EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000004405 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eral1
Alias: si:ch211-207c6.1
Full Name: Era-like 12S mitochondrial rRNA chaperone 1
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 72180 bases
Position: chrFYBX02010182.1:1216362-1288541
Accession: ZDB-GENE-060526-84
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000006690	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-08	1	1
ENSEBUP00000006690	MMR_HSR1	PF01926.23	7.9e-21	1	1
ENSEBUP00000006666	MMR_HSR1	PF01926.23	9.6e-21	1	1
ENSEBUP00000006701	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000007126	-	4777	-	ENSEBUP00000006666	459 (aa)	-	-
ENSEBUT00000007163	-	2015	-	ENSEBUP00000006701	469 (aa)	-	-
ENSEBUT00000007151	-	4627	-	ENSEBUP00000006690	409 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000004405's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000004405's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.400	ENSG00000132591	ERAL1	99	54.430	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004405	eral1	88	42.019	ENSAPOG00000000093	eral1	92	42.019	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.011	ENSAMEG00000004602	ERAL1	80	48.138	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000004405	eral1	90	42.424	ENSACIG00000011545	eral1	93	42.424	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000004405	eral1	90	42.958	ENSAOCG00000014398	eral1	92	42.958	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000004405	eral1	90	42.791	ENSAPEG00000015466	eral1	92	42.791	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000004405	eral1	99	41.737	ENSATEG00000005857	eral1	100	41.597	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000004405	eral1	75	46.631	ENSAPLG00000014894	ERAL1	99	46.631	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.867	ENSANAG00000022216	-	79	45.867	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000004405	eral1	93	41.309	ENSACLG00000006437	eral1	96	41.309	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000004405	eral1	81	44.588	ENSAMXG00000037957	eral1	83	45.812	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.533	ENSBTAG00000015639	ERAL1	79	48.533	Bos_taurus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.200	ENSCJAG00000045605	ERAL1	79	47.200	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000004405	eral1	87	46.154	ENSCAFG00000018813	ERAL1	86	46.154	Canis_familiaris
ENSEBUG00000004405	eral1	87	46.154	ENSCAFG00020011718	ERAL1	86	46.154	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.267	ENSCHIG00000021850	ERAL1	79	48.267	Capra_hircus
ENSEBUG00000004405	eral1	80	47.453	ENSTSYG00000007492	ERAL1	79	47.453	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.676	ENSCPOG00000009576	ERAL1	79	45.676	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000004405	eral1	59	45.238	ENSCCAG00000031032	-	99	45.238	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.933	ENSCCAG00000036226	-	79	46.933	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.486	ENSCATG00000041378	ERAL1	79	46.486	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000004405	eral1	76	43.539	ENSCLAG00000004778	ERAL1	99	52.308	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.400	ENSCSAG00000007105	ERAL1	79	46.400	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000004405	eral1	80	42.821	ENSCPBG00000020222	ERAL1	77	42.821	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000004405	eral1	73	31.657	ENSCING00000003676	-	89	31.657	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.486	ENSCANG00000028131	ERAL1	79	46.486	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.600	ENSCGRG00001016601	Eral1	79	45.600	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.600	ENSCGRG00000002004	Eral1	79	45.600	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000004405	eral1	82	44.180	ENSCSEG00000016147	eral1	86	44.444	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000004405	eral1	81	44.935	ENSCVAG00000013714	eral1	82	44.935	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	44.504	ENSDARG00000059887	eral1	81	44.504	Danio_rerio
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.486	ENSDNOG00000044554	ERAL1	79	46.486	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.133	ENSDORG00000011319	Eral1	80	46.133	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000004405	eral1	75	30.233	FBgn0038106	CG7488	82	30.233	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000004405	eral1	64	44.361	ENSETEG00000011551	ERAL1	74	45.247	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.989	ENSEASG00005009864	ERAL1	80	47.989	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.849	ENSECAG00000013325	ERAL1	80	47.849	Equus_caballus
ENSEBUG00000004405	eral1	64	43.144	ENSEEUG00000005568	ERAL1	62	43.144	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000004405	eral1	79	44.032	ENSELUG00000021860	eral1	80	43.570	Esox_lucius
