EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000002185 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1739 bases
Position: chrFYBX02010353.1:691561-693299
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	1	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	2	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	3	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	4	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	5	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	6	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	7	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	8	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	9	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	10	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	11	12
ENSEBUP00000002918	zf-C2H2	PF00096.26	1e-74	12	12
ENSEBUP00000002918	zf-met	PF12874.7	7.1e-23	1	3
ENSEBUP00000002918	zf-met	PF12874.7	7.1e-23	2	3
ENSEBUP00000002918	zf-met	PF12874.7	7.1e-23	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000003281	-	1739	-	ENSEBUP00000002918	442 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000002185	-	96	70.000	ENSEBUG00000011435	-	93	70.000
ENSEBUG00000002185	-	83	52.792	ENSEBUG00000013874	-	50	52.792
ENSEBUG00000002185	-	88	50.000	ENSEBUG00000014648	-	73	49.590
ENSEBUG00000002185	-	88	50.997	ENSEBUG00000006212	-	90	50.997
ENSEBUG00000002185	-	85	50.901	ENSEBUG00000007740	-	89	50.901
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ENSEBUG00000002185	-	95	49.367	ENSEBUG00000012053	-	84	49.367
ENSEBUG00000002185	-	96	70.760	ENSEBUG00000016688	-	70	70.760
ENSEBUG00000002185	-	89	50.968	ENSEBUG00000008039	-	74	50.968
ENSEBUG00000002185	-	87	47.159	ENSEBUG00000016878	-	93	47.159
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ENSEBUG00000002185	-	82	35.227	ENSEBUG00000002606	-	63	35.227
ENSEBUG00000002185	-	88	46.503	ENSEBUG00000003555	-	74	46.503
ENSEBUG00000002185	-	96	68.161	ENSEBUG00000002371	-	85	68.161
ENSEBUG00000002185	-	96	67.751	ENSEBUG00000006702	-	82	67.751
ENSEBUG00000002185	-	97	67.656	ENSEBUG00000000704	-	94	65.909
ENSEBUG00000002185	-	79	43.750	ENSEBUG00000002290	-	54	43.750
ENSEBUG00000002185	-	96	59.799	ENSEBUG00000012775	-	79	60.302
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ENSEBUG00000002185	-	98	67.284	ENSEBUG00000005816	-	75	67.284
ENSEBUG00000002185	-	87	61.570	ENSEBUG00000001329	-	94	61.570
ENSEBUG00000002185	-	96	69.345	ENSEBUG00000013157	-	93	69.345
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ENSEBUG00000002185	-	82	50.649	ENSEBUG00000003991	-	76	50.649
ENSEBUG00000002185	-	84	44.898	ENSEBUG00000013221	-	80	44.898
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