EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000016228 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Papolg
Alias: 9630006B20Rik
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28617 bases
Position: chrKN672409.1:1361063-1389679
Accession: 105990192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000015270	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.8e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000016230	-	1477	XM_013022522	ENSDORP00000015270	429 (aa)	XP_012877976	UPI000BAD09BD

Gene Model

Click here to download ENSDORG00000016228's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDORG00000016228's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDORG00000016228	Papolg	96	78.589	ENSDORG00000001140	Papolb	65	78.589

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSAPOG00000004798	papolg	62	86.247	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	98.826	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	58	98.826	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSACIG00000010546	papolg	63	86.247	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	ENSAOCG00000010254	papolg	52	86.014	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSAPEG00000006944	papolg	52	86.247	Amphiprion_percula
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.480	ENSATEG00000009007	papolg	67	86.730	Anabas_testudineus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	88.290	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	57	88.290	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSANAG00000024627	PAPOLG	60	99.068	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	ENSACLG00000015592	papolg	50	86.014	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.079	ENSAMXG00000004611	papolg	58	86.079	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	58	99.068	Bos_taurus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	58	99.068	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	53	99.301	Canis_familiaris
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	60	99.534	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000016228	Papolg	100	98.834	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	58	98.834	Capra_hircus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	58	99.301	Carlito_syrichta
ENSDORG00000016228	Papolg	89	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	99.301	Cavia_porcellus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	60	99.068	Cebus_capucinus
ENSDORG00000016228	Papolg	84	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	54	98.701	Cercocebus_atys
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	58	99.301	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	58	99.068	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000016228	Papolg	81	98.559	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	53	98.559	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000016228	Papolg	94	68.719	ENSCING00000024664	-	76	68.719	Ciona_intestinalis
ENSDORG00000016228	Papolg	94	68.719	ENSCSAVG00000009085	-	82	68.719	Ciona_savignyi
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSCANG00000038120	PAPOLG	60	99.068	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000016228	Papolg	98	98.810	ENSCGRG00001014951	Papolg	57	98.810	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000016228	Papolg	98	98.810	ENSCGRG00000005552	-	57	98.810	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSCSEG00000000771	papolg	61	86.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	ENSCVAG00000016602	papolg	75	85.545	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.311	ENSDARG00000012141	papolg	58	86.311	Danio_rerio
ENSDORG00000016228	Papolg	100	95.105	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	57	95.105	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	69.976	ENSETEG00000011815	PAPOLG	57	69.882	Echinops_telfairi
ENSDORG00000016228	Papolg	90	59.690	ENSEBUG00000005042	-	65	59.690	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000016228	Papolg	78	84.291	ENSEBUG00000004020	papolg	72	84.291	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSEASG00005002038	PAPOLG	58	99.534	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSECAG00000009859	PAPOLG	57	98.826	Equus_caballus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	82.751	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	58	82.751	Erinaceus_europaeus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.615	ENSELUG00000014497	papolg	52	85.615	Esox_lucius
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	58	99.534	Felis_catus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	80.000	ENSFALG00000011079	PAPOLG	56	80.000	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	56	99.534	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	ENSGMOG00000018772	papolg	64	85.315	Gadus_morhua
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	ENSGALG00000007853	PAPOLG	59	86.014	Gallus_gallus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.548	ENSGAFG00000003263	papolg	51	85.548	Gambusia_affinis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSGACG00000002718	papolg	58	86.247	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	60	99.068	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	ENSHBUG00000004882	papolg	50	86.223	Haplochromis_burtoni
ENSDORG00000016228	Papolg	99	98.826	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	58	98.826	Heterocephalus_glaber_female
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	58	99.534	Heterocephalus_glaber_male
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.781	ENSHCOG00000006782	papolg	52	85.781	Hippocampus_comes
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.311	ENSIPUG00000021642	papolg	60	86.247	Ictalurus_punctatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	58	99.534	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.301	Jaculus_jaculus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.814	ENSKMAG00000016439	papolg	60	85.814	Kryptolebias_marmoratus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	76.347	ENSLACG00000009543	PAPOLG	57	76.347	Latimeria_chalumnae
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.744	ENSLOCG00000016130	papolg	57	86.744	Lepisosteus_oculatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	98.144	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	58	99.301	Macaca_fascicularis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	58	99.301	Macaca_mulatta
ENSDORG00000016228	Papolg	100	84.332	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	57	84.332	Macaca_nemestrina
ENSDORG00000016228	Papolg	100	98.834	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	60	98.834	Mandrillus_leucophaeus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSMAMG00000010667	papolg	61	86.247	Mastacembelus_armatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	ENSMZEG00005018140	papolg	60	86.223	Maylandia_zebra
ENSDORG00000016228	Papolg	100	84.651	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	58	84.651	Meleagris_gallopavo
ENSDORG00000016228	Papolg	98	99.286	ENSMAUG00000009088	Papolg	57	99.286	Mesocricetus_auratus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSMICG00000010042	PAPOLG	60	99.068	Microcebus_murinus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.065	ENSMOCG00000006857	Papolg	58	99.065	Microtus_ochrogaster