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.568	ENSFCAG00000005232	ERAL1	79	47.568	Felis_catus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.583	ENSFALG00000006357	ERAL1	98	47.583	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000004405	eral1	76	46.328	ENSFDAG00000001767	ERAL1	98	57.692	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000004405	eral1	88	38.621	ENSFHEG00000012028	eral1	92	39.770	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000004405	eral1	60	54.938	ENSGMOG00000014198	eral1	81	54.938	Gadus_morhua
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.570	ENSGALG00000003995	ERAL1	85	45.570	Gallus_gallus
ENSEBUG00000004405	eral1	83	44.301	ENSGAFG00000013837	eral1	83	44.301	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000004405	eral1	79	47.238	ENSGACG00000020251	eral1	99	60.870	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000004405	eral1	79	42.466	ENSGAGG00000023159	ERAL1	92	42.466	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000004405	eral1	67	42.173	ENSGGOG00000015953	ERAL1	77	42.173	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000004405	eral1	93	41.309	ENSHBUG00000022014	eral1	96	41.309	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000004405	eral1	81	44.865	ENSHGLG00000009773	ERAL1	79	44.865	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000004405	eral1	81	44.865	ENSHGLG00100018820	ERAL1	79	44.865	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000004405	eral1	80	44.504	ENSHCOG00000009314	eral1	84	44.504	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000004405	eral1	95	42.163	ENSIPUG00000013409	eral1	98	42.035	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.333	ENSSTOG00000003459	ERAL1	81	44.764	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000004405	eral1	53	50.000	ENSJJAG00000002041	-	96	50.000	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004405	eral1	64	41.860	ENSJJAG00000014664	-	95	41.860	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004405	eral1	93	42.539	ENSKMAG00000012520	eral1	96	42.539	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.825	ENSLBEG00000016447	eral1	82	47.493	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.982	ENSLACG00000012328	ERAL1	91	46.982	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000004405	eral1	80	43.750	ENSLOCG00000003302	eral1	84	42.494	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.722	ENSLAFG00000005438	ERAL1	80	45.722	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.216	ENSMFAG00000000501	ERAL1	79	46.216	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.216	ENSMMUG00000002776	ERAL1	67	46.216	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000004405	eral1	80	46.524	ENSMNEG00000039112	ERAL1	79	46.524	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.486	ENSMLEG00000040246	ERAL1	79	46.486	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000004405	eral1	82	46.891	ENSMAMG00000006623	eral1	83	46.891	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000004405	eral1	93	41.309	ENSMZEG00005000255	eral1	96	41.309	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000004405	eral1	80	45.547	ENSMGAG00000012769	ERAL1	99	45.547	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000004405	eral1	62	45.560	ENSMAUG00000001516	Eral1	72	45.560	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.505	ENSMICG00000005345	ERAL1	80	46.505	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.092	ENSMOCG00000022786	Eral1	79	46.092	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000004405	eral1	78	44.715	ENSMMOG00000005143	eral1	89	44.715	Mola_mola
ENSEBUG00000004405	eral1	89	45.388	ENSMODG00000019305	ERAL1	93	45.388	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000004405	eral1	88	40.777	ENSMALG00000013394	eral1	93	45.576	Monopterus_albus
ENSEBUG00000004405	eral1	82	47.480	MGP_CAROLIEiJ_G0016788	Eral1	81	47.480	Mus_caroli
ENSEBUG00000004405	eral1	82	46.597	ENSMUSG00000020832	Eral1	81	46.597	Mus_musculus
ENSEBUG00000004405	eral1	82	42.971	MGP_PahariEiJ_G0017925	Eral1	80	42.971	Mus_pahari
ENSEBUG00000004405	eral1	82	47.215	MGP_SPRETEiJ_G0017631	Eral1	81	47.215	Mus_spretus
ENSEBUG00000004405	eral1	80	48.108	ENSMPUG00000014146	ERAL1	79	48.108	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.128	ENSMLUG00000013467	ERAL1	79	48.128	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.667	ENSNGAG00000019318	Eral1	80	46.667	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000004405	eral1	93	41.084	ENSNBRG00000015799	eral1	96	41.084	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.867	ENSNLEG00000002994	ERAL1	79	45.867	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000004405	eral1	80	47.978	ENSMEUG00000015582	ERAL1	85	47.978	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.108	ENSOPRG00000014488	ERAL1	79	48.108	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000004405	eral1	76	41.477	ENSODEG00000011337	ERAL1	99	46.269	Octodon_degus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.032	ENSONIG00000012792	eral1	88	46.032	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.027	ENSOCUG00000005572	ERAL1	79	47.027	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000004405	eral1	90	42.518	ENSORLG00000011440	eral1	93	42.529	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000004405	eral1	99	41.525	ENSORLG00020018272	eral1	93	42.529	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000004405	eral1	99	42.161	ENSORLG00015001511	eral1	93	43.218	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000004405	eral1	93	40.503	ENSOMEG00000007662	eral1	94	44.700	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.297	ENSOGAG00000011082	ERAL1	79	47.297	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.267	ENSOARG00000004456	ERAL1	73	48.267	Ovis_aries
