EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000001569 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1393 bases
Position: chrFYBX02010130.1:217142-218534
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000001926	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-59	10	10
ENSEBUP00000001926	zf-met	PF12874.7	5.2e-20	1	4
ENSEBUP00000001926	zf-met	PF12874.7	5.2e-20	2	4
ENSEBUP00000001926	zf-met	PF12874.7	5.2e-20	3	4
ENSEBUP00000001926	zf-met	PF12874.7	5.2e-20	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000002269	-	1256	-	ENSEBUP00000001926	403 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000001569	-	81	50.160	ENSEBUG00000012748	-	69	48.512
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ENSEBUG00000001569	-	86	57.471	ENSEBUG00000015661	-	72	57.471
ENSEBUG00000001569	-	99	69.327	ENSEBUG00000013622	-	75	69.327
ENSEBUG00000001569	-	88	55.859	ENSEBUG00000015403	-	95	55.859
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ENSEBUG00000001569	-	84	47.500	ENSEBUG00000001329	-	89	47.500
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