EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000005610 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Msi1
Alias: Msi1|Msi1h|Musahi1|m-Msi-1
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21719 bases
Position: chrKN672369.1:7937883-7959601
Accession: 105984187
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000005248	RRM_1	PF00076.22	3.1e-29	1	2
ENSDORP00000005248	RRM_1	PF00076.22	3.1e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000005610	-	1059	XM_013014290	ENSDORP00000005248	352 (aa)	XP_012869744	UPI000BAD0C9A

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000005610	Msi1	50	42.308	ENSDORG00000010038	Dazap1	53	42.308
ENSDORG00000005610	Msi1	90	58.696	ENSDORG00000005394	Msi2	84	60.435
ENSDORG00000005610	Msi1	50	39.011	ENSDORG00000027821	-	75	39.080
ENSDORG00000005610	Msi1	50	38.462	ENSDORG00000028671	-	71	38.318
ENSDORG00000005610	Msi1	55	33.803	ENSDORG00000008601	Tia1	67	33.803

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSG00000135097	MSI1	98	99.102	Homo_sapiens
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	84.731	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSAPOG00000023458	-	94	84.731	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000005610	Msi1	96	77.811	ENSACIG00000017754	-	78	81.308	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	76.048	ENSAOCG00000009031	-	95	76.347	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	84.731	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSAPEG00000006857	-	79	84.731	Amphiprion_percula
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	84.731	Amphiprion_percula
ENSDORG00000005610	Msi1	93	82.424	ENSATEG00000023779	-	93	82.424	Anabas_testudineus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	85.106	ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.106	Anabas_testudineus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	92.394	ENSACAG00000002762	MSI1	92	96.108	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.726	ENSANAG00000027151	MSI1	98	99.102	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000005610	Msi1	82	91.034	ENSANAG00000027901	-	92	95.185	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.132	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSACLG00000000117	-	100	84.132	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000005610	Msi1	98	80.925	ENSAMXG00000038960	msi1	75	83.891	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.102	Bos_taurus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	99.102	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.198	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	98.802	Canis_familiaris
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000005610	Msi1	99	90.028	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	93.255	Capra_hircus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSDORG00000005610	Msi1	93	89.776	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSDORG00000005610	Msi1	94	99.102	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.102	Cavia_porcellus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	99.102	Cebus_capucinus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSCATG00000030019	MSI1	98	99.102	Cercocebus_atys
ENSDORG00000005610	Msi1	94	99.102	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.102	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000005610	Msi1	74	90.335	ENSCSAG00000002265	MSI1	93	90.335	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	91.808	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	91.808	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	99.102	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000005610	Msi1	95	99.102	ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.102	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000005610	Msi1	94	76.946	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	76.946	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.431	ENSCSEG00000005834	-	94	84.431	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000005610	Msi1	94	83.234	ENSCSEG00000008352	-	94	83.234	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000005610	Msi1	66	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	84.731	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000005610	Msi1	82	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSDORG00000005610	Msi1	93	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSDORG00000005610	Msi1	95	89.222	ENSDNOG00000005713	MSI1	93	89.222	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSEASG00005004736	MSI1	98	99.102	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSECAG00000017526	MSI1	98	99.102	Equus_caballus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	79.940	ENSELUG00000023280	-	100	79.641	Esox_lucius
ENSDORG00000005610	Msi1	94	79.096	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.096	Esox_lucius
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	99.102	Felis_catus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000005610	Msi1	93	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSFHEG00000003560	-	94	84.731	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	85.030	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.030	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	82.335	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.036	Gadus_morhua
ENSDORG00000005610	Msi1	94	76.347	ENSGMOG00000017838	-	92	76.347	Gadus_morhua
ENSDORG00000005610	Msi1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	96	83.029	Gallus_gallus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.132	Gambusia_affinis
ENSDORG00000005610	Msi1	95	67.964	ENSGAFG00000005860	-	90	67.964	Gambusia_affinis
ENSDORG00000005610	Msi1	94	83.533	ENSGACG00000012679	MSI1	94	83.533	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	80.539	ENSGACG00000008674	-	94	80.539	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	91.525	ENSGAGG00000016037	MSI1	98	91.525	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSHBUG00000011841	-	94	84.132	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.132	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.198	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	98.802	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000005610	Msi1	93	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000005610	Msi1	93	83.891	ENSHCOG00000012067	-	91	82.883	Hippocampus_comes
ENSDORG00000005610	Msi1	94	79.641	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	79.641	Hippocampus_comes
ENSDORG00000005610	Msi1	94	82.635	ENSIPUG00000001976	msi1	99	79.394	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	99.102	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	79.661	ENSJJAG00000010643	-	94	82.036	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	82.335	ENSKMAG00000019877	-	100	82.335	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	83.832	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	83.832	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSLBEG00000001375	-	94	84.132	Labrus_bergylta
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.132	Labrus_bergylta
ENSDORG00000005610	Msi1	93	86.930	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.009	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000005610	Msi1	93	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSDORG00000005610	Msi1	94	99.102	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.102	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000005610	Msi1	94	99.102	ENSMMUG00000031527	MSI1	93	99.102	Macaca_mulatta
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	99.102	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	ENSMAMG00000018426	-	94	84.731	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	83.533	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.533	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSMZEG00005000340	-	94	84.132	Maylandia_zebra
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.132	Maylandia_zebra
ENSDORG00000005610	Msi1	59	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000005610	Msi1	66	98.723	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	98.723	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	ENSMICG00000033181	MSI1	98	99.102	Microcebus_murinus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.198	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	98.802	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000005610	Msi1	94	81.818	ENSMMOG00000012265	-	99	81.818	Mola_mola
ENSDORG00000005610	Msi1	94	74.850	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	74.850	Mola_mola
ENSDORG00000005610	Msi1	93	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000005610	Msi1	94	83.832	ENSMALG00000001426	-	100	83.832	Monopterus_albus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.132	Monopterus_albus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	94.915	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	98.503	Mus_caroli
ENSDORG00000005610	Msi1	99	94.915	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	98.503	Mus_musculus
ENSDORG00000005610	Msi1	99	94.633	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	98.204	Mus_pahari
ENSDORG00000005610	Msi1	99	94.915	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	98.503	Mus_spretus
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000005610	Msi1	93	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000005610	Msi1	95	99.102	ENSNGAG00000014508	Msi1	93	99.102	Nannospalax_galili
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSNBRG00000000841	-	94	84.132	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000005610	Msi1	91	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000005610	Msi1	93	89.634	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000005610	Msi1	93	77.744	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.744	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000005610	Msi1	89	92.063	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	Ochotona_princeps
ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	ENSODEG00000006328	MSI1	100	100.000	Octodon_degus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.431	ENSONIG00000019452	-	94	84.431	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.132	Oreochromis_niloticus
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