EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000003969 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: smarcad1a
Alias: smarcad1|wu:fi25c01|zgc:113183
Full Name: SWI/SNF-related%2C matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C containing DEAD/H box 1 a
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 112907 bases
Position: chrFYBX02006845.1:15647-128553
Accession: ZDB-GENE-050522-499
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000005923	ResIII	PF04851.15	4.6e-07	1	1
ENSEBUP00000005945	ResIII	PF04851.15	5.4e-07	1	1
ENSEBUP00000005978	ResIII	PF04851.15	5.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000006369	-	2802	-	ENSEBUP00000005923	568 (aa)	-	-
ENSEBUT00000006426	-	4591	-	ENSEBUP00000005978	691 (aa)	-	-
ENSEBUT00000006391	-	6234	-	ENSEBUP00000005945	637 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000003969's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000003969's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	74	34.951	ENSEBUG00000005791	chd1l	60	34.951
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	73	30.469	ENSEBUG00000009104	rad54b	53	30.989

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSG00000163104	SMARCAD1	95	48.342	Homo_sapiens
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	48.433	ENSAPOG00000011446	smarcad1a	61	48.397	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSAMEG00000005844	SMARCAD1	62	45.706	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	48.243	ENSACIG00000018326	smarcad1a	88	48.509	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	47.867	ENSAOCG00000019762	smarcad1a	60	48.092	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	48.025	ENSAPEG00000003889	smarcad1a	60	48.244	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	48.392	ENSATEG00000015608	smarcad1a	63	47.926	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	47.087	ENSAPLG00000004630	SMARCAD1	65	46.967	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSACAG00000013554	SMARCAD1	62	45.636	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSANAG00000020488	SMARCAD1	70	45.552	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	48.485	ENSACLG00000017063	smarcad1a	61	48.903	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	99	46.178	ENSAMXG00000019130	smarcad1b	68	46.635	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	99	44.076	ENSAMXG00000015470	smarcad1a	88	44.201	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.557	ENSBTAG00000017061	SMARCAD1	62	44.954	Bos_taurus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	37.647	WBGene00010845	M03C11.8	66	36.701	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSCJAG00000006778	SMARCAD1	62	45.552	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSCAFG00000010026	SMARCAD1	61	46.178	Canis_familiaris
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSCAFG00020003994	SMARCAD1	70	46.178	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSCHIG00000012905	SMARCAD1	62	45.399	Capra_hircus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSTSYG00000002706	SMARCAD1	62	45.706	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	42.320	ENSCAPG00000016744	SMARCAD1	68	42.047	Cavia_aperea
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSCPOG00000011398	SMARCAD1	60	46.178	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSCCAG00000022264	SMARCAD1	95	48.342	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSCATG00000035663	SMARCAD1	71	45.552	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSCSAG00000004186	SMARCAD1	75	45.552	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSCPBG00000013203	SMARCAD1	61	46.318	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	42.516	ENSCING00000001688	-	99	41.945	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSCANG00000003556	SMARCAD1	95	48.342	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSCGRG00001015056	Smarcad1	61	45.866	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSCGRG00000014087	Smarcad1	61	45.866	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	95	47.267	ENSCSEG00000017903	smarcad1a	62	46.269	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	95	47.200	ENSCSEG00000014419	-	65	46.818	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	47.279	ENSDARG00000014041	smarcad1a	63	46.264	Danio_rerio
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	47.368	ENSDARG00000073721	smarcad1b	67	46.462	Danio_rerio
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSDNOG00000000806	-	62	45.706	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	95	46.753	ENSDORG00000012331	Smarcad1	62	46.166	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	40.236	FBgn0032157	Etl1	77	38.531	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSEASG00005012382	SMARCAD1	73	44.411	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSECAG00000011562	SMARCAD1	62	45.706	Equus_caballus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	47.840	ENSELUG00000018535	smarcad1a	62	47.500	Esox_lucius
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	46.226	ENSELUG00000019154	smarcad1b	64	47.013	Esox_lucius
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSFCAG00000003958	SMARCAD1	95	48.517	Felis_catus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	46.919	ENSFALG00000006089	SMARCAD1	63	46.986	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSFDAG00000017027	SMARCAD1	61	46.178	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	48.226	ENSFHEG00000012778	smarcad1a	61	46.637	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	93	48.440	ENSGMOG00000018995	smarcad1a	74	47.158	Gadus_morhua
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.120	ENSGALG00000037339	SMARCAD1	76	45.046	Gallus_gallus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	90	48.966	ENSGAFG00000013498	smarcad1a	58	47.974	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	47.541	ENSGACG00000007327	smarcad1a	74	46.319	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.867	ENSGAGG00000008582	SMARCAD1	61	45.794	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSGGOG00000023001	SMARCAD1	62	45.552	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	48.504	ENSHBUG00000011042	smarcad1a	60	48.983	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSHGLG00000005070	SMARCAD1	61	46.178	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSHGLG00100006812	SMARCAD1	61	46.178	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	49.063	ENSHCOG00000007848	smarcad1a	60	46.305	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	46.429	ENSIPUG00000000242	smarcad1a	65	44.410	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	93	47.833	ENSIPUG00000022817	smarcad1b	68	46.573	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.867	ENSSTOG00000001227	SMARCAD1	62	45.609	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSJJAG00000022342	Smarcad1	61	46.022	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	47.021	ENSKMAG00000021351	smarcad1a	60	46.472	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	99	47.671	ENSLBEG00000008088	smarcad1a	61	48.382	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	48.350	ENSLOCG00000012909	smarcad1a	65	47.442	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	95	46.104	ENSLAFG00000000040	SMARCAD1	62	44.923	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSMFAG00000042606	SMARCAD1	71	45.552	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSMMUG00000022242	SMARCAD1	71	45.552	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSMNEG00000038117	SMARCAD1	95	48.342	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSMLEG00000038333	SMARCAD1	95	48.342	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	48.083	ENSMAMG00000000933	smarcad1a	59	47.874	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	48.485	ENSMZEG00005005203	smarcad1a	61	48.903	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	81	48.127	ENSMGAG00000005577	SMARCAD1	58	47.611	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSMAUG00000008417	Smarcad1	62	45.399	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.880	ENSMICG00000009746	SMARCAD1	61	45.723	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSMOCG00000017142	Smarcad1	61	46.022	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	99	46.698	ENSMMOG00000000275	smarcad1a	89	46.522	Mola_mola
