EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000013050 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Xpo1
Alias: Crm1
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 48795 bases
Position: chrKN672409.1:1940399-1989193
Accession: 105990187
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000012267	CRM1_C	PF08767.11	1.7e-61	1	2
ENSDORP00000012267	CRM1_C	PF08767.11	1.7e-61	2	2
ENSDORP00000026936	CRM1_C	PF08767.11	1.7e-61	1	1
ENSDORP00000012267	Xpo1	PF08389.12	3.7e-41	1	1
ENSDORP00000026936	Xpo1	PF08389.12	3.7e-41	1	1
ENSDORP00000026936	IBN_N	PF03810.19	1.7e-12	1	1
ENSDORP00000012267	IBN_N	PF03810.19	1.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000013050	-	2751	XM_013022510	ENSDORP00000012267	916 (aa)	XP_012877964	UPI000BAD10FC
ENSDORT00000023541	-	2766	-	ENSDORP00000026936	921 (aa)	-	UPI000BAD0A69

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	87.008	ENSAPOG00000002354	xpo1a	90	87.008	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.505	ENSAPOG00000004984	-	92	93.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.309	ENSAMEG00000003460	XPO1	92	96.309	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.764	ENSACIG00000010259	xpo1a	90	89.764	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	93.570	ENSACIG00000010818	-	90	93.570	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.505	ENSAOCG00000010121	-	92	93.505	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.474	ENSAOCG00000018914	xpo1a	91	89.474	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000013050	Xpo1	89	89.786	ENSAPEG00000006583	xpo1a	90	89.786	Amphiprion_percula
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.505	ENSAPEG00000007038	-	92	93.505	Amphiprion_percula
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.505	ENSATEG00000008816	-	92	93.505	Anabas_testudineus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.026	ENSATEG00000020750	xpo1a	91	89.026	Anabas_testudineus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	ENSAPLG00000004008	XPO1	92	96.193	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.969	ENSACAG00000002501	XPO1	92	95.969	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSANAG00000020802	XPO1	92	95.857	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.895	ENSACLG00000015669	xpo1a	90	89.895	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.393	ENSACLG00000015192	-	92	93.393	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	90.339	ENSAMXG00000003069	xpo1a	90	90.339	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.729	ENSAMXG00000012704	xpo1b	92	93.729	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSBTAG00000013254	XPO1	92	96.417	Bos_taurus
ENSDORG00000013050	Xpo1	99	55.556	WBGene00002078	xpo-1	88	55.556	Caenorhabditis_elegans
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSCJAG00000008877	XPO1	92	95.857	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSCAFG00000003050	XPO1	92	96.417	Canis_familiaris
ENSDORG00000013050	Xpo1	92	95.966	ENSCAFG00020026910	XPO1	90	95.966	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSCHIG00000018132	XPO1	92	96.417	Capra_hircus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSTSYG00000004330	XPO1	92	96.417	Carlito_syrichta
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.625	ENSCPOG00000034053	XPO1	91	94.625	Cavia_porcellus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.667	ENSCCAG00000037445	XPO1	91	91.667	Cebus_capucinus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.638	ENSCATG00000032674	XPO1	90	95.144	Cercocebus_atys
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.081	ENSCLAG00000012953	XPO1	92	96.081	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSCSAG00000014606	XPO1	92	95.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000013050	Xpo1	81	99.595	ENSCHOG00000012088	XPO1	69	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	ENSCPBG00000026239	XPO1	92	96.193	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	80.022	ENSCING00000024562	-	92	80.022	Ciona_intestinalis
ENSDORG00000013050	Xpo1	99	79.596	ENSCSAVG00000005965	-	91	79.596	Ciona_savignyi
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	90.817	ENSCANG00000028883	XPO1	91	90.817	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.961	ENSCGRG00001000263	Xpo1	92	94.961	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.961	ENSCGRG00000001520	Xpo1	92	94.961	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	92.126	ENSCSEG00000001693	XPO1	90	92.126	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.281	ENSCVAG00000016788	-	92	93.281	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.354	ENSCVAG00000016558	xpo1a	91	88.354	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.841	ENSDARG00000063229	xpo1b	92	93.841	Danio_rerio
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.041	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.305	ENSDNOG00000005805	XPO1	92	96.305	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000013050	Xpo1	99	70.304	FBgn0020497	emb	93	70.304	Drosophila_melanogaster
ENSDORG00000013050	Xpo1	93	98.708	ENSETEG00000018045	XPO1	85	98.708	Echinops_telfairi
ENSDORG00000013050	Xpo1	88	76.051	ENSEBUG00000012580	-	88	85.930	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSEASG00005007223	XPO1	92	96.417	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSECAG00000024920	XPO1	91	99.219	Equus_caballus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	88	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000013050	Xpo1	85	89.286	ENSELUG00000014306	-	89	89.286	Esox_lucius
