EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000002586 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15173 bases
Position: chrFYBX02009971.1:1784801-1799973
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000003593	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-24	3	4
ENSEBUP00000003593	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-24	4	4
ENSEBUP00000003584	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-23	1	4
ENSEBUP00000003584	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-23	2	4
ENSEBUP00000003584	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-23	3	4
ENSEBUP00000003584	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-23	4	4
ENSEBUP00000003572	zf-C2H2	PF00096.26	4.9e-23	1	4
ENSEBUP00000003572	zf-C2H2	PF00096.26	4.9e-23	2	4
ENSEBUP00000003572	zf-C2H2	PF00096.26	4.9e-23	3	4
ENSEBUP00000003572	zf-C2H2	PF00096.26	4.9e-23	4	4
ENSEBUP00000003593	zf-met	PF12874.7	2.3e-10	1	3
ENSEBUP00000003593	zf-met	PF12874.7	2.3e-10	2	3
ENSEBUP00000003593	zf-met	PF12874.7	2.3e-10	3	3
ENSEBUP00000003584	zf-met	PF12874.7	7.7e-10	1	3
ENSEBUP00000003584	zf-met	PF12874.7	7.7e-10	2	3
ENSEBUP00000003584	zf-met	PF12874.7	7.7e-10	3	3
ENSEBUP00000003572	zf-met	PF12874.7	2.6e-09	1	3
ENSEBUP00000003572	zf-met	PF12874.7	2.6e-09	2	3
ENSEBUP00000003572	zf-met	PF12874.7	2.6e-09	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000003962	-	5490	-	ENSEBUP00000003584	404 (aa)	-	-
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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000002586	-	64	46.199	ENSEBUG00000017017	-	69	45.963
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ENSEBUG00000002586	-	82	46.316	ENSEBUG00000015110	-	98	48.066
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