EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000002602 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 44804 bases
Position: chrFYBX02009918.1:4354924-4399727
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000003679	SRP54	PF00448.22	4.9e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000004063	-	1284	-	ENSEBUP00000003679	427 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000002602's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000002602's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSG00000182934	SRPRA	53	80.923	Homo_sapiens
ENSEBUG00000002602	srpra	94	67.626	ENSAPOG00000017588	srpra	67	70.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSAMEG00000000117	SRPRA	51	80.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000002602	srpra	92	65.258	ENSACIG00000021588	srpra	50	79.385	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000002602	srpra	93	70.976	ENSAOCG00000018884	srpra	63	73.037	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000002602	srpra	93	70.976	ENSAPEG00000022286	srpra	63	73.037	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.492	ENSATEG00000023578	srpra	56	83.025	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	65.509	ENSAPLG00000016079	SRPRA	66	68.812	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000002602	srpra	92	65.957	ENSACAG00000000108	SRPRA	62	68.238	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSANAG00000020346	SRPRA	65	70.025	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.031	ENSACLG00000000518	srpra	50	84.112	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.111	ENSAMXG00000009975	srpra	62	73.615	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000002602	srpra	75	81.231	ENSBTAG00000014105	SRPRA	51	81.231	Bos_taurus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	57.583	WBGene00009521	F38A1.8	50	68.438	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.599	ENSCJAG00000008752	SRPRA	65	70.025	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.106	ENSCAFG00000010474	SRPRA	51	80.615	Canis_familiaris
ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.866	ENSCAFG00020010608	SRPRA	51	80.308	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.157	ENSCHIG00000012423	SRPRA	51	81.231	Capra_hircus
ENSEBUG00000002602	srpra	75	80.923	ENSTSYG00000005187	SRPRA	64	80.923	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000002602	srpra	91	68.447	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	84.962	Cavia_aperea
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	84.962	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSCCAG00000025602	SRPRA	65	70.025	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSCATG00000039354	SRPRA	53	80.923	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	ENSCLAG00000016839	SRPRA	51	80.615	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSCSAG00000002271	SRPRA	51	80.923	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	81.847	ENSCPBG00000011128	SRPRA	62	68.564	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000002602	srpra	74	74.688	ENSCING00000008954	-	53	74.688	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000002602	srpra	89	65.206	ENSCSAVG00000005602	-	52	74.688	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.825	ENSCANG00000032337	SRPRA	53	80.923	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	ENSCGRG00001017670	Srpr	51	80.615	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	85.185	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000002602	srpra	99	68.650	ENSCSEG00000002374	srpra	54	83.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000002602	srpra	73	82.540	ENSCVAG00000019881	srpra	50	82.099	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	66.276	ENSDARG00000061124	srpra	50	80.923	Danio_rerio
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSDNOG00000010821	SRPRA	50	80.615	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSDORG00000016719	Srpr	51	80.923	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000002602	srpra	88	60.100	FBgn0010391	Gtp-bp	53	69.753	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.082	ENSETEG00000013956	SRPRA	61	70.202	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000002602	srpra	91	68.193	ENSEASG00005022980	SRPRA	51	80.308	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000002602	srpra	91	68.193	ENSECAG00000014692	SRPRA	51	80.308	Equus_caballus
ENSEBUG00000002602	srpra	75	80.000	ENSEEUG00000007920	SRPRA	51	80.000	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	82.222	ENSELUG00000017643	srpra	50	81.538	Esox_lucius
ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.943	ENSFCAG00000011274	-	53	80.615	Felis_catus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.933	ENSFALG00000005048	SRPRA	51	81.231	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	86.364	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.492	ENSFHEG00000016959	srpra	50	83.025	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.292	ENSGMOG00000013244	srpra	60	73.280	Gadus_morhua
ENSEBUG00000002602	srpra	92	64.896	ENSGALG00000030759	SRPRA	62	68.812	Gallus_gallus
ENSEBUG00000002602	srpra	93	71.782	ENSGAFG00000000453	srpra	54	82.716	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.810	ENSGACG00000006550	srpra	50	83.333	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	66.588	ENSGAGG00000021157	SRPRA	62	68.564	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSGGOG00000012962	SRPRA	53	80.923	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.794	ENSHBUG00000000119	srpra	50	83.801	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.434	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	86.364	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.434	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	86.364	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000002602	srpra	94	70.773	ENSHCOG00000010749	srpra	55	83.025	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000002602	srpra	92	66.357	ENSIPUG00000000867	srpra	53	80.615	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	ENSSTOG00000009897	SRPRA	51	80.615	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.182	ENSJJAG00000020272	Srpr	51	80.615	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	ENSKMAG00000002280	srpra	50	83.025	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	84.127	ENSLBEG00000009608	srpra	50	83.642	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000002602	srpra	96	66.133	ENSLACG00000017781	SRPRA	51	80.374	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000002602	srpra	74	83.125	ENSLOCG00000002733	srpra	50	82.515	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	ENSLAFG00000010252	SRPRA	51	80.308	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSMFAG00000032606	SRPRA	53	80.923	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSMMUG00000007938	SRPRA	53	80.923	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSMNEG00000030709	SRPRA	53	80.923	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSMLEG00000043404	SRPRA	53	80.923	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.458	ENSMAMG00000000473	srpra	50	83.642	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.031	ENSMZEG00005013432	srpra	50	84.112	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000002602	srpra	92	64.501	ENSMGAG00000000732	SRPRA	67	68.812	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	ENSMAUG00000015648	Srpr	62	69.949	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	ENSMICG00000015981	SRPRA	53	80.923	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.599	ENSMOCG00000008311	Srpr	51	80.308	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.277	ENSMMOG00000005019	srpra	53	83.025	Mola_mola
