EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000008494 (Gene tree)
Gene ID: 105999123
Gene Symbol: Ago1
Alias: -
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42680 bases
Position: chrKN672527.1:846370-889049
Accession: 105999123
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000021198	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSDORP00000024044	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSDORP00000020022	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSDORP00000007974	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSDORP00000018604	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSDORP00000024044	Piwi	PF02171.17	1.9e-70	1	2
ENSDORP00000024044	Piwi	PF02171.17	1.9e-70	2	2
ENSDORP00000021198	Piwi	PF02171.17	2e-70	1	2
ENSDORP00000021198	Piwi	PF02171.17	2e-70	2	2
ENSDORP00000020022	Piwi	PF02171.17	7.1e-70	1	2
ENSDORP00000020022	Piwi	PF02171.17	7.1e-70	2	2
ENSDORP00000007974	Piwi	PF02171.17	7.3e-70	1	2
ENSDORP00000007974	Piwi	PF02171.17	7.3e-70	2	2
ENSDORP00000018604	Piwi	PF02171.17	7.5e-70	1	2
ENSDORP00000018604	Piwi	PF02171.17	7.5e-70	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000027507	-	7104	XM_013034053	ENSDORP00000021198	778 (aa)	XP_012889507	A0A1S3GNE6
ENSDORT00000031340	-	2361	-	ENSDORP00000020022	786 (aa)	-	UPI000BAD28AA
ENSDORT00000032292	-	2397	-	ENSDORP00000018604	798 (aa)	-	UPI000BACF70D
ENSDORT00000036106	-	2358	-	ENSDORP00000024044	785 (aa)	-	UPI000BAD266E
ENSDORT00000008495	-	2385	-	ENSDORP00000007974	794 (aa)	-	UPI000BAD23E0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000008494	Ago1	97	93.204	ENSDORG00000011242	Ago2	90	93.204
ENSDORG00000008494	Ago1	90	40.741	ENSDORG00000010479	Piwil1	76	40.741
ENSDORG00000008494	Ago1	100	93.204	ENSDORG00000009414	Ago3	90	93.204
ENSDORG00000008494	Ago1	98	90.291	ENSDORG00000008933	Ago4	90	90.291

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	93	98.820	Homo_sapiens
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSAPOG00000024299	ago1	91	97.087	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	93	98.820	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000008494	Ago1	82	90.419	ENSACIG00000005298	ago1	98	90.120	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSAOCG00000017727	ago1	91	97.087	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSAPEG00000004458	ago1	91	97.087	Amphiprion_percula
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSATEG00000008523	ago1	91	97.087	Anabas_testudineus
ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	ENSAPLG00000010440	AGO1	89	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000008494	Ago1	92	99.007	ENSACAG00000029174	AGO1	92	99.007	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	93	98.820	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSACLG00000000890	ago1	91	97.087	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000008494	Ago1	80	98.031	ENSAMXG00000001917	ago1	89	98.031	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSBTAG00000012253	AGO1	93	98.673	Bos_taurus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	93	98.820	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	93	98.820	Canis_familiaris
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.845	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCHIG00000011848	-	91	100.000	Capra_hircus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	78.107	ENSTSYG00000032426	-	89	78.163	Carlito_syrichta
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSTSYG00000009767	-	93	99.255	Carlito_syrichta
ENSDORG00000008494	Ago1	88	100.000	ENSCAPG00000010228	AGO1	90	100.000	Cavia_aperea
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	93	98.820	Cavia_porcellus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	93	98.820	Cebus_capucinus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCATG00000031521	AGO1	92	99.172	Cercocebus_atys
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	93	99.255	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	93	98.820	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000008494	Ago1	91	100.000	ENSCHOG00000011591	AGO1	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	93	98.525	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	93	98.820	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	93	98.820	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	93	99.254	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000008494	Ago1	99	97.087	ENSCSEG00000001051	ago1	91	97.087	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.087	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	96.455	ENSDARG00000092644	ago1	91	96.117	Danio_rerio
ENSDORG00000008494	Ago1	92	99.172	ENSDNOG00000008077	AGO1	92	99.172	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000008494	Ago1	87	92.751	ENSETEG00000007626	AGO1	94	92.751	Echinops_telfairi
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	93	98.820	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	93	98.820	Equus_caballus
ENSDORG00000008494	Ago1	91	100.000	ENSEEUG00000005349	AGO1	83	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000008494	Ago1	90	97.087	ENSELUG00000016803	ago1	90	97.087	Esox_lucius
