EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000004670 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: hrasb
Alias: hrasl|zgc:110734
Full Name: -Ha-ras Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog b
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35568 bases
Position: chrFYBX02010718.1:562446-598013
Accession: ZDB-GENE-050522-466
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000007120	MMR_HSR1	PF01926.23	3.9e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000007591	-	1383	-	ENSEBUP00000007120	189 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000004670	hrasb	85	36.810	ENSEBUG00000015886	-	80	36.810
ENSEBUG00000004670	hrasb	85	34.568	ENSEBUG00000007493	rab11a	69	33.333
ENSEBUG00000004670	hrasb	87	55.882	ENSEBUG00000014186	-	76	55.882
ENSEBUG00000004670	hrasb	87	31.395	ENSEBUG00000009003	-	75	31.395
ENSEBUG00000004670	hrasb	89	89.349	ENSEBUG00000015012	kras	90	89.349
ENSEBUG00000004670	hrasb	93	30.899	ENSEBUG00000014794	rab5c	83	30.899
ENSEBUG00000004670	hrasb	84	36.875	ENSEBUG00000003784	rhebl1	84	36.765
ENSEBUG00000004670	hrasb	84	33.742	ENSEBUG00000004967	rab9b	74	31.579
ENSEBUG00000004670	hrasb	75	37.063	ENSEBUG00000010861	-	52	34.848
ENSEBUG00000004670	hrasb	85	35.185	ENSEBUG00000011775	rab11ba	72	34.000
ENSEBUG00000004670	hrasb	98	54.167	ENSEBUG00000011510	-	94	54.167
ENSEBUG00000004670	hrasb	83	31.646	ENSEBUG00000000963	-	87	31.613
ENSEBUG00000004670	hrasb	84	37.500	ENSEBUG00000002306	rheb	81	37.584
ENSEBUG00000004670	hrasb	85	34.568	ENSEBUG00000015447	-	69	33.333
ENSEBUG00000004670	hrasb	92	31.429	ENSEBUG00000015845	-	73	30.488

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSG00000174775	HRAS	100	90.476	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSAPOG00000023684	hrasb	100	89.947	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSAMEG00000010515	HRAS	75	89.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSACIG00000000699	hrasb	100	89.947	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSAOCG00000011843	hrasb	100	89.947	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSAPEG00000009546	hrasb	100	89.947	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSATEG00000020001	hrasb	100	89.947	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000004670	hrasb	87	96.951	ENSAPLG00000012248	HRAS	100	96.951	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSACAG00000014920	HRAS	100	90.476	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSANAG00000034201	HRAS	100	90.476	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSACLG00000001181	hrasb	100	89.418	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSAMXG00000035885	hrasa	100	89.947	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	91.005	ENSAMXG00000033907	hrasb	100	91.005	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	88.889	ENSBTAG00000046644	HRAS	100	88.889	Bos_taurus
ENSEBUG00000004670	hrasb	97	75.956	WBGene00002335	let-60	99	75.956	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCJAG00000012199	HRAS	100	90.476	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000004670	hrasb	79	96.667	ENSCAFG00000031029	HRAS	60	96.667	Canis_familiaris
ENSEBUG00000004670	hrasb	88	96.407	ENSCAFG00020007059	HRAS	89	96.689	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSCHIG00000004808	HRAS	100	89.418	Capra_hircus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSTSYG00000003745	HRAS	100	90.476	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSCAPG00000000745	HRAS	100	89.947	Cavia_aperea
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSCPOG00000000101	HRAS	100	89.947	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCCAG00000031453	HRAS	100	90.476	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCATG00000031194	HRAS	100	90.476	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCLAG00000002823	HRAS	100	90.476	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCSAG00000011033	HRAS	100	90.476	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCPBG00000013941	-	100	90.476	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCANG00000017827	HRAS	100	90.476	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCGRG00001018735	Hras	100	90.476	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSCGRG00000010918	Hras	100	90.476	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSCSEG00000007927	hrasb	100	89.947	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSCVAG00000008670	hrasb	100	89.947	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	91.005	ENSDARG00000005651	hrasb	100	96.528	Danio_rerio
ENSEBUG00000004670	hrasb	99	80.749	ENSDARG00000013161	zgc:55558	89	89.222	Danio_rerio
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSDARG00000098497	hrasa	100	89.418	Danio_rerio
ENSEBUG00000004670	hrasb	99	89.362	ENSDNOG00000015293	HRAS	99	89.362	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSDORG00000028079	Hras	100	90.476	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000004670	hrasb	92	80.226	FBgn0003205	Ras85D	94	80.226	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSETEG00000019899	HRAS	100	89.947	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSECAG00000008473	HRAS	100	89.947	Equus_caballus
ENSEBUG00000004670	hrasb	79	95.333	ENSEEUG00000014548	HRAS	87	95.333	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSELUG00000004712	HRAS	100	89.947	Esox_lucius
