EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000004047 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 91107 bases
Position: chrFYBX02010305.1:863483-954589
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000006231	GTP_EFTU	PF00009.27	7.5e-07	1	1
ENSEBUP00000006191	GTP_EFTU	PF00009.27	2.4e-06	1	1
ENSEBUP00000006138	GTP_EFTU	PF00009.27	3e-06	1	1
ENSEBUP00000006191	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.2e-12	1	1
ENSEBUP00000006231	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-11	1	1
ENSEBUP00000006138	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-11	1	1
ENSEBUP00000006191	EFG_IV	PF03764.18	2.5e-24	1	1
ENSEBUP00000006231	EFG_IV	PF03764.18	3.1e-24	1	1
ENSEBUP00000006138	EFG_IV	PF03764.18	8.8e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000006683	-	2586	-	ENSEBUP00000006231	861 (aa)	-	-
ENSEBUT00000006588	-	6797	-	ENSEBUP00000006138	848 (aa)	-	-
ENSEBUT00000006642	-	6503	-	ENSEBUP00000006191	750 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000004047's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000004047's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000004047	-	83	49.733	ENSEBUG00000009369	-	82	49.733

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSG00000108883	EFTUD2	100	91.045	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSAPOG00000002433	eftud2	74	93.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	74	93.035	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSACIG00000009096	eftud2	76	93.532	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000004047	-	95	83.871	ENSAOCG00000023385	eftud2	86	93.532	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSAPEG00000003321	eftud2	74	93.532	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000004047	-	96	87.761	ENSATEG00000000457	eftud2	74	93.532	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000004047	-	96	83.241	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	74	93.532	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSACAG00000007637	EFTUD2	74	94.030	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSANAG00000025320	EFTUD2	75	93.035	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSACLG00000001296	eftud2	74	93.532	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000004047	-	96	87.761	ENSAMXG00000000568	eftud2	73	93.532	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	74	93.035	Bos_taurus
ENSEBUG00000004047	-	96	70.417	WBGene00001166	eftu-2	74	77.612	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	75	93.035	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	74	93.035	Canis_familiaris
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	74	93.035	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	74	93.035	Capra_hircus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.787	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	75	93.035	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	74	93.035	Cavia_aperea
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	74	93.035	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	74	93.035	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCATG00000035809	EFTUD2	75	93.035	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000004047	-	96	87.204	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	74	93.035	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	74	93.035	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000004047	-	77	96.133	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	73	96.133	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	74	93.532	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000004047	-	96	80.166	ENSCING00000009372	-	74	90.547	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000004047	-	96	80.028	ENSCSAVG00000004985	-	88	89.604	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCANG00000026557	EFTUD2	75	93.035	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCGRG00001009904	Eftud2	74	93.035	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSCGRG00000003825	Eftud2	74	93.035	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSCSEG00000016775	eftud2	74	93.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSCVAG00000012537	eftud2	74	93.532	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000004047	-	96	88.039	ENSDARG00000012261	eftud2	74	93.532	Danio_rerio
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	74	93.035	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSDORG00000011566	Eftud2	74	93.035	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000004047	-	96	78.164	FBgn0039566	CG4849	74	88.557	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000004047	-	78	92.727	ENSETEG00000005678	EFTUD2	62	94.565	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSEASG00005010321	EFTUD2	74	93.035	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSECAG00000019363	EFTUD2	69	93.035	Equus_caballus
ENSEBUG00000004047	-	86	90.909	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	76	94.068	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.648	ENSELUG00000017169	eftud2	74	93.532	Esox_lucius
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	74	93.035	Felis_catus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSFALG00000007551	EFTUD2	74	93.532	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	74	93.035	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSFHEG00000013479	eftud2	74	93.532	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSGMOG00000014277	eftud2	74	93.532	Gadus_morhua
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSGALG00000000988	EFTUD2	77	93.532	Gallus_gallus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSGAFG00000002263	eftud2	74	93.532	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSGACG00000009163	eftud2	74	93.532	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	74	93.035	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSHBUG00000023546	eftud2	74	96.296	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	74	93.035	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	74	93.035	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000004047	-	96	87.622	ENSHCOG00000017689	eftud2	74	93.532	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000004047	-	96	88.317	ENSIPUG00000023182	Eftud2	74	93.532	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	78	93.035	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSJJAG00000018268	Eftud2	77	93.035	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.761	ENSKMAG00000021027	eftud2	74	93.035	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000004047	-	96	85.814	ENSLBEG00000005875	eftud2	87	86.468	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000004047	-	96	88.734	ENSLACG00000012918	EFTUD2	74	94.527	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSLOCG00000011460	eftud2	74	94.030	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	74	93.035	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	75	93.035	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	91.045	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	75	93.035	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	75	93.035	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSMAMG00000022190	eftud2	74	95.897	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSMZEG00005022885	eftud2	74	93.532	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000004047	-	96	86.824	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	74	93.532	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMAUG00000021178	Eftud2	74	93.035	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMICG00000016592	EFTUD2	74	93.035	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMOCG00000009039	-	74	93.035	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000004047	-	87	77.896	ENSMOCG00000017653	-	72	79.710	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000004047	-	96	87.204	ENSMMOG00000020811	eftud2	84	93.532	Mola_mola
