EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000001895 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36706 bases
Position: chrFYBX02009999.1:329091-365796
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000002444	IBN_N	PF03810.19	7.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000002798	-	5586	-	ENSEBUP00000002444	838 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSG00000083312	TNPO1	100	84.974	Homo_sapiens
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	ENSAPOG00000003453	tnpo1	94	85.357	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.316	ENSAMEG00000007147	TNPO1	94	84.316	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	84.116	ENSACIG00000003711	tnpo1	93	84.392	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	ENSAOCG00000008154	tnpo1	94	85.663	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	ENSAPEG00000001112	tnpo1	94	85.476	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSATEG00000010408	tnpo1	94	85.238	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	83.215	ENSAPLG00000009619	-	94	83.215	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	ENSACAG00000009599	TNPO1	94	85.238	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	54.000	ENSANAG00000027118	-	95	57.059	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	79.236	ENSANAG00000025351	-	94	79.236	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	ENSANAG00000022453	-	94	84.762	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	82.976	ENSACLG00000027223	tnpo1	94	83.214	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	86.223	ENSAMXG00000009842	tnpo1	94	86.223	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	ENSBTAG00000007979	TNPO1	94	85.119	Bos_taurus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	ENSCJAG00000016409	TNPO1	94	84.762	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.036	ENSCAFG00000008081	TNPO1	98	84.917	Canis_familiaris
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	82.976	ENSCAFG00020017397	TNPO1	94	82.857	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSCHIG00000023462	TNPO1	94	85.119	Capra_hircus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.286	ENSTSYG00000001871	TNPO1	96	84.167	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.762	ENSCCAG00000026472	TNPO1	94	84.643	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSCATG00000043792	TNPO1	94	85.119	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	ENSCLAG00000016191	TNPO1	94	84.762	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSCSAG00000015616	TNPO1	94	85.119	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	94	73.638	ENSCHOG00000001746	TNPO1	93	74.018	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	ENSCPBG00000000260	TNPO1	89	85.357	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	73.191	ENSCSAVG00000010981	-	96	72.957	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSCANG00000004353	TNPO1	94	85.119	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	94	85.119	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	98	85.119	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.762	ENSCSEG00000012674	tnpo1	94	84.762	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	86.071	ENSCVAG00000001010	tnpo1	94	85.952	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.291	ENSDARG00000035390	tnpo1	94	85.256	Danio_rerio
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	80.071	ENSDNOG00000006647	TNPO1	94	80.308	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	99	85.301	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	85.163	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000001895	tnpo1	99	58.072	FBgn0035693	CG8219	96	58.072	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000001895	tnpo1	85	85.768	ENSETEG00000017805	TNPO1	83	85.768	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSEASG00005018055	TNPO1	94	85.119	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSECAG00000024424	TNPO1	94	85.119	Equus_caballus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	78.326	ENSELUG00000002821	tnpo1	94	78.326	Esox_lucius
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSFCAG00000013181	TNPO1	94	85.119	Felis_catus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	ENSFALG00000010292	TNPO1	94	85.357	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	ENSFDAG00000013345	TNPO1	94	84.762	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	86.088	ENSFHEG00000019234	tnpo1	94	86.088	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.460	ENSGMOG00000000347	tnpo1	94	84.460	Gadus_morhua
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.643	ENSGALG00000015014	TNPO1	94	84.881	Gallus_gallus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.392	ENSGAFG00000000943	tnpo1	94	85.154	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSGACG00000015841	tnpo1	94	85.357	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	ENSGAGG00000013419	TNPO1	94	85.238	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	70.428	ENSGGOG00000022535	-	93	70.190	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSGGOG00000026800	TNPO1	94	85.119	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	ENSHBUG00000008068	tnpo1	94	85.119	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	ENSHGLG00000000970	-	94	84.762	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	67.184	ENSHGLG00100000963	-	96	66.945	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	ENSHGLG00100017090	-	98	84.762	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	91	85.119	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	ENSKMAG00000018195	tnpo1	94	85.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	90	82.129	ENSLBEG00000009521	tnpo1	90	82.129	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	80.450	ENSLACG00000012199	TNPO1	98	80.450	Latimeria_chalumnae
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ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSMNEG00000044581	TNPO1	94	85.119	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSMLEG00000030740	TNPO1	94	85.119	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.595	ENSMAMG00000001357	tnpo1	94	85.595	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.405	ENSMZEG00005004913	tnpo1	94	84.643	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	94	85.119	Mesocricetus_auratus
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ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	93	85.119	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	83.884	ENSMMOG00000005551	tnpo1	93	84.298	Mola_mola
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ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.405	ENSMALG00000009782	tnpo1	94	84.405	Monopterus_albus
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ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	94	85.469	Mus_pahari
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	94	85.469	Mus_spretus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSMPUG00000014387	TNPO1	94	85.119	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.834	ENSMLUG00000016317	TNPO1	98	84.716	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	94	85.238	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	83.978	ENSNBRG00000009998	tnpo1	93	84.254	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSNLEG00000004572	TNPO1	94	85.119	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000001895	tnpo1	90	80.297	ENSOPRG00000012390	TNPO1	84	80.297	Ochotona_princeps
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ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.397	ENSONIG00000011151	tnpo1	94	84.397	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	96	85.714	ENSOANG00000015785	TNPO1	98	85.590	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	79.738	ENSOCUG00000013318	TNPO1	98	79.738	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	83.978	ENSORLG00000003182	tnpo1	93	84.254	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.762	ENSORLG00020011559	tnpo1	95	85.000	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.595	ENSORLG00015019113	tnpo1	95	85.357	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.714	ENSOMEG00000014567	tnpo1	95	85.595	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSOGAG00000000808	TNPO1	94	85.119	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	ENSOARG00000005038	TNPO1	79	85.119	Ovis_aries
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPPAG00000042518	TNPO1	94	85.119	Pan_paniscus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPPRG00000022336	TNPO1	94	85.119	Panthera_pardus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPTIG00000018839	TNPO1	94	85.119	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPTRG00000016972	TNPO1	94	85.119	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000001895	tnpo1	94	74.667	ENSPTRG00000047731	-	94	74.370	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPANG00000006074	TNPO1	94	85.119	Papio_anubis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	81.429	ENSPKIG00000019795	tnpo1	94	81.429	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPSIG00000014366	TNPO1	94	85.238	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	83.790	ENSPMGG00000017014	tnpo1	94	83.790	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	98	85.119	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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