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSFCAG00000002990	HRAS	100	89.947	Felis_catus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSFALG00000012145	HRAS	100	90.476	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSFDAG00000006760	HRAS	100	90.476	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSFHEG00000010055	hrasb	100	89.418	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000004670	hrasb	94	91.573	ENSGMOG00000010196	hrasb	96	91.573	Gadus_morhua
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	91.005	ENSGALG00000029260	H-RAS	100	91.005	Gallus_gallus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSGAFG00000021814	hrasb	100	89.947	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSGACG00000011340	hrasb	100	89.947	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSGAGG00000019886	-	100	90.476	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSGGOG00000015438	HRAS	100	89.947	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSHBUG00000011998	hrasb	100	89.418	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSHGLG00000004508	HRAS	100	90.476	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSHGLG00100012888	HRAS	100	90.476	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	91.005	ENSIPUG00000022502	hrasb	100	91.005	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSIPUG00000006053	hras	100	89.418	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSSTOG00000021206	HRAS	100	90.476	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	81.481	ENSJJAG00000011743	-	100	81.481	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSJJAG00000022529	-	100	90.476	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSKMAG00000001922	Ha-ras	100	89.947	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSLBEG00000001905	hrasb	100	89.947	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSLACG00000018427	HRAS	100	90.476	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSLOCG00000000684	hrasb	100	89.947	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMFAG00000039003	HRAS	100	90.476	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMMUG00000021659	HRAS	100	90.476	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMNEG00000039358	HRAS	100	90.476	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMLEG00000042070	HRAS	100	90.476	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSMAMG00000004359	hrasb	100	89.947	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSMZEG00005017583	hrasb	100	89.418	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMAUG00000020006	Hras	100	90.476	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMICG00000006472	HRAS	100	90.476	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMOCG00000000744	Hras	100	90.476	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000004670	hrasb	79	96.000	ENSMODG00000016580	HRAS	71	96.000	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSMALG00000011273	hrasb	100	89.947	Monopterus_albus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	MGP_CAROLIEiJ_G0030681	Hras	100	89.947	Mus_caroli
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSMUSG00000025499	Hras	100	90.476	Mus_musculus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	MGP_PahariEiJ_G0013880	Hras	100	89.947	Mus_pahari
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	80.952	MGP_SPRETEiJ_G0031792	-	100	80.952	Mus_spretus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSNGAG00000022044	Hras	100	90.476	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSNLEG00000008300	HRAS	100	90.476	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSODEG00000015703	HRAS	100	90.476	Octodon_degus
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSONIG00000014560	hrasb	100	89.947	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000004670	hrasb	99	80.749	ENSORLG00000024443	zgc:55558	100	80.749	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSORLG00000018912	hrasb	100	89.418	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.418	ENSORLG00020008129	hras	100	89.418	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000004670	hrasb	99	80.749	ENSORLG00020013690	zgc:55558	100	80.749	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000004670	hrasb	99	80.749	ENSORLG00015003353	zgc:55558	100	80.749	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000004670	hrasb	99	81.283	ENSOMEG00000016685	zgc:55558	100	81.283	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	88.889	ENSOMEG00000018719	hrasb	100	88.889	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSOGAG00000024846	HRAS	100	90.476	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000004670	hrasb	79	96.000	ENSOARG00000007365	HRAS	99	96.000	Ovis_aries
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSPPAG00000028620	HRAS	100	90.476	Pan_paniscus
ENSEBUG00000004670	hrasb	79	96.667	ENSPPRG00000008185	HRAS	88	96.667	Panthera_pardus
ENSEBUG00000004670	hrasb	70	97.744	ENSPTIG00000006043	HRAS	100	97.744	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSPTRG00000034469	HRAS	100	90.476	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	ENSPANG00000016633	-	100	89.947	Papio_anubis
ENSEBUG00000004670	hrasb	100	90.476	ENSPANG00000008022	-	100	90.476	Papio_anubis
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