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSMODG00000011347	EFTUD2	74	93.035	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000004047	-	96	85.953	ENSMALG00000014501	eftud2	84	93.532	Monopterus_albus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	95	77.778	Mus_caroli
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMUSG00000020929	Eftud2	94	77.778	Mus_musculus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	92	79.487	Mus_pahari
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	95	77.778	Mus_spretus
ENSEBUG00000004047	-	95	87.465	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	68	95.312	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	74	93.035	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSNGAG00000017834	Eftud2	74	93.035	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSNBRG00000020081	eftud2	74	93.532	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000004047	-	94	87.553	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	73	95.767	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000004047	-	89	87.332	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	69	96.078	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000004047	-	85	92.537	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	74	92.537	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000004047	-	89	69.322	ENSODEG00000003385	-	79	69.727	Octodon_degus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSODEG00000018041	-	74	93.035	Octodon_degus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSONIG00000000912	eftud2	74	93.532	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	74	93.035	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSORLG00000003109	eftud2	74	93.532	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSORLG00020009865	eftud2	75	93.532	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSORLG00015002611	eftud2	78	93.532	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	74	93.035	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSOARG00000009078	EFTUD2	72	93.035	Ovis_aries
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	74	93.035	Pan_paniscus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	74	93.035	Panthera_pardus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	74	93.035	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	74	93.035	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPANG00000021284	EFTUD2	75	93.035	Papio_anubis
ENSEBUG00000004047	-	89	85.736	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	74	90.968	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000004047	-	88	85.520	ENSPMGG00000007281	eftud2	70	96.104	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPEMG00000005129	Eftud2	74	93.035	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	74	93.035	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.622	ENSPFOG00000008515	eftud2	74	93.532	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000004047	-	96	87.622	ENSPLAG00000010393	eftud2	74	93.532	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000004047	-	96	87.622	ENSPMEG00000005087	eftud2	74	93.532	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	75	93.035	Pongo_abelii
ENSEBUG00000004047	-	89	87.183	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	69	96.078	Procavia_capensis
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	74	93.035	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000004047	-	96	86.787	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	74	92.537	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSPNYG00000012448	eftud2	74	93.532	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000004047	-	96	87.761	ENSPNAG00000012490	eftud2	76	93.532	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSRNOG00000002818	Eftud2	74	93.035	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	74	93.035	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSRROG00000042925	EFTUD2	75	93.035	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000004047	-	94	34.301	YKL173W	SNU114	72	39.286	Saccharomyces_cerevisiae
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	76	93.035	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	77	93.035	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000004047	-	96	87.204	ENSSFOG00015023272	eftud2	74	93.532	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.204	ENSSMAG00000010174	eftud2	85	93.532	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSSDUG00000022675	eftud2	74	93.532	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSSLDG00000001595	eftud2	74	93.532	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000004047	-	85	89.055	ENSSARG00000008664	EFTUD2	74	89.055	Sorex_araneus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	74	94.030	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	ENSSPAG00000016235	eftud2	73	93.532	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	74	93.035	Sus_scrofa
ENSEBUG00000004047	-	83	86.174	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	76	96.078	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSTRUG00000016422	eftud2	74	93.532	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000004047	-	96	86.546	ENSTNIG00000005346	eftud2	75	93.532	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000004047	-	96	79.694	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	74	84.423	Tupaia_belangeri
ENSEBUG00000004047	-	96	82.476	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	76	83.221	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	75	93.035	Ursus_americanus
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	74	93.035	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000004047	-	80	83.333	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	64	91.045	Vicugna_pacos
ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	74	93.035	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSXETG00000003394	eftud2	77	93.035	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000004047	-	90	87.649	ENSXCOG00000017309	eftud2	82	96.104	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	ENSXMAG00000008494	eftud2	74	93.532	Xiphophorus_maculatus