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Description

Ensembl ID: ENSDORG00000006476 (Gene tree)
Gene ID: 105992372
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 65684 bases
Position: chrKN672429.1:88948-154631
Accession: 105992372
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000016756	IBN_N	PF03810.19	5.5e-07	1	1
ENSDORP00000023282	IBN_N	PF03810.19	1.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000030050	-	8171	XM_013025226	ENSDORP00000023282	829 (aa)	XP_012880680	UPI000BAD1A48
ENSDORT00000029691	-	2580	-	ENSDORP00000016756	859 (aa)	-	UPI000BAD04DE
ENSDORT00000006476	-	2490	-	ENSDORP00000006063	829 (aa)	-	UPI000BACEF89

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	79.380	ENSDORG00000014993	Tnpo2	93	79.524

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.089	ENSAPOG00000003453	tnpo1	93	94.096	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	98.805	ENSAMEG00000007147	TNPO1	92	98.807	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	93.128	ENSACIG00000003711	tnpo1	92	93.137	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.210	ENSAOCG00000008154	tnpo1	94	94.210	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.210	ENSAPEG00000001112	tnpo1	93	94.217	Amphiprion_percula
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.848	ENSATEG00000010408	tnpo1	93	93.855	Anabas_testudineus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.251	ENSAPLG00000009619	-	93	94.258	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.864	ENSACAG00000009599	TNPO1	93	96.867	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	64.209	ENSANAG00000027118	-	93	64.439	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000006476	Tnpo1	99	90.580	ENSANAG00000025351	-	93	90.482	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	ENSANAG00000022453	-	92	99.277	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	91.677	ENSACLG00000027223	tnpo1	93	91.687	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.900	ENSAMXG00000009842	tnpo1	93	92.428	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSBTAG00000007979	TNPO1	92	99.759	Bos_taurus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSCJAG00000016409	TNPO1	92	99.398	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.519	ENSCAFG00000008081	TNPO1	97	99.519	Canis_familiaris
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.502	ENSCAFG00020017397	TNPO1	93	96.506	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	ENSCHIG00000023462	TNPO1	92	99.639	Capra_hircus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	98.191	ENSTSYG00000001871	TNPO1	94	98.193	Carlito_syrichta
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	ENSCCAG00000026472	TNPO1	93	99.277	Cebus_capucinus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSCATG00000043792	TNPO1	93	99.759	Cercocebus_atys
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	ENSCLAG00000016191	TNPO1	93	99.277	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.879	ENSCSAG00000015616	TNPO1	92	99.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	94	85.990	ENSCHOG00000001746	TNPO1	92	86.008	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.708	ENSCPBG00000000260	TNPO1	88	97.711	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	74.700	ENSCSAVG00000010981	-	97	74.313	Ciona_savignyi
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSCANG00000004353	TNPO1	92	99.759	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	93	99.397	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	97	99.398	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.521	ENSCSEG00000012674	tnpo1	93	92.530	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.245	ENSCVAG00000001010	tnpo1	93	93.253	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.651	ENSDARG00000035390	tnpo1	93	92.298	Danio_rerio
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.149	ENSDNOG00000006647	TNPO1	93	93.157	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	59.831	FBgn0035693	CG8219	96	59.228	Drosophila_melanogaster
ENSDORG00000006476	Tnpo1	85	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	82	99.625	Echinops_telfairi
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	85.163	ENSEBUG00000001895	tnpo1	99	85.301	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSEASG00005018055	TNPO1	93	99.759	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	ENSECAG00000024424	TNPO1	92	99.639	Equus_caballus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	86.231	ENSELUG00000002821	tnpo1	93	85.781	Esox_lucius
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSFCAG00000013181	TNPO1	93	99.759	Felis_catus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.346	ENSFALG00000010292	TNPO1	93	97.349	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSFDAG00000013345	TNPO1	92	99.398	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.855	ENSFHEG00000019234	tnpo1	93	93.863	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	89.904	ENSGMOG00000000347	tnpo1	93	89.916	Gadus_morhua