ENSEBUG00000002602	srpra	89	70.297	ENSMODG00000004576	-	62	70.529	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.599	ENSMALG00000011343	srpra	50	83.025	Monopterus_albus
ENSEBUG00000002602	srpra	89	69.479	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	84.848	Mus_caroli
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	85.606	Mus_musculus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	85.606	Mus_pahari
ENSEBUG00000002602	srpra	91	79.310	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	53	80.615	Mus_spretus
ENSEBUG00000002602	srpra	75	80.615	ENSMPUG00000006626	SRPRA	51	80.615	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSMLUG00000017334	SRPRA	51	80.923	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSNGAG00000015686	Srpr	62	69.521	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.267	ENSNBRG00000017311	srpra	50	84.112	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSNLEG00000007467	SRPRA	56	80.923	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000002602	srpra	89	69.554	ENSMEUG00000004956	SRPRA	54	80.923	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.357	ENSOPRG00000013160	SRPRA	51	80.923	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSODEG00000004730	SRPRA	51	80.923	Octodon_degus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.794	ENSONIG00000005324	srpra	50	83.801	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.599	ENSOCUG00000017057	SRPRA	51	80.923	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.646	ENSORLG00000014676	srpra	58	82.716	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.646	ENSORLG00020009240	srpra	63	69.059	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000002602	srpra	92	70.864	ENSORLG00015015405	srpra	62	71.649	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000002602	srpra	92	71.072	ENSOMEG00000005872	srpra	53	82.716	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSOGAG00000008926	SRPRA	51	80.923	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.157	ENSOARG00000012397	SRPRA	51	81.231	Ovis_aries
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSPPAG00000030813	SRPRA	53	80.923	Pan_paniscus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.943	ENSPPRG00000001542	SRPRA	53	80.615	Panthera_pardus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.703	ENSPTIG00000006989	SRPRA	53	80.308	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSPTRG00000028360	SRPRA	53	80.923	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSPANG00000010858	SRPRA	53	80.923	Papio_anubis
ENSEBUG00000002602	srpra	75	80.000	ENSPKIG00000016106	srpra	63	70.051	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.009	ENSPSIG00000012009	SRPRA	66	68.564	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.856	ENSPMGG00000001393	srpra	51	84.161	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	ENSPEMG00000018279	Srpr	51	80.615	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000002602	srpra	76	80.000	ENSPMAG00000009559	srpra	52	80.000	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000002602	srpra	89	69.458	ENSPCIG00000010207	SRPRA	51	80.923	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	ENSPFOG00000003114	srpra	50	83.333	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	ENSPLAG00000007323	srpra	55	83.333	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	ENSPMEG00000015658	srpra	63	74.271	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000002602	srpra	93	73.267	ENSPREG00000004937	srpra	55	83.025	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	ENSPCOG00000025726	SRPRA	54	78.507	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.157	ENSPVAG00000000993	SRPRA	51	81.231	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	69.031	ENSPNYG00000012371	srpra	50	84.112	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000002602	srpra	73	81.329	ENSPNAG00000013476	srpra	50	80.615	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.841	ENSRNOG00000010543	Srpra	51	80.615	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSRBIG00000008702	SRPRA	53	80.923	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.750	ENSRROG00000029494	SRPRA	53	80.923	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000002602	srpra	75	38.710	YDR292C	-	54	38.710	Saccharomyces_cerevisiae
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	ENSSBOG00000035892	SRPRA	65	70.025	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000002602	srpra	89	69.802	ENSSHAG00000009168	SRPRA	75	70.025	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000002602	srpra	97	67.824	ENSSFOG00015008837	srpra	63	71.169	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000002602	srpra	96	69.762	ENSSMAG00000002783	srpra	63	72.798	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.864	ENSSDUG00000013920	srpra	55	84.259	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000002602	srpra	83	66.667	ENSSARG00000012434	SRPRA	59	67.778	Sorex_araneus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	80.255	ENSSPUG00000018221	SRPRA	62	68.642	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	71.178	ENSSPAG00000005103	srpra	50	82.716	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.421	ENSSSCG00000015227	SRPRA	51	80.923	Sus_scrofa
ENSEBUG00000002602	srpra	92	66.033	ENSTGUG00000000815	SRPRA	54	78.769	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.772	ENSTRUG00000006856	srpra	63	73.969	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000002602	srpra	75	80.308	ENSTTRG00000001558	SRPRA	51	80.308	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000002602	srpra	75	80.923	ENSUAMG00000005510	SRPRA	51	80.923	Ursus_americanus
ENSEBUG00000002602	srpra	92	65.459	ENSUMAG00000002269	SRPRA	52	76.000	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000002602	srpra	61	85.271	ENSVPAG00000001077	SRPRA	50	85.271	Vicugna_pacos
ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.106	ENSVVUG00000020094	SRPRA	51	80.615	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000002602	srpra	92	54.186	ENSXETG00000003920	srpra	50	64.438	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	ENSXCOG00000001286	srpra	62	83.333	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.810	ENSXMAG00000028401	srpra	50	83.333	Xiphophorus_maculatus