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.515	ENSMODG00000019268	SMARCAD1	62	46.083	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	MGP_CAROLIEiJ_G0028458	-	50	45.866	Mus_caroli
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSMUSG00000029920	Smarcad1	61	45.866	Mus_musculus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	MGP_PahariEiJ_G0022198	Smarcad1	61	46.022	Mus_pahari
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	MGP_SPRETEiJ_G0029462	Smarcad1	61	45.866	Mus_spretus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSMPUG00000002111	SMARCAD1	62	45.706	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.365	ENSMLUG00000000425	SMARCAD1	62	45.719	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.705	ENSNGAG00000000810	Smarcad1	63	45.092	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	48.265	ENSNBRG00000012749	smarcad1a	75	48.666	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSNLEG00000014225	SMARCAD1	95	48.342	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.764	ENSODEG00000004334	SMARCAD1	61	46.573	Octodon_degus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	50.000	ENSONIG00000015059	smarcad1a	66	48.452	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.880	ENSOANG00000013764	SMARCAD1	76	45.497	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.677	ENSOCUG00000017283	SMARCAD1	62	46.012	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	48.099	ENSORLG00000004869	smarcad1a	60	47.799	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	48.099	ENSORLG00020020569	smarcad1a	60	47.642	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	47.934	ENSORLG00015009045	smarcad1a	60	47.484	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	48.926	ENSOMEG00000023032	smarcad1a	60	48.428	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.557	ENSOGAG00000011444	SMARCAD1	62	45.176	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.029	ENSOARG00000017851	SMARCAD1	62	45.399	Ovis_aries
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSPPAG00000035715	SMARCAD1	62	45.552	Pan_paniscus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSPPRG00000024756	SMARCAD1	95	48.517	Panthera_pardus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.880	ENSPTIG00000017868	SMARCAD1	62	45.260	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSPTRG00000023126	SMARCAD1	95	48.342	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.719	ENSPANG00000019757	SMARCAD1	61	46.077	Papio_anubis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.840	ENSPSIG00000010255	SMARCAD1	61	46.573	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	92	46.465	ENSPMGG00000010735	smarcad1a	91	45.455	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	39.580	ENSPEMG00000001854	Smarcad1	62	38.957	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	48.442	ENSPMAG00000003516	smarcad1a	64	49.388	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.677	ENSPCIG00000008137	SMARCAD1	87	45.688	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	48.805	ENSPFOG00000019116	smarcad1a	56	47.833	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	48.635	ENSPLAG00000000108	smarcad1a	56	47.673	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	91	48.805	ENSPMEG00000009155	smarcad1a	56	47.833	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	47.013	ENSPREG00000018185	smarcad1a	62	47.673	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.719	ENSPPYG00000014935	SMARCAD1	62	45.107	Pongo_abelii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	44.604	ENSPCOG00000020478	SMARCAD1	63	44.809	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.104	ENSPVAG00000001760	SMARCAD1	62	45.469	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	98	48.265	ENSPNYG00000010087	smarcad1a	75	48.746	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	93	47.739	ENSPNAG00000010099	smarcad1b	66	47.293	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	45.642	ENSPNAG00000001663	smarcad1a	65	45.412	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSRNOG00000006391	Smarcad1	61	46.178	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSRBIG00000041989	SMARCAD1	62	45.552	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSRROG00000035309	SMARCAD1	62	45.552	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.191	ENSSBOG00000032114	SMARCAD1	95	48.342	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.677	ENSSHAG00000001279	SMARCAD1	62	46.237	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	92	47.547	ENSSFOG00015020909	smarcad1a	81	46.785	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	94	47.426	ENSSFOG00015016814	smarcad1b	60	48.710	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	47.910	ENSSMAG00000001326	smarcad1a	59	47.920	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	97	47.528	ENSSDUG00000022338	smarcad1a	75	47.270	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	48.298	ENSSLDG00000024986	smarcad1a	59	47.582	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	84	49.449	ENSSPUG00000004633	SMARCAD1	97	48.464	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	99	47.559	ENSSPAG00000001970	smarcad1a	58	48.666	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSSSCG00000009193	SMARCAD1	75	45.706	Sus_scrofa
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	47.735	ENSTGUG00000003127	SMARCAD1	82	47.604	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.624	ENSTNIG00000017585	smarcad1a	72	46.468	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.117	ENSTTRG00000000226	SMARCAD1	63	45.482	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSUAMG00000022262	SMARCAD1	67	46.178	Ursus_americanus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSUMAG00000004549	SMARCAD1	62	45.706	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	46.353	ENSVVUG00000007271	SMARCAD1	76	46.178	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	45.894	ENSXETG00000019214	smarcad1	74	45.413	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	47.360	ENSXCOG00000005232	smarcad1a	78	47.253	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000003969	smarcad1a	96	47.520	ENSXMAG00000015350	smarcad1a	56	47.994	Xiphophorus_maculatus