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.622	ENSGALG00000015014	TNPO1	93	96.627	Gallus_gallus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.298	ENSGAFG00000000943	tnpo1	93	92.298	Gambusia_affinis
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.124	ENSGACG00000015841	tnpo1	93	93.133	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.467	ENSGAGG00000013419	TNPO1	93	97.470	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	82.431	ENSGGOG00000022535	-	92	82.452	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSGGOG00000026800	TNPO1	93	99.759	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.366	ENSHBUG00000008068	tnpo1	93	93.373	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.035	ENSHGLG00000000970	-	93	99.036	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	77.563	ENSHGLG00100000963	-	95	76.988	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.035	ENSHGLG00100017090	-	97	99.036	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.517	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	90	99.518	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.486	ENSKMAG00000018195	tnpo1	93	93.494	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	90	90.000	ENSLBEG00000009521	tnpo1	89	90.000	Labrus_bergylta
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	88.956	ENSLACG00000012199	TNPO1	97	88.969	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	95.175	ENSLOCG00000011092	tnpo1	91	95.181	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.517	ENSLAFG00000011796	TNPO1	96	99.518	Loxodonta_africana
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSMFAG00000003636	TNPO1	92	99.759	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	ENSMMUG00000020923	TNPO1	93	99.639	Macaca_mulatta
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSMNEG00000044581	TNPO1	92	99.759	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSMLEG00000030740	TNPO1	92	99.759	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.848	ENSMAMG00000001357	tnpo1	93	93.855	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.124	ENSMZEG00005004913	tnpo1	93	93.133	Maylandia_zebra
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	92	99.398	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	95.296	ENSMICG00000008468	TNPO1	93	95.301	Microcebus_murinus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	92	99.398	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	92.867	ENSMMOG00000005551	tnpo1	92	92.867	Mola_mola
ENSDORG00000006476	Tnpo1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	75	97.872	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.642	ENSMALG00000009782	tnpo1	93	92.651	Monopterus_albus
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ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	93	99.398	Mus_musculus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	93	99.197	Mus_pahari
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.156	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	93	99.063	Mus_spretus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	ENSMPUG00000014387	TNPO1	92	99.639	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.040	ENSMLUG00000016317	TNPO1	97	99.041	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.517	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	93	99.518	Nannospalax_galili
ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	92.987	ENSNBRG00000009998	tnpo1	92	92.997	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSNLEG00000004572	TNPO1	93	99.759	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000006476	Tnpo1	90	93.023	ENSOPRG00000012390	TNPO1	83	93.050	Ochotona_princeps
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.035	ENSODEG00000001771	TNPO1	92	99.036	Octodon_degus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.575	ENSONIG00000011151	tnpo1	92	92.584	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	96	97.733	ENSOANG00000015785	TNPO1	97	97.736	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.892	ENSOCUG00000013318	TNPO1	97	92.900	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	92.847	ENSORLG00000003182	tnpo1	92	92.857	Oryzias_latipes
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.124	ENSORLG00020011559	tnpo1	93	93.133	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.245	ENSORLG00015019113	tnpo1	93	93.253	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.883	ENSOMEG00000014567	tnpo1	93	92.892	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.879	ENSOGAG00000000808	TNPO1	92	99.880	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSOARG00000005038	TNPO1	78	99.759	Ovis_aries
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSPPAG00000042518	TNPO1	92	99.759	Pan_paniscus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSPPRG00000022336	TNPO1	93	99.759	Panthera_pardus
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSPTIG00000018839	TNPO1	93	99.759	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000006476	Tnpo1	94	86.446	ENSPTRG00000047731	-	93	86.446	Pan_troglodytes
ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	ENSPTRG00000016972	TNPO1	92	99.759	Pan_troglodytes
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