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	91.864	ENSELUG00000012707	xpo1a	90	91.864	Esox_lucius
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSFCAG00000002702	XPO1	92	96.417	Felis_catus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.969	ENSFALG00000010989	XPO1	92	95.969	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.177	ENSFDAG00000014716	XPO1	91	94.177	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.914	ENSFHEG00000002412	xpo1a	91	88.914	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	86.562	ENSGMOG00000019063	-	92	86.562	Gadus_morhua
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.698	ENSGMOG00000004441	xpo1a	93	89.698	Gadus_morhua
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	ENSGALG00000029476	XPO1	92	96.193	Gallus_gallus
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.633	ENSGAFG00000004408	xpo1a	90	89.633	Gambusia_affinis
ENSDORG00000013050	Xpo1	89	93.190	ENSGAFG00000003355	-	89	93.190	Gambusia_affinis
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.026	ENSGACG00000019736	xpo1a	91	89.026	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.169	ENSGACG00000002743	-	92	93.169	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	ENSGAGG00000017558	XPO1	92	96.193	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSGGOG00000034878	XPO1	92	95.857	Gorilla_gorilla
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ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.362	ENSHBUG00000007128	xpo1a	91	89.362	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.969	ENSHGLG00000003115	XPO1	92	95.969	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.969	ENSHGLG00100012227	XPO1	92	95.969	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	92.257	ENSHCOG00000006949	XPO1	90	92.257	Hippocampus_comes
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.153	ENSIPUG00000024394	XPO1	92	91.153	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.841	ENSIPUG00000012891	Xpo1	92	93.841	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	ENSSTOG00000016122	XPO1	92	96.193	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.081	ENSJJAG00000020468	Xpo1	92	96.081	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.690	ENSKMAG00000004830	xpo1a	91	88.690	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	92.833	ENSKMAG00000016218	-	92	92.833	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.505	ENSLBEG00000005740	-	92	93.505	Labrus_bergylta
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	87.008	ENSLBEG00000002104	xpo1a	90	87.008	Labrus_bergylta
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	71.524	ENSLACG00000018213	XPO1	91	71.524	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.289	ENSLOCG00000016095	xpo1b	91	94.289	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.305	ENSLAFG00000014553	XPO1	92	96.305	Loxodonta_africana
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSMFAG00000038679	XPO1	92	95.857	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSMMUG00000006941	XPO1	92	95.857	Macaca_mulatta
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	ENSMNEG00000030909	XPO1	92	95.857	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.645	ENSMLEG00000032004	XPO1	91	93.645	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.362	ENSMAMG00000023037	xpo1a	91	89.362	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.393	ENSMAMG00000010568	-	92	93.393	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.393	ENSMZEG00005018158	-	89	93.393	Maylandia_zebra
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.362	ENSMZEG00005005105	xpo1a	91	89.362	Maylandia_zebra
ENSDORG00000013050	Xpo1	63	93.613	ENSMGAG00000001496	-	87	93.613	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.961	ENSMAUG00000006769	Xpo1	92	94.961	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	ENSMICG00000027770	XPO1	92	96.417	Microcebus_murinus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.409	ENSMOCG00000012169	Xpo1	92	95.409	Microtus_ochrogaster
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ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.764	ENSMMOG00000018767	xpo1a	90	89.764	Mola_mola
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.745	ENSMODG00000002831	XPO1	92	95.745	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000013050	Xpo1	86	88.598	ENSMALG00000008617	xpo1a	90	88.598	Monopterus_albus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.169	ENSMALG00000007085	-	92	93.169	Monopterus_albus
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.521	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	92	95.521	Mus_caroli
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ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.305	ENSNGAG00000022158	Xpo1	92	96.305	Nannospalax_galili
ENSDORG00000013050	Xpo1	95	93.393	ENSNBRG00000012229	-	90	93.570	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.362	ENSNBRG00000003776	xpo1a	91	89.362	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000013050	Xpo1	100	92.442	ENSNLEG00000009680	XPO1	92	92.442	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000013050	Xpo1	74	100.000	ENSMEUG00000013277	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
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