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Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000001239 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: smarca5
Alias: si:dkey-148b12.1
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 5
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 103885 bases
Position: chrFYBX02010571.1:2866768-2970652
Accession: ZDB-GENE-021125-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000001403	ResIII	PF04851.15	2.2e-10	1	1
ENSEBUP00000001403	DEAD	PF00270.29	3.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000001729	-	6213	-	ENSEBUP00000001403	1012 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000001239	smarca5	53	41.697	ENSEBUG00000005791	chd1l	68	41.697
ENSEBUG00000001239	smarca5	94	81.742	ENSEBUG00000014773	SMARCA5	95	81.742
ENSEBUG00000001239	smarca5	53	44.326	ENSEBUG00000014994	chd2	50	44.326

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSG00000102038	SMARCA1	93	80.899	Homo_sapiens
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.834	ENSAPOG00000016035	smarca5	98	83.278	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.020	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	93	80.020	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000001239	smarca5	88	83.408	ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.502	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.834	ENSAOCG00000015578	smarca5	97	80.834	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.834	ENSAPEG00000011117	smarca5	99	83.630	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.437	ENSATEG00000012894	smarca5	97	80.437	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.329	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	82.329	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	81.683	ENSACAG00000011376	SMARCA1	96	81.683	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	76.098	ENSANAG00000023098	SMARCA1	92	76.098	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.933	ENSACLG00000025356	smarca5	97	80.933	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	81.000	ENSAMXG00000005709	smarca5	97	80.476	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000001239	smarca5	91	83.100	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	84.485	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.128	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	90	81.674	Bos_taurus
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	62.717	WBGene00002169	isw-1	94	62.229	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	93	80.899	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	71.888	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	99	72.824	Canis_familiaris
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	93	80.899	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.001	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	92	81.001	Capra_hircus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.001	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	93	82.158	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.102	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	93	80.102	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	78.243	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	92	78.243	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.790	ENSCATG00000015921	SMARCA1	93	79.919	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.490	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	93	80.490	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	93	80.899	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	81.463	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	94	81.463	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	71.569	ENSCING00000004110	swi/snf	95	72.569	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	72.084	ENSCSAVG00000004620	-	99	74.719	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.001	ENSCANG00000007183	SMARCA1	93	81.001	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	79.053	ENSCGRG00001010776	Smarca1	94	79.053	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	79.286	ENSCGRG00000015301	Smarca1	95	79.916	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000001239	smarca5	94	83.596	ENSCSEG00000000328	smarca5	97	80.258	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.834	ENSCVAG00000008668	smarca5	99	83.175	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	80.382	ENSDARG00000052348	smarca5	96	80.382	Danio_rerio
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	81.182	ENSDARG00000012776	smarca1	99	80.174	Danio_rerio
ENSEBUG00000001239	smarca5	94	81.952	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	90	82.403	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.478	ENSDORG00000009270	Smarca1	90	82.189	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000001239	smarca5	94	73.854	FBgn0011604	Iswi	93	73.832	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000001239	smarca5	81	80.357	ENSETEG00000017426	SMARCA1	83	80.357	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	76.954	ENSEASG00005008218	SMARCA1	99	77.563	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.001	ENSECAG00000012106	SMARCA1	92	81.001	Equus_caballus
ENSEBUG00000001239	smarca5	79	80.464	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	80	80.464	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000001239	smarca5	100	79.608	ENSELUG00000010515	smarca1	99	79.608	Esox_lucius
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.797	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	93	80.797	Felis_catus
ENSEBUG00000001239	smarca5	90	83.790	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	83.790	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.473	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	93	81.144	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.834	ENSFHEG00000007687	smarca5	96	80.834	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	81.590	ENSGALG00000008431	SMARCA1	98	81.590	Gallus_gallus
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.735	ENSGAFG00000017731	smarca5	97	80.952	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.407	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	100	82.407	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000001239	smarca5	70	88.000	ENSGGOG00000012841	-	92	88.000	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.592	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	93	80.592	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.102	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	98	80.102	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.837	ENSHCOG00000005458	smarca5	97	80.872	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	82.010	ENSIPUG00000016905	Smarca1	99	82.702	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	97	81.947	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	98	81.947	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.490	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	95	80.287	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.478	ENSJJAG00000002593	Smarca1	93	80.183	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.939	ENSKMAG00000003777	smarca5	97	81.033	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000001239	smarca5	94	81.217	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	99	84.264	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.536	ENSLBEG00000018112	smarca5	97	80.437	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	81.503	ENSLACG00000016697	SMARCA1	99	81.503	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	82.010	ENSLOCG00000014591	smarca1	97	82.010	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.406	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	98	80.406	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	93	82.334	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.790	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	97	82.062	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.790	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	93	82.334	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	93	80.899	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.702	ENSMAMG00000014294	smarca5	94	82.702	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.933	ENSMZEG00005009369	smarca5	97	80.933	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	80.594	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	99	80.594	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.538	ENSMAUG00000008133	Smarca1	90	80.614	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.001	ENSMICG00000015768	SMARCA1	93	81.001	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	79.472	ENSMOCG00000009464	Smarca1	93	79.472	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000001239	smarca5	97	80.163	ENSMMOG00000005547	smarca5	99	80.163	Mola_mola
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.942	ENSMODG00000013187	-	97	81.836	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.528	ENSMALG00000002081	smarca5	99	80.704	Monopterus_albus
ENSEBUG00000001239	smarca5	97	79.635	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	93	79.635	Mus_caroli
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	79.776	ENSMUSG00000031099	Smarca1	93	79.776	Mus_musculus
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.849	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	91	80.785	Mus_pahari
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	79.776	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	93	79.776	Mus_spretus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	79.818	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	88	79.818	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	78.953	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	93	78.550	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.849	ENSNGAG00000006492	Smarca1	90	80.932	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.600	ENSNBRG00000004463	smarca5	98	82.600	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	81.017	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	93	81.711	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000001239	smarca5	92	74.211	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	99	74.211	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.678	ENSODEG00000012163	SMARCA1	90	81.356	Octodon_degus
ENSEBUG00000001239	smarca5	99	80.933	ENSONIG00000009993	smarca5	97	80.933	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.922	ENSOANG00000002862	SMARCA1	100	82.922	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.797	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	93	80.797	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.939	ENSORLG00000021998	smarca5	96	81.033	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.939	ENSORLG00020017679	smarca5	97	81.033	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.939	ENSORLG00015017210	smarca5	97	81.132	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.939	ENSOMEG00000000086	smarca5	97	81.132	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.884	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	81.568	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	81.001	ENSOARG00000014638	SMARCA1	99	81.001	Ovis_aries
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	93	80.899	Pan_paniscus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.797	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	93	80.797	Panthera_pardus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	78.916	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	96	78.916	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	93	79.919	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	80.899	ENSPANG00000003871	SMARCA1	93	80.899	Papio_anubis
ENSEBUG00000001239	smarca5	93	82.577	ENSPKIG00000013411	smarca1	96	82.577	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	80.594	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	100	82.510	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.849	ENSPEMG00000017503	Smarca1	90	80.932	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000001239	smarca5	98	81.864	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	98	81.864	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.734	ENSPFOG00000007649	smarca5	97	81.052	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.734	ENSPLAG00000003363	smarca5	97	81.052	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.631	ENSPMEG00000019849	smarca5	97	80.952	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.631	ENSPREG00000023250	smarca5	97	80.952	Poecilia_reticulata
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