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.548	ENSMMOG00000008020	papolg	67	82.609	Mola_mola
ENSDORG00000016228	Papolg	99	94.836	ENSMODG00000002160	PAPOLG	57	94.836	Monodelphis_domestica
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSMALG00000007012	papolg	51	86.247	Monopterus_albus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.533	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.533	Mus_caroli
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.533	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	Mus_musculus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.065	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	58	99.065	Mus_pahari
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.533	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	Mus_spretus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	52	99.534	Mustela_putorius_furo
ENSDORG00000016228	Papolg	99	97.653	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	58	97.653	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSNGAG00000001120	Papolg	58	99.534	Nannospalax_galili
ENSDORG00000016228	Papolg	99	72.535	ENSNBRG00000011943	papolg	54	72.535	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	58	99.534	Ochotona_princeps
ENSDORG00000016228	Papolg	99	94.601	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	75.116	ENSONIG00000002985	papolg	59	75.116	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	95.035	ENSOANG00000012403	PAPOLG	56	95.035	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	58	99.534	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	84.919	ENSORLG00000001577	papolg	52	84.919	Oryzias_latipes
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.151	ENSORLG00020002482	papolg	52	85.151	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.151	ENSORLG00015008836	papolg	52	85.151	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.082	ENSOMEG00000001406	papolg	51	85.082	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000016228	Papolg	100	98.834	ENSOARG00000001563	PAPOLG	53	98.834	Ovis_aries
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	60	99.068	Pan_paniscus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	58	99.534	Panthera_pardus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	58	99.301	Panthera_tigris_altaica
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	60	99.068	Pan_troglodytes
ENSDORG00000016228	Papolg	100	91.647	ENSPANG00000014543	PAPOLG	58	91.647	Papio_anubis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	83.991	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	66	81.280	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.151	ENSPKIG00000003313	papolg	60	85.151	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000016228	Papolg	98	91.943	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	56	91.943	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000016228	Papolg	98	99.286	ENSPEMG00000008960	-	57	99.286	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDORG00000016228	Papolg	97	65.340	ENSPMAG00000002961	papolg	58	65.340	Petromyzon_marinus
ENSDORG00000016228	Papolg	95	67.241	ENSPMAG00000004864	-	80	67.241	Petromyzon_marinus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	95.804	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	59	95.804	Phascolarctos_cinereus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	ENSPFOG00000012909	papolg	56	84.977	Poecilia_formosa
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	ENSPLAG00000018445	papolg	51	85.315	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	ENSPMEG00000003961	papolg	51	85.315	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.082	ENSPREG00000010358	papolg	51	85.082	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	58	99.068	Pongo_abelii
ENSDORG00000016228	Papolg	99	93.381	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	57	93.381	Procavia_capensis
ENSDORG00000016228	Papolg	90	99.485	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	59	99.485	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.065	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	58	99.065	Pteropus_vampyrus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	ENSPNYG00000006729	papolg	62	86.014	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSPNAG00000015521	papolg	58	86.247	Pygocentrus_nattereri
ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.299	ENSRNOG00000006261	Papolg	58	99.299	Rattus_norvegicus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	89.044	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	57	89.044	Rhinopithecus_bieti
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSRROG00000035954	PAPOLG	60	99.068	Rhinopithecus_roxellana
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	60	99.068	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000016228	Papolg	90	97.403	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	54	97.403	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000016228	Papolg	100	83.217	ENSSFOG00015002383	papolg	62	83.217	Scleropages_formosus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	77.986	ENSSFOG00015011874	papolg	60	77.986	Scleropages_formosus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	84.954	ENSSMAG00000015598	papolg	53	85.450	Scophthalmus_maximus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSSDUG00000000912	papolg	64	86.247	Seriola_dumerili
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSSLDG00000001217	papolg	59	80.930	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDORG00000016228	Papolg	100	90.443	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	59	90.443	Sphenodon_punctatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	ENSSPAG00000009004	papolg	63	86.247	Stegastes_partitus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	59	99.068	Sus_scrofa
ENSDORG00000016228	Papolg	97	81.401	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	77	81.401	Taeniopygia_guttata
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	ENSTRUG00000006410	papolg	60	85.315	Takifugu_rubripes
ENSDORG00000016228	Papolg	100	77.064	ENSTNIG00000017106	papolg	58	77.064	Tetraodon_nigroviridis
ENSDORG00000016228	Papolg	99	92.671	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	58	92.671	Tupaia_belangeri
ENSDORG00000016228	Papolg	99	98.832	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	58	98.832	Tursiops_truncatus
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	60	99.534	Ursus_americanus
ENSDORG00000016228	Papolg	98	99.525	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	52	99.525	Ursus_maritimus
ENSDORG00000016228	Papolg	99	93.381	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	58	93.381	Vicugna_pacos
ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	58	99.534	Vulpes_vulpes
ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.082	ENSXETG00000002208	papolg	57	85.082	Xenopus_tropicalis
ENSDORG00000016228	Papolg	98	85.308	ENSXCOG00000006611	papolg	62	85.308	Xiphophorus_couchianus
ENSDORG00000016228	Papolg	98	82.506	ENSXMAG00000007383	papolg	70	82.506	Xiphophorus_maculatus