EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000004494 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 55803 bases
Position: chrFYBX02010762.1:690794-746596
Accession: ZDB-GENE-060929-688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000006845	Wyosine_form	PF08608.12	1.5e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000007308	-	1434	-	ENSEBUP00000006845	477 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000004494's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000004494's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	73.611	ENSG00000198874	TYW1	65	73.611	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	71.296	ENSG00000277149	TYW1B	65	71.296	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	ENSAPOG00000014391	tyw1	63	74.074	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	73.148	ENSACIG00000007325	tyw1	60	73.148	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	ENSAOCG00000016792	tyw1	57	73.611	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000004494	tyw1	93	71.622	ENSAPEG00000015939	tyw1	66	71.622	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000004494	tyw1	77	75.862	ENSATEG00000006856	tyw1	50	75.862	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.222	ENSANAG00000037051	-	59	72.222	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	ENSACLG00000018688	tyw1	58	73.611	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000004494	tyw1	74	72.222	ENSAMXG00000004157	tyw1	65	72.222	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.759	ENSBTAG00000008446	TYW1	59	71.759	Bos_taurus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	72.685	ENSCJAG00000004295	-	60	72.685	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	73.611	ENSCAFG00000010867	-	58	73.611	Canis_familiaris
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	73.611	ENSCAFG00020005367	-	65	73.611	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.222	ENSCHIG00000019510	-	59	72.222	Capra_hircus
ENSEBUG00000004494	tyw1	76	78.322	ENSTSYG00000008236	-	62	78.322	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	ENSCAPG00000013569	-	70	72.685	Cavia_aperea
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.222	ENSCPOG00000011182	-	60	72.222	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000004494	tyw1	95	68.619	ENSCCAG00000026643	-	62	68.619	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSCATG00000043677	-	65	72.685	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	ENSCLAG00000006321	-	59	72.685	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000004494	tyw1	78	68.776	ENSCSAG00000018274	-	56	68.776	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.148	ENSCPBG00000014896	-	57	73.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000004494	tyw1	68	67.317	ENSCING00000004125	-	65	67.317	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000004494	tyw1	71	62.679	ENSCSAVG00000005712	-	69	61.927	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSCANG00000033209	-	60	72.685	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	ENSCSEG00000005810	tyw1	58	74.074	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000004494	tyw1	77	77.931	ENSCVAG00000001054	tyw1	51	77.931	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	96	67.511	ENSDARG00000062987	tyw1	60	67.511	Danio_rerio
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSDNOG00000024165	-	59	72.685	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000004494	tyw1	87	70.370	ENSDORG00000014772	Tyw1	63	70.370	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	74.074	ENSEASG00005008818	-	59	74.074	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	ENSECAG00000023164	-	65	74.074	Equus_caballus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	73.148	ENSELUG00000008449	tyw1	59	73.148	Esox_lucius
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	75.463	ENSFCAG00000014262	-	65	75.463	Felis_catus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	68.056	ENSFALG00000013810	-	59	68.056	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.163	ENSFDAG00000013270	-	59	71.163	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000004494	tyw1	88	72.685	ENSFHEG00000020824	tyw1	56	72.685	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	ENSGALG00000001110	-	58	72.685	Gallus_gallus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.537	ENSGACG00000012692	tyw1	60	74.537	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.148	ENSGAGG00000022393	-	60	73.148	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000004494	tyw1	75	56.643	ENSGGOG00000001473	TYW1	58	56.643	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	ENSHBUG00000002640	tyw1	58	73.611	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000004494	tyw1	87	71.296	ENSHGLG00000012093	-	69	71.296	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.296	ENSHGLG00100011743	TYW1	59	71.296	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000004494	tyw1	77	70.833	ENSHCOG00000019949	tyw1	53	70.833	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	72.222	ENSIPUG00000016330	tyw1	57	72.222	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	ENSSTOG00000004067	-	55	72.685	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.833	ENSJJAG00000022959	Tyw1	66	70.833	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	ENSKMAG00000018599	tyw1	58	73.611	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.296	ENSLACG00000018917	tyw1	60	71.296	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	70.833	ENSLOCG00000004035	tyw1	58	70.833	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSMFAG00000035457	-	60	72.685	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSMMUG00000030374	-	66	72.685	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSMNEG00000041992	-	60	72.685	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSMLEG00000039741	-	60	72.685	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.537	ENSMAMG00000016089	tyw1	63	74.537	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	93	72.072	ENSMZEG00005024386	tyw1	63	72.072	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.222	ENSMGAG00000002176	-	59	72.222	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	70.833	ENSMAUG00000002959	Tyw1	67	70.833	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.222	ENSMICG00000014374	-	66	72.222	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	71.296	ENSMOCG00000017720	Tyw1	60	71.296	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000004494	tyw1	93	74.537	ENSMMOG00000005064	tyw1	63	74.537	Mola_mola
