EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDORG00000016689 (Gene tree)
Gene ID: 105987279
Gene Symbol: Pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Dipodomys_ordii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1874 bases
Position: chrKN672387.1:3318981-3320854
Accession: 105987279
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDORP00000015699	eRF1_2	PF03464.15	2.9e-37	1	1
ENSDORP00000015699	eRF1_3	PF03465.15	1.8e-26	1	1
ENSDORP00000015699	eRF1_1	PF03463.15	1.4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDORT00000016689	-	1597	XM_013018496	ENSDORP00000015699	385 (aa)	XP_012873950	A0A1S3FCG1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.403	ENSG00000152684	PELO	100	97.403	Homo_sapiens
ENSDORG00000016689	Pelo	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.519	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.519	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000016689	Pelo	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.182	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDORG00000016689	Pelo	97	78.016	ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	Amphilophus_citrinellus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.779	Amphiprion_ocellaris
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.779	Amphiprion_percula
ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	ENSATEG00000019550	pelo	100	82.597	Anabas_testudineus
ENSDORG00000016689	Pelo	77	84.564	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.564	Anas_platyrhynchos
ENSDORG00000016689	Pelo	98	89.894	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.610	Anolis_carolinensis
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSANAG00000014096	PELO	100	97.662	Aotus_nancymaae
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	Astatotilapia_calliptera
ENSDORG00000016689	Pelo	97	82.038	ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.347	Astyanax_mexicanus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.662	Bos_taurus
ENSDORG00000016689	Pelo	99	59.055	WBGene00011280	pelo-1	100	59.055	Caenorhabditis_elegans
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.662	Callithrix_jacchus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.442	Canis_lupus_dingo
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.403	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	Capra_hircus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.182	Carlito_syrichta
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.701	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	Cavia_porcellus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSCCAG00000035600	PELO	100	97.662	Cebus_capucinus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSCATG00000011829	PELO	100	97.922	Cercocebus_atys
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	Chinchilla_lanigera
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.922	Chlorocebus_sabaeus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.922	Choloepus_hoffmanni
ENSDORG00000016689	Pelo	98	93.351	ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	Chrysemys_picta_bellii
ENSDORG00000016689	Pelo	97	69.437	ENSCING00000001979	-	100	69.870	Ciona_intestinalis
ENSDORG00000016689	Pelo	100	70.649	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.649	Ciona_savignyi
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSCANG00000023382	PELO	100	97.922	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	95.844	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.143	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.039	ENSCSEG00000008807	pelo	100	81.039	Cynoglossus_semilaevis
ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.377	ENSCVAG00000016082	pelo	100	83.377	Cyprinodon_variegatus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.338	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.338	Danio_rerio
ENSDORG00000016689	Pelo	100	94.560	ENSDNOG00000036721	PELO	100	94.560	Dasypus_novemcinctus
ENSDORG00000016689	Pelo	96	67.385	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSDORG00000016689	Pelo	71	81.871	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	Eptatretus_burgeri
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSEASG00005013348	PELO	100	97.922	Equus_asinus_asinus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.299	ENSELUG00000023229	pelo	100	81.299	Esox_lucius
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.442	Felis_catus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	94.805	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	Ficedula_albicollis
ENSDORG00000016689	Pelo	74	97.535	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.535	Fukomys_damarensis
ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.558	ENSFHEG00000009769	pelo	100	81.558	Fundulus_heteroclitus
ENSDORG00000016689	Pelo	98	80.637	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.519	Gadus_morhua
ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.597	Gambusia_affinis
ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.299	ENSGACG00000007245	pelo	100	81.299	Gasterosteus_aculeatus
ENSDORG00000016689	Pelo	98	93.617	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	Gopherus_agassizii
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSGGOG00000012635	PELO	100	97.922	Gorilla_gorilla
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.779	Haplochromis_burtoni
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	78.442	ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	Hippocampus_comes
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSDORG00000016689	Pelo	99	80.990	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.990	Labrus_bergylta
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSLAFG00000020551	PELO	100	97.922	Loxodonta_africana
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSMMUG00000039101	PELO	100	97.922	Macaca_mulatta
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	79.740	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.740	Mola_mola
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.701	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	98.701	Mus_pahari
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	98.442	Mus_spretus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	95.065	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.065	Myotis_lucifugus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.922	Nannospalax_galili
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	Neolamprologus_brichardi
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSNLEG00000035970	PELO	100	97.922	Nomascus_leucogenys
ENSDORG00000016689	Pelo	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.701	ENSODEG00000017579	PELO	100	98.701	Octodon_degus
ENSDORG00000016689	Pelo	96	80.811	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.779	Oreochromis_niloticus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.662	Oryctolagus_cuniculus
ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.558	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes
ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.818	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hni
ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.078	ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	Oryzias_latipes_hsok
ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.597	Oryzias_melastigma
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.403	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.403	Otolemur_garnettii
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSOARG00000008324	PELO	99	97.662	Ovis_aries
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	Panthera_tigris_altaica
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSPANG00000010902	PELO	100	97.922	Papio_anubis
ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDORG00000016689	Pelo	98	93.617	ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	Pelodiscus_sinensis
ENSDORG00000016689	Pelo	67	78.682	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.377	ENSPFOG00000007277	pelo	100	83.377	Poecilia_formosa
ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.636	ENSPLAG00000020787	pelo	100	83.636	Poecilia_latipinna
ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.377	ENSPMEG00000016964	pelo	100	83.377	Poecilia_mexicana
ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.636	ENSPREG00000023071	pelo	100	83.636	Poecilia_reticulata
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	ENSPPYG00000015451	PELO	96	97.662	Pongo_abelii
ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.182	Propithecus_coquereli
ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.779	Pundamilia_nyererei
ENSDORG00000016689	Pelo	97	83.110	ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.818	Pygocentrus_nattereri
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ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSRBIG00000007299	PELO	100	97.922	Rhinopithecus_bieti
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	ENSRROG00000035507	PELO	100	97.922	Rhinopithecus_roxellana
ENSDORG00000016689	Pelo	98	35.325	YNL001W	-	98	35.325	Saccharomyces_cerevisiae
ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.403	ENSSBOG00000036140	PELO	100	97.403	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDORG00000016689	Pelo	63	95.082	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	Sarcophilus_harrisii
ENSDORG00000016689	Pelo	98	83.024	ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	Scleropages_formosus
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