00000003221	Ctif	97	80.928	ENSFALG00000008943	CTIF	97	80.928	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.164	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	90.164	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.375	ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.375	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	78.618	ENSGALG00000035912	-	100	78.618	Gallus_gallus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.767	ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.120	Gambusia_affinis
ENSDORG00000003221	Ctif	68	76.413	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	76.119	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.667	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	92.667	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.263	ENSHBUG00000018092	ctif	99	55.409	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000003221	Ctif	100	91.000	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	91.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.833	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	90.833	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.058	ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.033	Hippocampus_comes
ENSDORG00000003221	Ctif	100	54.839	ENSIPUG00000014050	ctif	99	53.541	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.000	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	92.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.630	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	90.630	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	53.245	ENSKMAG00000014651	ctif	99	53.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	60.720	ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.111	Labrus_bergylta
ENSDORG00000003221	Ctif	100	62.647	ENSLOCG00000011697	ctif	100	63.181	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	81.571	ENSLAFG00000016335	CTIF	100	97.753	Loxodonta_africana
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.167	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	93.167	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.833	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	92.833	Macaca_mulatta
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.833	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	92.833	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.167	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	93.167	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	56.369	ENSMAMG00000014741	ctif	99	56.579	Mastacembelus_armatus
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ENSDORG00000003221	Ctif	88	52.198	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	52.198	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.167	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	92.167	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.167	ENSMICG00000010167	CTIF	100	92.167	Microcebus_murinus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.500	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	92.500	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000003221	Ctif	99	52.790	ENSMMOG00000000831	ctif	99	53.161	Mola_mola
ENSDORG00000003221	Ctif	100	79.534	ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.534	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000003221	Ctif	84	54.111	ENSMALG00000020553	ctif	99	54.789	Monopterus_albus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.499	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	90.499	Mus_caroli
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.048	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	Mus_musculus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.180	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	92.180	Mus_pahari
ENSDORG00000003221	Ctif	100	89.567	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	100	89.567	Mus_spretus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.500	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	92.500	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000003221	Ctif	100	91.333	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	91.333	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	94.167	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	94.167	Nannospalax_galili
ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.409	ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.556	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.167	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	93.167	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000003221	Ctif	100	76.539	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	76.539	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000003221	Ctif	100	87.333	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	87.333	Ochotona_princeps
ENSDORG00000003221	Ctif	100	87.923	ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.923	Octodon_degus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	61.974	ENSONIG00000007750	ctif	99	62.136	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000003221	Ctif	85	67.491	ENSOANG00000001337	CTIF	100	67.491	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.167	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	90.167	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	56.410	ENSORLG00000005786	ctif	99	56.960	Oryzias_latipes
ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.166	ENSORLG00020005385	ctif	99	57.724	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.698	ENSORLG00015011872	ctif	99	56.250	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000003221	Ctif	99	53.756	ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.118	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000003221	Ctif	100	91.333	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	91.333	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000003221	Ctif	100	91.000	ENSOARG00000003754	CTIF	100	91.000	Ovis_aries
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.000	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	93.000	Pan_paniscus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.333	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	92.333	Panthera_pardus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.167	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	92.167	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.000	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	93.000	Pan_troglodytes
ENSDORG00000003221	Ctif	100	93.167	ENSPANG00000017087	CTIF	100	93.167	Papio_anubis
ENSDORG00000003221	Ctif	85	64.453	ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.258	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000003221	Ctif	100	78.369	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	78.369	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000003221	Ctif	100	49.286	ENSPMGG00000022958	ctif	99	49.140	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.346	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	92.346	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000003221	Ctif	76	83.991	ENSPCIG00000026247	CTIF	95	83.991	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	61.401	ENSPFOG00000009243	ctif	99	61.564	Poecilia_formosa
ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.920	ENSPLAG00000019171	ctif	99	58.400	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000003221	Ctif	99	53.644	ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.956	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000003221	Ctif	99	50.776	ENSPREG00000017326	ctif	99	52.327	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000003221	Ctif	85	92.899	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	92.899	Pongo_abelii
ENSDORG00000003221	Ctif	100	89.369	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	89.369	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000003221	Ctif	100	91.196	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	91.196	Pteropus_vampyrus
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ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.833	ENSRROG00000006039	CTIF	100	92.833	Rhinopithecus_roxellana
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ENSDORG00000003221	Ctif	100	79.035	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	79.035	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000003221	Ctif	100	62.518	ENSSFOG00015022594	ctif	100	63.088	Scleropages_formosus
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ENSDORG00000003221	Ctif	91	67.500	ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	Seriola_dumerili
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ENSDORG00000003221	Ctif	63	58.312	ENSXCOG00000002477	ctif	91	56.490	Xiphophorus_couchianus
ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.075	ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.228	Xiphophorus_maculatus