EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000002249 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: si:dkey-34f16.5
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1880 bases
Position: chrFYBX02000094.1:542622-544501
Accession: ZDB-GENE-081110-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000003038	PTH2	PF01981.16	4.7e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000003401	-	366	-	ENSEBUP00000003038	121 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000002249's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000002249's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSG00000184924	PTRHD1	83	60.345	Homo_sapiens
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	91	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	61.207	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	60.000	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	91	60.000	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	91	60.000	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.739	ENSATEG00000019199	ptrhd1	91	61.739	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSANAG00000019089	PTRHD1	83	60.345	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSACLG00000000814	ptrhd1	91	60.000	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.261	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	58.261	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.621	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	83	58.621	Bos_taurus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	47.863	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	45.161	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	59.483	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	83	60.345	Canis_familiaris
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.621	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	83	58.621	Capra_hircus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	83	59.483	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	83	60.345	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	83	60.345	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	ENSCATG00000033690	PTRHD1	83	60.870	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	80	59.483	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	83	60.345	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	50.435	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	84	50.435	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	98	57.983	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	84	57.983	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	50.427	ENSCING00000019647	-	99	50.427	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSCANG00000034444	PTRHD1	83	60.345	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	55	59.483	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	83	59.483	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	60.169	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	93	60.169	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.974	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	93	58.974	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	57.391	ENSDARG00000016122	ptrhd1	91	57.391	Danio_rerio
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	77	61.207	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	83	59.483	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	54.701	FBgn0038446	CG14903	98	54.701	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	52.174	ENSETEG00000009379	-	85	52.174	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	39.655	ENSEASG00005001302	-	82	39.655	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	40.517	ENSECAG00000005314	-	79	40.517	Equus_caballus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSECAG00000017730	PTRHD1	83	60.345	Equus_caballus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	83	59.483	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.261	ENSELUG00000003837	ptrhd1	91	58.261	Esox_lucius
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	83	61.207	Felis_catus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.621	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	83	58.621	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.130	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	91	59.130	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	55.652	ENSGALG00000016610	PTRHD1	84	55.085	Gallus_gallus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.120	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	93	58.120	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSGACG00000006743	ptrhd1	91	60.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	98	58.824	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	94	58.824	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	92	59.483	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.130	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	91	59.130	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	83	60.345	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSHGLG00100004341	-	85	59.483	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	83	59.483	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.739	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	91	61.739	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	98	57.983	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	100	57.983	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	83	60.345	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	84	60.345	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	93	60.714	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	60.714	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	91	60.870	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	88	56.075	ENSLACG00000018052	PTRHD1	94	57.627	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.130	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	90	59.130	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	62.069	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	83	62.069	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	83	60.345	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	83	60.345	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	83	60.345	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.261	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	83	58.261	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	57.391	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	91	57.391	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	91	60.000	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	83	60.345	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSMICG00000001578	PTRHD1	83	59.483	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	61.207	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.974	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	93	58.974	Mola_mola
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	100	57.377	ENSMODG00000015895	PTRHD1	90	57.377	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.261	ENSMALG00000003471	ptrhd1	91	58.261	Monopterus_albus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	83	60.345	Mus_caroli
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	60.345	Mus_musculus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	83	60.345	Mus_spretus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	62.069	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	83	62.069	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	57.759	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	83	57.759	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	83	60.345	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	91	60.000	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	60.345	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	83	60.345	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSODEG00000007805	PTRHD1	80	59.483	Octodon_degus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSONIG00000015722	ptrhd1	85	60.000	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	83	60.345	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	60.345	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	60.345	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	60.345	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	91	60.000	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	55.172	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	83	55.172	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.621	ENSOARG00000018052	PTRHD1	83	58.621	Ovis_aries
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	83	60.345	Pan_paniscus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	83	61.207	Panthera_pardus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	83	61.207	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	83	60.345	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSPANG00000006781	PTRHD1	83	59.483	Papio_anubis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	98	58.475	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	80	58.475	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	93	59.829	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	91	64.545	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	94	65.546	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	60.345	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.120	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	83	58.120	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.120	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	93	58.120	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	57.265	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	93	57.265	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	57.265	ENSPREG00000017624	ptrhd1	93	57.265	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.621	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	83	58.621	Pongo_abelii
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	83	59.483	Procavia_capensis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	83	59.483	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.621	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	83	58.621	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.000	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	91	60.000	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.130	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	59.130	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	83	61.207	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	83	60.345	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	ENSRROG00000029627	PTRHD1	83	60.345	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	61.207	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	83	61.207	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	59.483	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.870	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	92	59.829	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	60.684	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	79	60.684	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	60.684	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	93	60.684	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	87	59.483	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	60.870	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	80	48.454	ENSSSCG00000040441	-	78	48.454	Sus_scrofa
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	98	55.833	ENSTGUG00000015169	-	88	55.833	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	56.410	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	93	56.410	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	61.538	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	93	61.538	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	53.448	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	83	53.448	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	62.069	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	83	62.069	Ursus_americanus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	59.483	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	83	59.483	Vicugna_pacos
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	87	61.905	ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.609	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.120	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	93	58.120	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	58.120	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	93	58.120	Xiphophorus_maculatus