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	94.532	Felis_catus
ENSDORG00000008494	Ago1	90	100.000	ENSFALG00000000790	AGO1	90	100.000	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSFDAG00000017210	AGO1	93	98.817	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000008494	Ago1	99	97.087	ENSFHEG00000017927	ago1	91	97.087	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000008494	Ago1	86	97.087	ENSGMOG00000019413	ago1	90	97.087	Gadus_morhua
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	93	98.673	Gallus_gallus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.087	Gambusia_affinis
ENSDORG00000008494	Ago1	88	96.335	ENSGACG00000012443	ago1	92	96.335	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000008494	Ago1	92	99.007	ENSGAGG00000012893	-	92	99.007	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	93	98.820	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSHBUG00000010459	ago1	91	97.087	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	93	98.820	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	93	98.820	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000008494	Ago1	99	97.087	ENSHCOG00000005708	ago1	91	97.087	Hippocampus_comes
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSIPUG00000023216	ago1	92	97.087	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	93	98.820	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSJJAG00000019449	Ago1	93	98.673	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSKMAG00000019464	ago1	91	97.087	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSLBEG00000007694	ago1	97	91.641	Labrus_bergylta
ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	ENSLACG00000017009	AGO1	91	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000008494	Ago1	100	95.273	ENSLOCG00000000504	AGO1	90	95.097	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	93	99.255	Loxodonta_africana
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	93	98.820	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	ENSMMUG00000006251	AGO1	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMNEG00000028881	AGO1	92	99.172	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	93	98.820	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSMAMG00000008381	ago1	91	97.087	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSMZEG00005007996	ago1	91	97.087	Maylandia_zebra
ENSDORG00000008494	Ago1	99	98.095	ENSMGAG00000003822	AGO1	91	98.095	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	93	98.820	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	93	98.820	Microcebus_murinus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMOCG00000000537	Ago1	93	98.673	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000008494	Ago1	78	97.852	ENSMMOG00000018459	ago1	85	97.852	Mola_mola
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMODG00000023335	AGO1	93	98.378	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000008494	Ago1	99	97.087	ENSMALG00000011057	ago1	91	97.087	Monopterus_albus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	93	98.820	Mus_caroli
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	93	98.820	Mus_musculus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	93	98.820	Mus_pahari
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	93	98.820	Mus_spretus
ENSDORG00000008494	Ago1	84	99.074	ENSMPUG00000014872	AGO1	92	99.074	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000008494	Ago1	67	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSNGAG00000017448	Ago1	93	98.525	Nannospalax_galili
ENSDORG00000008494	Ago1	92	96.192	ENSNBRG00000010867	ago1	90	97.087	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSNLEG00000011181	AGO1	93	98.673	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000008494	Ago1	82	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	81	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000008494	Ago1	92	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	Ochotona_princeps
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	93	98.820	Octodon_degus
ENSDORG00000008494	Ago1	99	97.087	ENSONIG00000016345	ago1	91	97.087	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSOANG00000002080	AGO1	91	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSOCUG00000023116	AGO1	93	98.673	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSORLG00000014965	ago1	91	97.087	Oryzias_latipes
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSORLG00020018253	ago1	91	97.087	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSORLG00015003287	ago1	91	97.087	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	ENSOMEG00000020528	ago1	91	97.087	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	92	99.255	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSOARG00000019591	AGO1	93	98.673	Ovis_aries
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	93	98.820	Pan_paniscus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	93	98.820	Panthera_pardus
ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	ENSPTIG00000020991	AGO1	93	98.525	Panthera_tigris_altaica
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