EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000004305 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pop4 (1 of many)
Alias: zgc:110597
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3033 bases
Position: chrFYBX02010311.1:1204826-1207858
Accession: ZDB-GENE-050522-505
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000006537	UPF0086	PF01868.16	2.1e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000006993	-	657	-	ENSEBUP00000006537	218 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000004305	pop4	94	89.302	ENSEBUG00000010447	pop4	84	89.302
ENSEBUG00000004305	pop4	100	91.441	ENSEBUG00000008575	pop4	100	91.441

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000004305	pop4	100	41.631	ENSG00000105171	POP4	91	56.322	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004305	pop4	100	36.170	ENSAMEG00000003172	-	100	36.170	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.175	ENSAMEG00000018329	-	98	39.738	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000004305	pop4	99	40.948	ENSACIG00000008358	pop4	99	39.827	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000004305	pop4	92	40.000	ENSAOCG00000010116	pop4	97	41.315	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000004305	pop4	100	37.991	ENSAPEG00000002829	pop4	92	39.224	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000004305	pop4	92	41.706	ENSATEG00000013028	pop4	90	40.566	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000004305	pop4	94	42.466	ENSAPLG00000014051	POP4	99	42.466	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000004305	pop4	98	42.795	ENSANAG00000020295	POP4	98	43.231	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.435	ENSACLG00000000526	pop4	98	39.130	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000004305	pop4	90	43.750	ENSAMXG00000002899	pop4	88	43.750	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	40.343	ENSBTAG00000002223	POP4	100	39.914	Bos_taurus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	42.358	ENSCJAG00000046750	POP4	98	42.795	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000004305	pop4	61	49.655	ENSCAFG00000007630	POP4	82	49.664	Canis_familiaris
ENSEBUG00000004305	pop4	100	40.773	ENSCHIG00000016743	POP4	100	40.773	Capra_hircus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.056	ENSTSYG00000003488	POP4	100	40.343	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000004305	pop4	98	33.945	ENSCAPG00000011105	POP4	99	33.945	Cavia_aperea
ENSEBUG00000004305	pop4	100	40.773	ENSCPOG00000002992	POP4	100	40.773	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	36.245	ENSCCAG00000034244	-	98	37.118	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	42.795	ENSCCAG00000020285	-	98	42.795	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.128	ENSCATG00000036022	POP4	91	56.322	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000004305	pop4	100	40.773	ENSCLAG00000013162	POP4	100	40.773	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000004305	pop4	99	42.609	ENSCSAG00000004868	POP4	100	42.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000004305	pop4	81	55.263	ENSCHOG00000002071	POP4	77	55.263	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000004305	pop4	91	41.429	ENSCPBG00000016132	POP4	90	41.429	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000004305	pop4	91	44.498	ENSCANG00000005924	POP4	98	44.762	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.918	ENSCGRG00001017185	Pop4	100	42.918	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.918	ENSCGRG00000008155	Pop4	100	42.918	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000004305	pop4	62	44.898	ENSCSEG00000002946	pop4	67	44.898	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000004305	pop4	96	32.701	ENSCVAG00000018602	POP4	91	31.280	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000004305	pop4	90	40.865	ENSDARG00000101472	pop4	88	41.346	Danio_rerio
ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.611	ENSDNOG00000047663	POP4	87	41.048	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000004305	pop4	78	38.587	ENSDORG00000008577	Pop4	99	39.674	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000004305	pop4	99	33.478	ENSETEG00000003607	POP4	100	33.913	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000004305	pop4	100	51.923	ENSECAG00000020206	POP4	82	51.923	Equus_caballus
ENSEBUG00000004305	pop4	92	39.336	ENSELUG00000019812	pop4	90	40.284	Esox_lucius
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.056	ENSFCAG00000001619	POP4	100	39.485	Felis_catus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	41.631	ENSFALG00000000206	POP4	98	42.060	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.914	ENSFDAG00000017859	POP4	100	40.343	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000004305	pop4	63	48.980	ENSFHEG00000012745	pop4	67	48.980	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000004305	pop4	74	45.087	ENSGMOG00000000335	pop4	74	48.649	Gadus_morhua
ENSEBUG00000004305	pop4	100	38.197	ENSGALG00000041972	POP4	92	39.574	Gallus_gallus
ENSEBUG00000004305	pop4	77	34.078	ENSGAFG00000003571	pop4	93	32.961	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000004305	pop4	61	49.655	ENSGACG00000014510	pop4	81	49.664	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000004305	pop4	91	41.905	ENSGAGG00000024544	POP4	71	42.381	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000004305	pop4	98	42.358	ENSGGOG00000038346	POP4	98	42.795	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000004305	pop4	94	40.541	ENSHBUG00000021821	pop4	95	39.189	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000004305	pop4	98	41.048	ENSHGLG00000015798	POP4	98	41.485	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000004305	pop4	98	41.048	ENSHGLG00100009737	POP4	98	41.485	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000004305	pop4	91	39.437	ENSHCOG00000020937	pop4	68	44.371	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000004305	pop4	90	41.546	ENSIPUG00000013652	pop4	88	41.546	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSSTOG00000011016	POP4	100	42.489	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	42.358	ENSJJAG00000013376	Pop4	100	42.918	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004305	pop4	92	41.706	