EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000008298 (Gene tree)
Gene ID: 106000222
Gene Symbol: Polr1a
Alias: 194kDa|2900087K15Rik|3010014K16Rik|RPA194|Rpo1-4|mRPA1
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 65791 bases
Position: chrKN672558.1:1494675-1560465
Accession: 106000222
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000007790	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	2.3e-103	1	1
ENSDORP00000007790	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	6.9e-26	1	1
ENSDORP00000007790	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	6.2e-70	1	1
ENSDORP00000007790	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	9.1e-36	1	1
ENSDORP00000007790	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	3.3e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000008300	-	5148	XM_013035459	ENSDORP00000007790	1715 (aa)	XP_012890913	UPI000BACF38A

Gene Model

Click here to download ENSDORG00000008298's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDORG00000008298's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000008298	Polr1a	62	32.406	ENSDORG00000000184	Polr3a	69	32.406
ENSDORG00000008298	Polr1a	68	34.286	ENSDORG00000008667	Polr2a	53	38.060

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.912	ENSG00000068654	POLR1A	100	87.507	Homo_sapiens
ENSDORG00000008298	Polr1a	69	66.947	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	66.947	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.413	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	89.126	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000008298	Polr1a	96	67.472	ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.127	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.943	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	67.980	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.885	ENSAPEG00000016105	polr1a	96	72.222	Amphiprion_percula
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.172	ENSATEG00000016773	polr1a	100	65.782	Anabas_testudineus
ENSDORG00000008298	Polr1a	84	72.082	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.352	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	68.369	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	68.369	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.102	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	87.218	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	61.734	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.908	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.666	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	87.623	Bos_taurus
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	38.483	WBGene00012999	rpoa-1	98	37.927	Caenorhabditis_elegans
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	86.879	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	87.052	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.464	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	88.464	Canis_familiaris
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.324	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	88.324	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	86.732	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	86.508	Capra_hircus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	85.971	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	85.971	Carlito_syrichta
ENSDORG00000008298	Polr1a	97	86.040	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	86.219	Cavia_aperea
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.908	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	89.082	Cavia_porcellus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.168	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	87.341	Cebus_capucinus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.201	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	87.796	Cercocebus_atys
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.294	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.294	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.623	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	87.796	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	74.055	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	74.113	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	46.583	ENSCSAVG00000007184	-	96	49.541	Ciona_savignyi
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	85.029	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	85.029	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	84.598	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	85.061	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000008298	Polr1a	60	90.448	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	91.131	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	61.236	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	60.992	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	63.815	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	63.831	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.882	ENSDARG00000098375	polr1a	100	65.994	Danio_rerio
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	80.556	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	80.834	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000008298	Polr1a	72	100.000	ENSETEG00000000412	-	72	100.000	Echinops_telfairi
ENSDORG00000008298	Polr1a	89	46.911	ENSEBUG00000005667	-	99	47.267	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.664	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	89.358	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.490	ENSECAG00000030510	-	100	89.794	Equus_caballus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.490	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	89.794	Equus_caballus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.490	ENSECAG00000036306	-	100	89.794	Equus_caballus
ENSDORG00000008298	Polr1a	85	96.809	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	96.667	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	66.302	ENSELUG00000012769	polr1a	99	66.996	Esox_lucius
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.905	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	88.303	Felis_catus
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	70.692	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	70.629	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.031	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.915	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	60.852	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.028	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	59.825	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	59.755	Gadus_morhua
ENSDORG00000008298	Polr1a	90	68.337	ENSGALG00000038160	-	99	67.951	Gallus_gallus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.174	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	63.804	Gambusia_affinis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	63.375	ENSGACG00000018791	polr1a	100	63.433	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	89	75.537	ENSGAGG00000004984	-	96	78.947	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.086	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	87.681	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000008298	Polr1a	90	64.235	ENSHBUG00000020021	polr1a	97	66.527	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.141	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	89.257	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.882	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	88.998	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	62.594	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	62.899	Hippocampus_comes
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.360	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	64.750	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.042	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	87.275	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.631	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	88.979	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.904	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	64.812	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000008298	Polr1a	94	68.732	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	68.182	Labrus_bergylta
ENSDORG00000008298	Polr1a	53	74.510	ENSLACG00000003218	polr1a	100	74.510	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	69.625	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	69.683	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.017	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	86.613	Loxodonta_africana
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.681	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	87.854	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.565	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	87.739	Macaca_mulatta
