EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000014246 (Gene tree)
Gene ID: 105993395
Gene Symbol: Aco1
Alias: -
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 50689 bases
Position: chrKN672441.1:1912044-1962732
Accession: 105993395
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000013397	Aconitase	PF00330.20	9.5e-182	1	1
ENSDORP00000013397	Aconitase_C	PF00694.19	2e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000014246	-	3499	XM_013026642	ENSDORP00000013397	889 (aa)	XP_012882096	A0A1S3FZW4

Gene Model

Click here to download ENSDORG00000014246's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDORG00000014246's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000014246	Aco1	99	57.580	ENSDORG00000014339	Ireb2	99	50.701

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSG00000122729	ACO1	100	93.926	Homo_sapiens
ENSDORG00000014246	Aco1	100	83.015	ENSAPOG00000008670	aco1	99	83.015	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.921	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	92.921	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.677	ENSACIG00000014377	aco1	99	82.677	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.790	ENSAOCG00000007699	aco1	99	82.790	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.902	ENSAPEG00000014370	aco1	99	82.902	Amphiprion_percula
ENSDORG00000014246	Aco1	99	83.896	ENSATEG00000000560	aco1	99	83.896	Anabas_testudineus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.387	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000014246	Aco1	97	86.860	ENSACAG00000001541	ACO1	99	86.860	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000014246	Aco1	99	92.455	ENSANAG00000003359	ACO1	99	92.455	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.677	ENSACLG00000007755	aco1	99	82.677	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.883	ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.883	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	93.926	Bos_taurus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.026	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	93.026	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.921	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	92.921	Canis_familiaris
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.026	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	93.026	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.813	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	93.813	Capra_hircus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.488	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	94.488	Carlito_syrichta
ENSDORG00000014246	Aco1	100	73.566	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	73.566	Cavia_aperea
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.013	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	92.013	Cavia_porcellus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.576	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	92.576	Cebus_capucinus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.588	ENSCATG00000045333	ACO1	100	93.588	Cercocebus_atys
ENSDORG00000014246	Aco1	100	91.789	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.701	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	93.701	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000014246	Aco1	90	74.888	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	74.888	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000014246	Aco1	99	88.401	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	88.401	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.701	ENSCANG00000014847	ACO1	100	93.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.038	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	94.038	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.913	ENSCGRG00000004877	-	100	92.913	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000014246	Aco1	99	78.692	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.692	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000014246	Aco1	99	76.663	ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.663	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	83.352	ENSDARG00000026376	aco1	99	83.352	Danio_rerio
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.476	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	93.476	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000014246	Aco1	86	71.958	ENSETEG00000012415	-	85	71.958	Echinops_telfairi
ENSDORG00000014246	Aco1	99	58.961	ENSEBUG00000015441	aco1	97	58.961	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.826	ENSEASG00005004602	ACO1	100	94.826	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.713	ENSECAG00000014846	ACO1	100	94.713	Equus_caballus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	81.665	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	81.665	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	81.777	ENSELUG00000016812	aco1	97	81.777	Esox_lucius
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.801	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	92.801	Felis_catus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.500	ENSFALG00000001167	ACO1	99	87.500	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.463	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	92.463	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.619	ENSFHEG00000005619	aco1	99	82.619	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	79.684	ENSGMOG00000005514	aco1	99	79.684	Gadus_morhua
ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.500	ENSGALG00000002162	ACO1	99	87.500	Gallus_gallus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	81.552	ENSGACG00000001637	aco1	99	81.552	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.838	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.838	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.701	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	93.701	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.790	ENSHBUG00000008952	aco1	99	82.790	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	93.363	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.363	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000014246	Aco1	99	79.820	ENSHCOG00000015881	aco1	99	79.820	Hippocampus_comes
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.227	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.227	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.713	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	94.713	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	93.363	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.095	ENSKMAG00000015759	aco1	99	82.095	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	78.989	ENSLBEG00000013866	aco1	99	78.989	Labrus_bergylta
ENSDORG00000014246	Aco1	75	71.765	ENSLACG00000000936	ACO1	99	72.107	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000014246	Aco1	99	84.893	ENSLOCG00000011082	aco1	99	84.893	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.238	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	Loxodonta_africana
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.813	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	93.813	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	93.926	Macaca_mulatta
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.701	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	93.701	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	93.926	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	83.915	ENSMAMG00000002915	aco1	99	83.915	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	79.395	ENSMZEG00005012733	aco1	99	79.395	Maylandia_zebra