ENSKMAG00000012250	pop4	90	41.038	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000004305	pop4	61	46.207	ENSLBEG00000014139	pop4	90	37.089	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000004305	pop4	61	46.207	ENSLBEG00000018846	-	90	37.559	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000004305	pop4	91	40.952	ENSLACG00000008581	POP4	89	41.905	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000004305	pop4	92	39.810	ENSLOCG00000005597	pop4	90	40.284	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	41.921	ENSLAFG00000000084	POP4	98	41.921	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSMFAG00000029606	POP4	100	42.489	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSMMUG00000017424	POP4	100	42.489	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSMNEG00000031374	POP4	100	42.489	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSMLEG00000043454	POP4	100	42.553	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000004305	pop4	63	50.000	ENSMAMG00000011716	pop4	98	39.485	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.435	ENSMZEG00005002360	pop4	98	39.130	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000004305	pop4	99	39.224	ENSMGAG00000005337	POP4	98	39.655	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.918	ENSMAUG00000020110	Pop4	100	43.777	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	41.921	ENSMICG00000035730	POP4	97	42.424	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	36.245	ENSMMOG00000015321	pop4	98	36.681	Mola_mola
ENSEBUG00000004305	pop4	98	38.865	ENSMODG00000029406	POP4	94	39.301	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000004305	pop4	100	38.428	ENSMALG00000012571	pop4	98	39.565	Monopterus_albus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.918	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	100	42.616	Mus_caroli
ENSEBUG00000004305	pop4	100	43.348	ENSMUSG00000030423	Pop4	100	42.616	Mus_musculus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.489	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	100	43.404	Mus_spretus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	36.957	ENSMPUG00000008063	-	98	36.957	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.914	ENSMPUG00000008041	-	100	39.914	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000004305	pop4	98	32.174	ENSMLUG00000010774	POP4	98	32.174	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000004305	pop4	52	44.000	ENSMEUG00000003636	-	100	44.000	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000004305	pop4	92	43.868	ENSOPRG00000004736	POP4	99	43.868	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000004305	pop4	98	41.048	ENSODEG00000013025	POP4	96	41.048	Octodon_degus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.000	ENSONIG00000003458	pop4	96	38.696	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.489	ENSOCUG00000015974	POP4	100	42.918	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000004305	pop4	92	40.094	ENSORLG00000020317	pop4	67	46.980	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.130	ENSORLG00015011624	pop4	98	37.826	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000004305	pop4	100	37.391	ENSOMEG00000002538	pop4	98	36.522	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000004305	pop4	99	40.948	ENSOGAG00000011168	POP4	99	41.453	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000004305	pop4	100	40.598	ENSOARG00000004041	POP4	100	40.598	Ovis_aries
ENSEBUG00000004305	pop4	100	41.631	ENSPPAG00000040372	POP4	100	42.060	Pan_paniscus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.056	ENSPPRG00000010502	POP4	100	39.485	Panthera_pardus
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.056	ENSPTIG00000016598	POP4	100	39.485	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000004305	pop4	100	41.631	ENSPTRG00000010779	POP4	100	42.060	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSPANG00000008546	POP4	100	42.489	Papio_anubis
ENSEBUG00000004305	pop4	90	41.346	ENSPKIG00000004468	pop4	86	41.546	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000004305	pop4	91	42.381	ENSPSIG00000015690	POP4	98	42.857	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000004305	pop4	91	40.191	ENSPMGG00000008608	pop4	96	40.758	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000004305	pop4	99	41.558	ENSPEMG00000014034	-	98	41.778	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000004305	pop4	99	39.819	ENSPEMG00000019982	-	100	39.819	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000004305	pop4	62	53.741	ENSPMAG00000006265	pop4	75	54.054	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	41.048	ENSPCIG00000024738	POP4	94	41.048	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000004305	pop4	97	37.220	ENSPFOG00000000925	pop4	67	46.980	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000004305	pop4	68	45.000	ENSPLAG00000003161	pop4	67	46.980	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000004305	pop4	97	37.220	ENSPMEG00000002475	pop4	67	46.980	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000004305	pop4	68	44.375	ENSPREG00000022403	pop4	65	46.309	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000004305	pop4	100	41.631	ENSPPYG00000009805	POP4	100	42.060	Pongo_abelii
ENSEBUG00000004305	pop4	99	41.558	ENSPCAG00000007737	POP4	99	41.558	Procavia_capensis
ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.914	ENSPCOG00000018055	POP4	100	39.914	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000004305	pop4	100	41.631	ENSPVAG00000006069	POP4	100	41.631	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.435	ENSPNYG00000020038	pop4	98	39.130	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000004305	pop4	90	41.063	ENSPNAG00000005591	pop4	88	40.865	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.918	ENSRNOG00000027646	Pop4	100	42.616	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000004305	pop4	78	40.761	ENSRBIG00000044769	POP4	89	41.304	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000004305	pop4	100	42.060	ENSRROG00000028903	POP4	100	42.489	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000004305	pop4	98	42.795	ENSSBOG00000032445	POP4	98	42.795	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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