EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000003347 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo11
Alias: zgc:91897
Full Name: importin 11
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 238484 bases
Position: chrFYBX02009513.1:221986-460469
Accession: ZDB-GENE-040711-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000004821	IBN_N	PF03810.19	4.7e-18	1	1
ENSEBUP00000004844	IBN_N	PF03810.19	4.7e-18	1	1
ENSEBUP00000004884	IBN_N	PF03810.19	5e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000005322	-	2932	-	ENSEBUP00000004884	968 (aa)	-	-
ENSEBUT00000005259	-	5538	-	ENSEBUP00000004821	972 (aa)	-	-
ENSEBUT00000005282	-	5538	-	ENSEBUP00000004844	972 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.391	ENSG00000086200	IPO11	100	72.840	Homo_sapiens
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.111	ENSAPOG00000009256	ipo11	99	61.008	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.164	ENSAMEG00000004080	IPO11	99	60.062	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000003347	ipo11	91	60.000	ENSACIG00000003345	ipo11	98	60.000	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.751	ENSAOCG00000000164	ipo11	99	58.649	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.993	ENSAPEG00000005496	ipo11	99	58.890	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000003347	ipo11	95	61.781	ENSATEG00000016853	ipo11	99	61.672	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	57.375	ENSAPLG00000009338	IPO11	99	57.274	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.082	ENSACAG00000008472	IPO11	99	59.979	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.288	ENSANAG00000027877	IPO11	99	60.185	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	57.846	ENSACLG00000014997	ipo11	99	57.744	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	56.937	ENSAMXG00000005993	ipo11	99	56.793	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000003347	ipo11	89	60.627	ENSBTAG00000018616	IPO11	99	60.627	Bos_taurus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.288	ENSCJAG00000015559	IPO11	99	60.185	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSCAFG00000007240	IPO11	99	60.391	Canis_familiaris
ENSEBUG00000003347	ipo11	72	62.518	ENSCAFG00020022776	-	99	62.518	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.082	ENSCHIG00000013218	IPO11	99	60.743	Capra_hircus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.259	ENSCPOG00000009412	IPO11	99	59.156	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSCCAG00000024860	IPO11	99	60.391	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSCATG00000040159	IPO11	99	60.082	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.391	ENSCLAG00000003889	IPO11	99	60.288	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000003347	ipo11	56	62.983	ENSCSAG00000016001	IPO11	96	62.983	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000003347	ipo11	76	65.385	ENSCHOG00000002780	IPO11	76	65.385	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.905	ENSCPBG00000026824	IPO11	98	64.023	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	32.593	ENSCING00000006626	-	99	32.495	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	31.932	ENSCSAVG00000003664	-	99	31.928	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	56.588	ENSCANG00000042405	IPO11	99	60.581	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.979	ENSCGRG00001012206	Ipo11	99	59.877	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.979	ENSCGRG00000003026	-	99	59.877	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.214	ENSCSEG00000017257	ipo11	99	61.266	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.214	ENSCVAG00000011995	ipo11	99	61.214	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.597	ENSDARG00000054224	ipo11	99	60.494	Danio_rerio
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.333	ENSDORG00000002721	Ipo11	99	58.230	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000003347	ipo11	98	32.776	FBgn0284254	Impbeta11	94	32.419	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000003347	ipo11	55	60.225	ENSEASG00005006951	-	95	60.232	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSECAG00000014185	IPO11	98	60.391	Equus_caballus
ENSEBUG00000003347	ipo11	92	55.430	ENSEEUG00000000271	IPO11	92	55.204	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000003347	ipo11	89	73.714	ENSELUG00000002842	ipo11	99	60.391	Esox_lucius
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSFCAG00000003236	IPO11	99	60.391	Felis_catus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSFALG00000011086	IPO11	99	60.082	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.082	ENSFDAG00000016117	IPO11	99	59.979	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	53.429	ENSFHEG00000017985	ipo11	99	53.429	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.597	ENSGMOG00000007727	ipo11	99	60.494	Gadus_morhua