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.681	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	87.854	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.102	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	87.276	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.069	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	65.238	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.855	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.145	Maylandia_zebra
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	68.111	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	67.783	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000008298	Polr1a	92	89.444	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	89.444	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.497	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	88.439	Microcebus_murinus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.282	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	89.282	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.606	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	64.723	Mola_mola
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	73.923	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.808	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.921	ENSMALG00000013363	polr1a	100	65.177	Monopterus_albus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.377	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	87.231	Mus_caroli
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.840	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	87.493	Mus_musculus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.123	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	87.775	Mus_pahari
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	85.657	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	88.306	Mus_spretus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.586	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	88.586	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	86.794	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	87.197	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.288	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	89.288	Nannospalax_galili
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.220	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.260	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	85.953	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.895	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000008298	Polr1a	75	93.701	ENSMEUG00000011665	-	75	93.701	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	82.139	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.080	Ochotona_princeps
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.973	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	89.437	Octodon_degus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.641	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.757	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.676	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	88.850	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.111	ENSORLG00000008753	polr1a	99	63.995	Oryzias_latipes
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	63.399	ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.847	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000008298	Polr1a	96	73.404	ENSORLG00015016071	polr1a	99	73.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.433	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.086	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	86.369	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	87.796	Ovis_aries
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.970	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	87.565	Pan_paniscus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.905	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	88.303	Panthera_pardus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.428	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	87.825	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.854	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	87.565	Pan_troglodytes
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.201	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	87.796	Papio_anubis
ENSDORG00000008298	Polr1a	94	75.694	ENSPKIG00000005468	polr1a	98	75.694	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000008298	Polr1a	63	72.340	ENSPSIG00000009321	-	99	71.402	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000008298	Polr1a	55	66.915	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	66.915	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.751	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.751	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000008298	Polr1a	95	78.650	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	78.771	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.501	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	63.793	Poecilia_formosa
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.730	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.580	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	63.326	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	62.816	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.832	ENSPREG00000002389	polr1a	100	64.159	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.514	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	87.334	Pongo_abelii
ENSDORG00000008298	Polr1a	92	92.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	92	92.000	Procavia_capensis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.388	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	88.388	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000008298	Polr1a	94	86.397	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	86.544	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.855	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	65.145	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	67.615	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	67.615	Pygocentrus_nattereri
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.166	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	89.166	Rattus_norvegicus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.102	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	87.276	Rhinopithecus_bieti
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.045	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	87.218	Rhinopithecus_roxellana
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	36.620	YOR341W	RPA190	99	36.702	Saccharomyces_cerevisiae
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	86.755	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	86.929	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	72.586	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	72.586	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	66.938	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	67.133	Scleropages_formosus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.170	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	64.798	Scophthalmus_maximus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	65.003	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	65.476	Seriola_dumerili
ENSDORG00000008298	Polr1a	95	68.014	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	67.820	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDORG00000008298	Polr1a	75	97.872	ENSSARG00000003136	-	76	97.872	Sorex_araneus
ENSDORG00000008298	Polr1a	95	77.949	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	77.949	Sphenodon_punctatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	64	72.706	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	71.995	Stegastes_partitus
ENSDORG00000008298	Polr1a	83	88.362	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	88.330	Sus_scrofa
ENSDORG00000008298	Polr1a	99	69.865	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	68.885	Taeniopygia_guttata
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	62.285	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	62.637	Takifugu_rubripes
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	59.206	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	59.206	Tetraodon_nigroviridis
ENSDORG00000008298	Polr1a	73	95.575	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	95.575	Tupaia_belangeri
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	83.652	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	83.951	Tursiops_truncatus
ENSDORG00000008298	Polr1a	68	89.848	ENSUAMG00000012158	-	94	89.536	Ursus_americanus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	87.666	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	87.457	Ursus_maritimus
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.348	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	88.348	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	67.686	ENSXETG00000001952	polr1a	100	68.502	Xenopus_tropicalis
ENSDORG00000008298	Polr1a	100	64.829	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.212	Xiphophorus_maculatus