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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000008933 (Gene tree)
Gene ID: 105999141
Gene Symbol: Ago4
Alias: AGO4|EIF2C4GN
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46939 bases
Position: chrKN672527.1:781080-828018
Accession: 105999141
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000008388	PAZ	PF02170.22	5.9e-28	1	1
ENSDORP00000019801	PAZ	PF02170.22	5.9e-28	1	1
ENSDORP00000019801	Piwi	PF02171.17	2.7e-105	1	1
ENSDORP00000008388	Piwi	PF02171.17	3.2e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000026450	-	6309	XM_013034078	ENSDORP00000019801	861 (aa)	XP_012889532	A0A1S3GNH1
ENSDORT00000008935	-	2586	-	ENSDORP00000008388	861 (aa)	-	UPI000BAD02AA

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000008933	Ago4	99	81.512	ENSDORG00000009414	Ago3	99	81.512
ENSDORG00000008933	Ago4	99	78.689	ENSDORG00000011242	Ago2	99	78.689
ENSDORG00000008933	Ago4	90	90.291	ENSDORG00000008494	Ago1	98	90.291

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSG00000134698	AGO4	100	99.884	Homo_sapiens
ENSDORG00000008933	Ago4	96	96.301	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.301	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.766	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.418	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000008933	Ago4	92	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000008933	Ago4	92	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSDORG00000008933	Ago4	98	99.528	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.528	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000008933	Ago4	99	98.596	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.596	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.768	ENSANAG00000031428	AGO4	100	99.768	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSACLG00000005181	ago4	100	96.224	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.453	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.258	ENSBTAG00000015220	AGO4	100	98.258	Bos_taurus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.884	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000008933	Ago4	92	100.000	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	Canis_familiaris
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.768	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	99.768	Capra_hircus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSDORG00000008933	Ago4	94	95.973	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.973	Cavia_aperea
ENSDORG00000008933	Ago4	99	97.666	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.666	Cavia_porcellus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.884	Cebus_capucinus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.766	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.766	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	99.884	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000008933	Ago4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.415	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSCANG00000016914	AGO4	100	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.419	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.415	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000008933	Ago4	92	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000008933	Ago4	100	97.683	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.683	Danio_rerio
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	99.884	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000008933	Ago4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSEASG00005012079	AGO4	100	99.884	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSECAG00000024686	AGO4	100	99.884	Equus_caballus
ENSDORG00000008933	Ago4	79	97.527	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	97.527	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	95.672	ENSELUG00000023873	ago4	100	95.672	Esox_lucius
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	99.884	Felis_catus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000008933	Ago4	97	88.756	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.756	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	97.322	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.322	Gadus_morhua
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.419	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.496	Gallus_gallus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	Gambusia_affinis
ENSDORG00000008933	Ago4	99	97.442	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000008933	Ago4	92	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000008933	Ago4	99	96.592	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.592	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000008933	Ago4	100	100.000	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.110	ENSHCOG00000003725	ago4	100	96.110	Hippocampus_comes
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.224	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSKMAG00000018602	ago4	100	96.339	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	95.682	ENSLBEG00000010670	ago4	100	95.682	Labrus_bergylta
ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.490	ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.449	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.449	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000008933	Ago4	93	99.251	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.251	Loxodonta_africana
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	99.884	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.651	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.224	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSMZEG00005026346	ago4	100	96.224	Maylandia_zebra
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.064	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.064	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000008933	Ago4	89	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	96	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.766	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.766	Microcebus_murinus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.419	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.419	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000008933	Ago4	92	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
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ENSDORG00000008933	Ago4	99	95.688	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.688	Monopterus_albus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.955	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	Mus_caroli
ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.722	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	Mus_musculus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.374	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	Mus_pahari
ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.490	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	98.490	Mus_spretus
ENSDORG00000008933	Ago4	92	100.000	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000008933	Ago4	99	98.715	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.715	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSNBRG00000013492	ago4	100	96.224	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000008933	Ago4	90	98.154	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.154	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000008933	Ago4	99	92.389	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.389	Ochotona_princeps
ENSDORG00000008933	Ago4	93	99.875	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	Octodon_degus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSONIG00000013603	ago4	100	96.224	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000008933	Ago4	92	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	99.884	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSOMEG00000006399	ago4	100	96.339	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000008933	Ago4	93	98.498	ENSOGAG00000004233	-	100	98.498	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000008933	Ago4	100	90.941	ENSOGAG00000027107	-	100	90.941	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.182	ENSOARG00000019568	AGO4	98	99.182	Ovis_aries
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	99.883	Pan_paniscus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	99.884	Panthera_pardus
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.883	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	Pan_troglodytes
ENSDORG00000008933	Ago4	92	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.339	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.415	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.415	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000008933	Ago4	92	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	88.644	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.535	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.339	ENSPFOG00000001935	ago4	100	96.339	Poecilia_formosa
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ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	99.883	Pongo_abelii
ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.883	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	99.883	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000008933	Ago4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	ENSPNYG00000002089	ago4	100	96.224	Pundamilia_nyererei
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