EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000002721 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 195186 bases
Position: chrFYBX02009729.1:2431017-2626202
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000003789	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-39	1	7
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ENSEBUP00000003789	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-39	3	7
ENSEBUP00000003789	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-39	4	7
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ENSEBUP00000003789	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-39	6	7
ENSEBUP00000003789	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-39	7	7
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ENSEBUP00000003818	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-34	6	6
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ENSEBUP00000003807	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-34	2	6
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ENSEBUP00000003789	zf-met	PF12874.7	8.7e-11	2	3
ENSEBUP00000003789	zf-met	PF12874.7	8.7e-11	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSEBUT00000004182	-	3336	-	ENSEBUP00000003789	524 (aa)	-	-
ENSEBUT00000004212	-	3108	-	ENSEBUP00000003818	594 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000002721	-	65	44.094	ENSEBUG00000009909	-	94	50.521
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ENSEBUG00000002721	-	98	48.996	ENSEBUG00000006092	-	98	48.996
ENSEBUG00000002721	-	59	48.223	ENSEBUG00000012748	-	89	49.223
ENSEBUG00000002721	-	56	40.602	ENSEBUG00000016164	-	86	44.162
ENSEBUG00000002721	-	61	34.848	ENSEBUG00000003842	-	90	41.463
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ENSEBUG00000002721	-	65	47.390	ENSEBUG00000004999	-	99	47.390
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