EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000001698 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 113131 bases
Position: chrFYBX02009991.1:1648399-1761529
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000002140	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	1	4
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ENSEBUP00000002140	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	3	4
ENSEBUP00000002140	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	4	4
ENSEBUP00000002151	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	1	4
ENSEBUP00000002151	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	2	4
ENSEBUP00000002151	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	3	4
ENSEBUP00000002151	zf-C2H2	PF00096.26	2e-24	4	4
ENSEBUP00000002140	zf-met	PF12874.7	7.2e-06	1	1
ENSEBUP00000002151	zf-met	PF12874.7	7.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSEBUT00000002498	-	2965	-	ENSEBUP00000002151	275 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000001698	-	91	49.751	ENSEBUG00000008229	-	59	49.751
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ENSEBUG00000001698	-	96	42.647	ENSEBUG00000002032	-	80	42.647
ENSEBUG00000001698	-	93	44.393	ENSEBUG00000012775	-	70	44.393
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Orthologs

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