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.700	ENSGALG00000014740	IPO11	99	60.597	Gallus_gallus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.802	ENSGAFG00000012342	ipo11	100	61.346	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSGACG00000006939	ipo11	99	60.391	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	91	59.091	ENSGAGG00000008880	IPO11	98	60.260	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.391	ENSGGOG00000003240	IPO11	99	60.288	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.420	ENSHBUG00000004364	ipo11	99	61.317	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.774	ENSHGLG00000002375	IPO11	99	59.877	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.877	ENSHGLG00100011662	IPO11	99	59.979	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.993	ENSHCOG00000013529	ipo11	99	58.890	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	54.658	ENSIPUG00000019077	clc4f	99	54.658	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSSTOG00000006070	IPO11	99	60.082	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.465	ENSJJAG00000007223	Ipo11	99	59.362	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.865	ENSKMAG00000013674	ipo11	100	61.071	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000003347	ipo11	93	71.429	ENSLBEG00000003126	ipo11	99	71.429	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.782	ENSLOCG00000007848	ipo11	100	60.803	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.979	ENSLAFG00000003115	IPO11	100	60.714	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSMFAG00000035631	IPO11	99	59.465	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSMMUG00000001233	IPO11	100	72.840	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.288	ENSMNEG00000032061	IPO11	99	59.568	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSMLEG00000014468	IPO11	99	60.082	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.700	ENSMAMG00000020889	ipo11	99	60.597	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.420	ENSMZEG00005006586	ipo11	99	61.317	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	53.080	ENSMGAG00000004204	IPO11	99	52.977	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	53.176	ENSMAUG00000020293	Ipo11	99	53.074	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.848	ENSMICG00000036842	-	100	58.456	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.597	ENSMICG00000016463	-	100	60.714	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.671	ENSMOCG00000000236	Ipo11	99	59.774	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.740	ENSMMOG00000001391	ipo11	99	58.638	Mola_mola
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSMODG00000019612	IPO11	99	60.082	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.700	ENSMALG00000017198	ipo11	99	60.597	Monopterus_albus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.774	MGP_CAROLIEiJ_G0018871	Ipo11	99	59.671	Mus_caroli
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.774	ENSMUSG00000042590	Ipo11	99	59.671	Mus_musculus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	58.951	MGP_PahariEiJ_G0015943	Ipo11	99	58.848	Mus_pahari
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.774	MGP_SPRETEiJ_G0019750	Ipo11	99	59.671	Mus_spretus
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ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSMLUG00000011760	IPO11	99	60.082	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.979	ENSNGAG00000007024	Ipo11	99	59.877	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000003347	ipo11	94	57.143	ENSNBRG00000013831	ipo11	99	57.034	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSNLEG00000003072	IPO11	99	60.082	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000003347	ipo11	74	65.580	ENSMEUG00000003783	-	74	65.580	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSODEG00000017269	IPO11	99	60.391	Octodon_degus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.420	ENSONIG00000015147	ipo11	99	61.317	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000003347	ipo11	85	60.072	ENSOANG00000012524	IPO11	92	60.072	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSORLG00000004267	ipo11	99	60.803	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSORLG00020002280	ipo11	99	60.391	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSORLG00015010565	ipo11	99	60.391	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	61.317	ENSOMEG00000021765	ipo11	98	63.776	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.391	ENSOGAG00000000533	IPO11	99	60.288	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.082	ENSOARG00000006763	IPO11	99	59.979	Ovis_aries
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.391	ENSPPAG00000042249	IPO11	99	60.288	Pan_paniscus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSPPRG00000000856	IPO11	99	60.391	Panthera_pardus
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.494	ENSPTIG00000015280	IPO11	99	60.391	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.288	ENSPTRG00000016915	IPO11	99	60.185	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.185	ENSPANG00000013348	IPO11	99	60.082	Papio_anubis
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ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.843	ENSPSIG00000002959	IPO11	99	60.843	Pelodiscus_sinensis
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ENSEBUG00000003347	ipo11	99	59.671	ENSPEMG00000018393	Ipo11	99	59.568	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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