ENSDORG00000014246	Aco1	99	71.875	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	71.875	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	93.363	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSMICG00000006540	ACO1	100	93.926	Microcebus_murinus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.476	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	93.476	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000014246	Aco1	100	81.890	ENSMMOG00000020282	aco1	99	81.890	Mola_mola
ENSDORG00000014246	Aco1	100	89.539	ENSMODG00000004463	ACO1	100	89.539	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000014246	Aco1	100	83.127	ENSMALG00000019764	aco1	99	83.127	Monopterus_albus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.251	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	93.251	Mus_caroli
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.251	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	93.251	Mus_musculus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.251	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.251	Mus_pahari
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.363	Mus_spretus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.251	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	93.251	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.013	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	92.013	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.038	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	94.038	Nannospalax_galili
ENSDORG00000014246	Aco1	100	65.101	ENSNBRG00000008973	aco1	99	65.101	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.588	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	93.588	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000014246	Aco1	90	82.460	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	82.460	Notamacropus_eugenii
ENSDORG00000014246	Aco1	100	88.864	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	88.864	Ochotona_princeps
ENSDORG00000014246	Aco1	100	88.526	ENSODEG00000015432	-	100	88.526	Octodon_degus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	90.889	ENSODEG00000001240	-	100	90.889	Octodon_degus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.565	ENSONIG00000019869	aco1	99	82.565	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000014246	Aco1	81	90.595	ENSOANG00000012132	ACO1	100	90.595	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	91.212	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	91.212	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	83.108	ENSORLG00000020656	aco1	99	83.108	Oryzias_latipes
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.770	ENSORLG00020010991	aco1	99	82.770	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.995	ENSORLG00015011785	aco1	99	82.995	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000014246	Aco1	99	81.264	ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.264	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.588	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	93.588	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.813	ENSOARG00000014707	ACO1	98	93.813	Ovis_aries
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	93.926	Pan_paniscus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.913	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	92.913	Panthera_pardus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.801	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	92.801	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	93.926	Pan_troglodytes
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.926	ENSPANG00000025270	ACO1	100	93.926	Papio_anubis
ENSDORG00000014246	Aco1	100	80.765	ENSPKIG00000023168	aco1	99	80.765	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.838	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	87.838	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.976	ENSPMGG00000020708	aco1	99	82.976	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.588	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	93.588	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000014246	Aco1	100	89.764	ENSPCIG00000029321	ACO1	100	90.134	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	81.808	ENSPFOG00000013405	aco1	98	81.907	Poecilia_formosa
ENSDORG00000014246	Aco1	90	83.083	ENSPLAG00000023422	aco1	97	83.083	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000014246	Aco1	90	83.000	ENSPMEG00000011800	aco1	98	83.000	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000014246	Aco1	99	81.623	ENSPREG00000021791	aco1	99	81.623	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.476	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	93.476	Pongo_abelii
ENSDORG00000014246	Aco1	78	94.340	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	94.340	Procavia_capensis
ENSDORG00000014246	Aco1	89	93.924	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	93.924	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000014246	Aco1	96	87.383	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	87.383	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.790	ENSPNYG00000009425	aco1	99	82.790	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000014246	Aco1	100	83.352	ENSPNAG00000017918	aco1	100	83.352	Pygocentrus_nattereri
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.138	ENSRNOG00000005849	Aco1	100	93.138	Rattus_norvegicus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.701	ENSRBIG00000034592	ACO1	100	93.701	Rhinopithecus_bieti
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.813	ENSRROG00000042672	ACO1	100	93.813	Rhinopithecus_roxellana
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.026	ENSSBOG00000026008	ACO1	100	93.026	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000014246	Aco1	100	89.888	ENSSHAG00000008924	ACO1	100	89.888	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.976	ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.976	Scleropages_formosus
ENSDORG00000014246	Aco1	75	84.030	ENSSMAG00000018908	aco1	80	84.030	Scophthalmus_maximus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	83.202	ENSSDUG00000002984	aco1	99	83.202	Seriola_dumerili
ENSDORG00000014246	Aco1	99	83.427	ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.427	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDORG00000014246	Aco1	96	90.654	ENSSARG00000008437	ACO1	100	90.654	Sorex_araneus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	86.697	ENSSPUG00000002916	ACO1	99	86.697	Sphenodon_punctatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	82.902	ENSSPAG00000019147	aco1	99	82.902	Stegastes_partitus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.376	ENSSSCG00000023807	ACO1	100	94.376	Sus_scrofa
ENSDORG00000014246	Aco1	99	86.937	ENSTGUG00000001505	ACO1	99	86.937	Taeniopygia_guttata
ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.393	ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.506	Takifugu_rubripes
ENSDORG00000014246	Aco1	99	79.571	ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	Tetraodon_nigroviridis
ENSDORG00000014246	Aco1	100	89.989	ENSTBEG00000012369	ACO1	100	89.989	Tupaia_belangeri
ENSDORG00000014246	Aco1	100	94.151	ENSTTRG00000016991	ACO1	99	94.151	Tursiops_truncatus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.138	ENSUAMG00000020699	ACO1	100	93.138	Ursus_americanus
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.138	ENSUMAG00000005807	ACO1	100	93.138	Ursus_maritimus
ENSDORG00000014246	Aco1	96	92.958	ENSVPAG00000009876	ACO1	100	92.958	Vicugna_pacos
ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.026	ENSVVUG00000021152	ACO1	91	93.026	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000014246	Aco1	99	84.270	ENSXETG00000009184	aco1	99	84.270	Xenopus_tropicalis
ENSDORG00000014246	Aco1	50	80.769	ENSXCOG00000005638	aco1	96	80.769	Xiphophorus_couchianus
ENSDORG00000014246	Aco1	99	81.849	ENSXMAG00000023603	aco1	99	81.849	Xiphophorus_maculatus