EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000000422 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 131670 bases
Position: chrFYBX02009785.1:3153118-3284787
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000000203	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-66	3	12
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ENSEBUP00000000203	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-66	12	12
ENSEBUP00000000203	zf-met	PF12874.7	1.8e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000000492	-	2212	-	ENSEBUP00000000203	532 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000000422	-	69	46.552	ENSEBUG00000016857	-	68	46.552
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ENSEBUG00000000422	-	63	50.000	ENSEBUG00000014730	-	58	50.000
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ENSEBUG00000000422	-	99	60.513	ENSEBUG00000010878	-	85	60.513
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ENSEBUG00000000422	-	99	77.989	ENSEBUG00000013622	-	86	77.989
ENSEBUG00000000422	-	64	52.427	ENSEBUG00000013355	-	73	52.427
ENSEBUG00000000422	-	85	60.535	ENSEBUG00000011728	-	92	60.535
ENSEBUG00000000422	-	99	73.245	ENSEBUG00000015110	-	91	73.245
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ENSEBUG00000000422	-	72	50.000	ENSEBUG00000012704	-	81	50.000
ENSEBUG00000000422	-	69	50.599	ENSEBUG00000001121	-	85	50.599
ENSEBUG00000000422	-	69	48.684	ENSEBUG00000007375	-	84	48.684
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ENSEBUG00000000422	-	63	47.556	ENSEBUG00000016362	-	57	47.556
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