ENSEBUG00000004405	eral1	56	44.656	ENSPPAG00000033864	-	91	44.656	Pan_paniscus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.838	ENSPPRG00000006097	ERAL1	79	47.838	Panthera_pardus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.568	ENSPTIG00000013961	ERAL1	79	47.568	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.400	ENSPTRG00000008938	ERAL1	79	46.400	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.757	ENSPANG00000023400	ERAL1	79	46.757	Papio_anubis
ENSEBUG00000004405	eral1	79	45.405	ENSPKIG00000016278	eral1	79	46.832	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000004405	eral1	80	43.970	ENSPSIG00000007018	ERAL1	91	43.970	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000004405	eral1	90	43.560	ENSPMGG00000007387	eral1	92	43.560	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000004405	eral1	86	43.829	ENSPEMG00000000668	Eral1	85	43.829	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000004405	eral1	77	48.876	ENSPMAG00000008076	eral1	98	48.876	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000004405	eral1	83	44.819	ENSPFOG00000018592	eral1	93	44.819	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000004405	eral1	83	44.819	ENSPLAG00000022753	eral1	83	44.819	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000004405	eral1	83	44.819	ENSPMEG00000018207	eral1	83	44.819	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000004405	eral1	83	44.301	ENSPREG00000006895	eral1	86	44.301	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.400	ENSPPYG00000008113	ERAL1	79	46.400	Pongo_abelii
ENSEBUG00000004405	eral1	82	47.745	ENSPCAG00000003013	ERAL1	81	47.215	Procavia_capensis
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.757	ENSPCOG00000023179	ERAL1	80	46.505	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000004405	eral1	81	48.670	ENSPVAG00000001796	ERAL1	79	48.670	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000004405	eral1	93	41.497	ENSPNYG00000017330	eral1	95	41.497	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000004405	eral1	81	44.681	ENSPNAG00000009960	eral1	83	44.681	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000004405	eral1	82	45.745	ENSRNOG00000010673	Eral1	81	45.745	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.297	ENSRBIG00000006150	ERAL1	79	47.297	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.568	ENSRROG00000026778	ERAL1	79	47.568	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000004405	eral1	80	51.499	ENSSHAG00000014995	ERAL1	92	51.499	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000004405	eral1	78	45.902	ENSSFOG00015015511	eral1	90	45.902	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000004405	eral1	93	40.980	ENSSMAG00000000305	eral1	96	40.980	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.026	ENSSDUG00000017121	eral1	82	45.026	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000004405	eral1	81	45.026	ENSSLDG00000019349	eral1	82	45.026	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000004405	eral1	87	44.776	ENSSARG00000010129	ERAL1	86	44.776	Sorex_araneus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	43.548	ENSSPUG00000005676	ERAL1	100	53.390	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000004405	eral1	90	42.593	ENSSPAG00000018370	eral1	92	42.593	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000004405	eral1	81	49.326	ENSSSCG00000017776	ERAL1	79	49.326	Sus_scrofa
ENSEBUG00000004405	eral1	80	40.458	ENSTGUG00000006210	ERAL1	99	40.458	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000004405	eral1	78	46.739	ENSTRUG00000000660	eral1	80	46.739	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000004405	eral1	64	50.847	ENSTNIG00000008531	eral1	98	60.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000004405	eral1	81	41.622	ENSTBEG00000007215	ERAL1	79	41.622	Tupaia_belangeri
ENSEBUG00000004405	eral1	81	47.838	ENSTTRG00000004107	ERAL1	79	47.838	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000004405	eral1	80	47.059	ENSUAMG00000015904	ERAL1	79	47.059	Ursus_americanus
ENSEBUG00000004405	eral1	80	47.594	ENSUMAG00000011679	ERAL1	79	47.594	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000004405	eral1	66	44.918	ENSVPAG00000006626	ERAL1	76	44.918	Vicugna_pacos
ENSEBUG00000004405	eral1	87	46.020	ENSVVUG00000017651	ERAL1	86	46.020	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000004405	eral1	81	46.419	ENSXETG00000019633	eral1	93	46.419	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000004405	eral1	80	45.669	ENSXCOG00000005705	eral1	83	45.103	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000004405	eral1	80	45.144	ENSXMAG00000005455	eral1	81	44.588	Xiphophorus_maculatus