EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000011566 (Gene tree)
Gene ID: 105997564
Gene Symbol: Eftud2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39504 bases
Position: chrKN672493.1:714629-754132
Accession: 105997564
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000022518	GTP_EFTU	PF00009.27	2.5e-45	1	1
ENSDORP00000010870	GTP_EFTU	PF00009.27	1.2e-40	1	1
ENSDORP00000010870	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.8e-13	1	1
ENSDORP00000022518	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9e-13	1	1
ENSDORP00000010870	EFG_IV	PF03764.18	1.9e-23	1	1
ENSDORP00000022518	EFG_IV	PF03764.18	2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000011567	-	2898	-	ENSDORP00000010870	965 (aa)	-	UPI000BACF9CE
ENSDORT00000025457	-	2919	XM_013032033	ENSDORP00000022518	972 (aa)	XP_012887487	A0A1S3GHK0

Gene Model

Click here to download ENSDORG00000011566's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDORG00000011566's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000011566	Eftud2	52	31.646	ENSDORG00000014165	Gfm1	60	31.646
ENSDORG00000011566	Eftud2	87	39.175	ENSDORG00000012229	Eef2	99	39.175

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.975	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.588	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	88.477	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.374	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000011566	Eftud2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.078	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.975	Amphiprion_percula
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.387	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.284	Anabas_testudineus
ENSDORG00000011566	Eftud2	99	94.027	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.027	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.222	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.383	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.975	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.607	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSDORG00000011566	Eftud2	99	70.351	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.383	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.588	Canis_familiaris
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.588	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	Carlito_syrichta
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.074	Cavia_aperea
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	Cavia_porcellus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.383	Cebus_capucinus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.383	Cercocebus_atys
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.971	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.383	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000011566	Eftud2	91	86.599	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.251	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	77.744	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSDORG00000011566	Eftud2	99	78.049	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.383	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.564	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.387	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.853	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.947	Danio_rerio
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.765	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.765	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSDORG00000011566	Eftud2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSDORG00000011566	Eftud2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.588	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.486	Equus_caballus
ENSDORG00000011566	Eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.486	Felis_catus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.045	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.383	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.490	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.387	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.947	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.564	Gadus_morhua
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.737	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	Gallus_gallus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.284	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.181	Gambusia_affinis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.383	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.461	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	93.313	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.255	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000011566	Eftud2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	94.033	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.975	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.975	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	Loxodonta_africana
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.383	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.383	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.383	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.387	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.975	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.872	Maylandia_zebra
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.741	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.741	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.383	Microcebus_murinus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000011566	Eftud2	92	81.910	ENSMOCG00000017653	-	90	81.910	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000011566	Eftud2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.074	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000011566	Eftud2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSDORG00000011566	Eftud2	97	99.364	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.364	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.588	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.691	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	Nannospalax_galili
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000011566	Eftud2	97	97.556	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.556	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	95.370	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.370	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.255	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.255	Ochotona_princeps
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.765	ENSODEG00000018041	-	100	98.765	Octodon_degus
ENSDORG00000011566	Eftud2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.975	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.872	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.588	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.667	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.564	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.564	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.222	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.222	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.486	Pan_paniscus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.588	Panthera_pardus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.588	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.486	Pan_troglodytes
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.383	Papio_anubis
ENSDORG00000011566	Eftud2	93	96.913	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.913	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	84.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.074	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.284	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.181	Poecilia_formosa
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.284	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.181	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.284	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.181	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.942	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.942	Pongo_abelii
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	95.062	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.062	Procavia_capensis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.280	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	94.650	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.650	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.770	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	Pygocentrus_nattereri
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.280	Rhinopithecus_bieti
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.280	Rhinopithecus_roxellana
ENSDORG00000011566	Eftud2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.383	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000011566	Eftud2	97	99.041	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.041	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.461	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	Scleropages_formosus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.770	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.667	Scophthalmus_maximus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.078	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	Seriola_dumerili
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.181	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.078	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.947	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.947	Sorex_araneus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.325	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	Sphenodon_punctatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.181	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.078	Stegastes_partitus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.383	Sus_scrofa
ENSDORG00000011566	Eftud2	84	97.202	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	Taeniopygia_guttata
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.152	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	Takifugu_rubripes
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	86.680	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	Tetraodon_nigroviridis
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	93.724	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.724	Tupaia_belangeri
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.741	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.741	Tursiops_truncatus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.762	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.762	Ursus_americanus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.588	Ursus_maritimus
ENSDORG00000011566	Eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.588	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.588	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000011566	Eftud2	97	94.670	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.974	Xenopus_tropicalis
ENSDORG00000011566	Eftud2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.284	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	Xiphophorus_maculatus