EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000001534 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 71442 bases
Position: chrFYBX02010570.1:2892530-2963971
Accession: ZDB-GENE-040426-1578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000001871	RRM_1	PF00076.22	4.4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000002211	-	3412	-	ENSEBUP00000001871	495 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.392	ENSG00000102241	HTATSF1	99	46.212	Homo_sapiens
ENSEBUG00000001534	htatsf1	88	52.403	ENSAPOG00000009823	htatsf1	94	52.644	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	84	53.349	ENSACIG00000020459	htatsf1	91	53.596	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	55.639	ENSAOCG00000020994	htatsf1	90	53.901	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	55.639	ENSAPEG00000016432	htatsf1	89	53.682	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000001534	htatsf1	78	56.298	ENSATEG00000008903	htatsf1	85	56.298	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	74	56.216	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	85	55.200	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000001534	htatsf1	74	56.131	ENSACAG00000009346	HTATSF1	87	55.616	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.245	ENSACLG00000008096	htatsf1	90	53.738	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	56.522	ENSAMXG00000008387	htatsf1	83	56.608	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	51.244	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	49.758	Bos_taurus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	72	38.462	WBGene00022025	Y65B4A.1	77	37.666	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	50.653	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	51.621	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.881	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	52	50.000	Canis_familiaris
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.881	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	51	50.000	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	50.864	ENSCCAG00000025329	-	57	49.644	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	50.914	ENSCCAG00000022701	-	50	51.122	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	49.873	ENSCATG00000029963	HTATSF1	52	48.730	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	50.864	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	50.617	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.653	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	52	48.730	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	55.138	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	93	52.736	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	41.579	ENSCING00000005914	-	84	40.526	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	77	38.191	ENSCSAVG00000000371	-	84	37.437	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.510	ENSCANG00000028495	HTATSF1	52	48.730	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	55.303	ENSCVAG00000014070	htatsf1	85	55.303	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	57.039	ENSDARG00000056649	htatsf1	88	54.676	Danio_rerio
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	38.770	FBgn0037081	barc	64	39.633	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.764	ENSEASG00005003440	HTATSF1	50	49.528	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	50.000	ENSECAG00000009156	HTATSF1	50	49.528	Equus_caballus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	50.467	ENSELUG00000005486	htatsf1	91	48.447	Esox_lucius
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	50.000	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	52	49.762	Felis_catus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	77	55.673	ENSFALG00000003728	HTATSF1	85	53.580	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	88	52.584	ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	52.584	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	54.400	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	54.133	Gadus_morhua
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	55.172	ENSGALG00000006410	HTATSF1	86	52.567	Gallus_gallus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.012	ENSGAFG00000003041	htatsf1	88	53.753	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	84	53.302	ENSGACG00000020459	htatsf1	92	52.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.392	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	52	49.292	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.245	ENSHBUG00000004392	htatsf1	90	53.972	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000001534	htatsf1	78	54.872	ENSHCOG00000009056	htatsf1	87	55.128	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000001534	htatsf1	86	54.651	ENSIPUG00000017828	htatsf1	88	54.884	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.653	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	50.483	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	86	52.425	ENSKMAG00000007622	htatsf1	94	52.425	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	53.713	ENSLBEG00000001154	htatsf1	86	51.675	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000001534	htatsf1	88	50.113	ENSLACG00000015989	HTATSF1	94	50.113	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000001534	htatsf1	78	40.150	ENSLOCG00000015118	htatsf1	80	39.454	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.770	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	58	49.539	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	49.873	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	52	48.730	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	49.873	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	52	48.730	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.653	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	57	48.730	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	49.873	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	52	48.730	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	53.676	ENSMAMG00000021225	htatsf1	90	53.511	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.245	ENSMZEG00005000485	htatsf1	90	53.738	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	55.091	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	84	54.331	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	48.958	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	49.502	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	49.608	ENSMICG00000009348	HTATSF1	50	50.370	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	53.041	ENSMMOG00000011013	htatsf1	90	53.041	Mola_mola
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	55.076	ENSMODG00000014087	-	82	55.076	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000001534	htatsf1	52	47.940	ENSMODG00000000199	-	100	46.816	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	55.529	ENSMALG00000019977	htatsf1	90	55.529	Monopterus_albus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	51.688	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	51.741	Mus_caroli
ENSEBUG00000001534	htatsf1	84	48.821	ENSMLUG00000009234	-	54	48.585	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.521	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	50.246	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.245	ENSNBRG00000003818	htatsf1	90	53.774	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.789	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	52	50.119	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	51.202	ENSMEUG00000004133	-	89	52.513	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.156	ENSONIG00000008638	htatsf1	88	54.676	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	55.764	ENSOANG00000011674	-	81	56.145	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.531	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	51	49.406	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	52.798	ENSORLG00000002356	htatsf1	88	52.798	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	52.555	ENSORLG00020017818	htatsf1	87	51.422	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	51.942	ENSORLG00015002268	htatsf1	98	48.786	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000001534	htatsf1	92	48.491	ENSOMEG00000007564	htatsf1	88	52.019	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000001534	htatsf1	84	49.057	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	52	48.712	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.392	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	52	49.292	Pan_paniscus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.392	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	52	49.292	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.611	ENSPKIG00000024852	htatsf1	85	55.611	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000001534	htatsf1	59	60.274	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	79	61.592	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	53.828	ENSPMGG00000006172	htatsf1	89	53.828	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	85	52.558	ENSPCIG00000030173	-	92	51.860	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.043	ENSPCIG00000018896	-	88	48.325	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.676	ENSPFOG00000007871	htatsf1	88	54.676	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.676	ENSPLAG00000007532	htatsf1	90	55.257	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.474	ENSPMEG00000000352	htatsf1	90	55.231	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.206	ENSPREG00000007811	htatsf1	90	53.995	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	50.239	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	52	49.644	Pongo_abelii
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	46.172	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	54	45.933	Procavia_capensis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.409	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	52	48.700	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.531	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	57	49.061	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.245	ENSPNYG00000016693	htatsf1	90	53.738	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000001534	htatsf1	84	53.271	ENSPNAG00000006166	htatsf1	90	53.271	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.510	ENSRROG00000021939	HTATSF1	52	48.499	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	49.630	ENSSBOG00000017914	-	50	49.386	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	50.653	ENSSBOG00000027186	-	50	51.621	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	52.029	ENSSHAG00000018908	-	86	51.807	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	54.177	ENSSHAG00000006440	-	96	53.418	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	55.076	ENSSFOG00015012002	htatsf1	91	51.577	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	57.248	ENSSMAG00000002970	htatsf1	87	56.459	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	77	55.118	ENSSDUG00000020002	htatsf1	87	54.642	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.446	ENSSLDG00000016880	htatsf1	87	55.446	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	82	52.078	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	85	51.471	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	56.853	ENSSPAG00000000732	htatsf1	89	54.545	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	49.231	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	62	46.725	Sus_scrofa
ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	54.830	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	95	49.217	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000001534	htatsf1	78	55.385	ENSTRUG00000013383	htatsf1	86	54.040	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000001534	htatsf1	78	53.980	ENSTNIG00000016140	htatsf1	86	55.471	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	67	53.869	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	52	53.571	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	48.605	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	51	48.700	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000001534	htatsf1	89	53.034	ENSXETG00000019749	htatsf1	79	52.370	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.257	ENSXCOG00000006912	htatsf1	90	54.722	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.501	ENSXMAG00000000490	htatsf1	89	54.768	Xiphophorus_maculatus