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	75.000	ENSMODG00000025697	-	60	75.000	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	ENSMALG00000010238	tyw1	57	72.685	Monopterus_albus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.833	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	60	70.833	Mus_caroli
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.833	ENSMUSG00000056310	Tyw1	60	70.833	Mus_musculus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	71.759	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	59	71.759	Mus_pahari
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.833	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	60	70.833	Mus_spretus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSMPUG00000016191	-	61	72.685	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000004494	tyw1	94	75.000	ENSMLUG00000013582	-	61	75.000	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	69.907	ENSNGAG00000002742	Tyw1	61	69.907	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000004494	tyw1	83	72.072	ENSNBRG00000016996	tyw1	59	72.072	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.370	ENSNLEG00000013210	-	65	70.370	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000004494	tyw1	83	67.143	ENSOPRG00000008734	-	51	67.143	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000004494	tyw1	93	72.558	ENSODEG00000014729	-	68	72.558	Octodon_degus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	ENSONIG00000005872	tyw1	58	73.611	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	73.148	ENSOCUG00000003173	-	58	73.148	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSORLG00000001393	tyw1	57	72.685	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.222	ENSORLG00020019361	tyw1	60	72.222	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSORLG00015008095	tyw1	65	72.685	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.759	ENSOGAG00000016555	-	59	71.759	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.585	ENSOARG00000010673	-	58	73.585	Ovis_aries
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	75.926	ENSPPRG00000004945	-	65	75.926	Panthera_pardus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	75.926	ENSPTIG00000019545	-	65	75.926	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000004494	tyw1	89	70.283	ENSPTRG00000023076	TYW1B	66	70.283	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.222	ENSPANG00000019053	-	65	72.222	Papio_anubis
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.370	ENSPKIG00000006545	tyw1	58	70.370	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000004494	tyw1	93	72.685	ENSPMGG00000004240	tyw1	63	72.685	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.833	ENSPEMG00000008274	Tyw1	60	70.833	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.074	ENSPFOG00000015855	tyw1	59	74.074	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.537	ENSPLAG00000000838	tyw1	59	74.537	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	ENSPMEG00000019437	tyw1	64	74.074	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	ENSPREG00000018773	tyw1	60	74.074	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSPPYG00000017514	TYW1	60	72.685	Pongo_abelii
ENSEBUG00000004494	tyw1	64	72.727	ENSPCOG00000015294	-	63	63.819	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	73.611	ENSPNYG00000022381	tyw1	58	73.611	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000004494	tyw1	95	73.611	ENSPNAG00000009001	tyw1	61	73.611	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	ENSRNOG00000024352	Tyw1	60	72.685	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSRBIG00000039619	-	60	72.685	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSRROG00000039780	-	60	72.685	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	70.833	ENSSBOG00000025873	-	60	70.833	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	74.074	ENSSHAG00000010346	-	61	74.074	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	71.759	ENSSFOG00015001054	tyw1	64	71.759	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.759	ENSSMAG00000020514	tyw1	57	71.759	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.074	ENSSDUG00000001552	tyw1	61	74.074	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.537	ENSSLDG00000003554	tyw1	58	74.537	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	71.296	ENSSPUG00000002715	-	60	71.296	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	73.148	ENSSSCG00000007733	-	60	73.148	Sus_scrofa
ENSEBUG00000004494	tyw1	77	76.351	ENSTGUG00000003428	-	54	76.351	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	72.685	ENSTRUG00000016107	tyw1	56	72.685	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000004494	tyw1	92	75.000	ENSTNIG00000018999	tyw1	66	75.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	73.611	ENSUMAG00000015343	-	59	73.611	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000004494	tyw1	90	72.685	ENSVVUG00000016457	-	58	72.685	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	68.981	ENSXETG00000010094	tyw1	59	68.981	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.074	ENSXMAG00000013125	tyw1	62	74.074	Xiphophorus_maculatus