EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000004955 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 43469 bases
Position: chrFYBX02009806.1:518396-561864
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000007611	eRF1_2	PF03464.15	5.7e-14	1	1
ENSEBUP00000007611	eRF1_3	PF03465.15	4.9e-19	1	1
ENSEBUP00000007611	eRF1_1	PF03463.15	1.5e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000008098	-	816	-	ENSEBUP00000007611	271 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSG00000152684	PELO	71	81.287	Homo_sapiens
ENSEBUG00000004955	pelo	63	79.532	ENSAPOG00000000616	pelo	63	79.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSAPOG00000023072	pelo	71	79.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004955	pelo	63	79.532	ENSAPOG00000023700	-	63	79.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSAMEG00000007734	PELO	71	81.287	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000004955	pelo	87	77.778	ENSACIG00000014386	pelo	69	77.778	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSAOCG00000023717	pelo	71	79.532	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSAPEG00000011235	pelo	76	79.532	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSATEG00000019550	pelo	71	79.532	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000004955	pelo	75	45.926	ENSAPLG00000013265	PELO	94	46.667	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000004955	pelo	95	80.117	ENSACAG00000004352	PELO	71	80.117	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSANAG00000014096	PELO	71	81.287	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.778	ENSACLG00000010305	pelo	71	77.778	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000004955	pelo	95	74.731	ENSAMXG00000020299	pelo	74	74.731	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSBTAG00000003268	PELO	71	81.287	Bos_taurus
ENSEBUG00000004955	pelo	96	60.819	WBGene00011280	pelo-1	72	60.819	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCJAG00000035190	PELO	71	81.287	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCAFG00020023234	PELO	71	81.287	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	ENSCHIG00000016410	PELO	71	81.871	Capra_hircus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSTSYG00000005203	PELO	71	81.287	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCPOG00000027406	PELO	71	81.287	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCCAG00000035600	PELO	71	81.287	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCATG00000011829	PELO	71	81.287	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCLAG00000005043	PELO	71	81.287	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCSAG00000016692	PELO	71	81.287	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	76.757	ENSCHOG00000000523	PELO	74	76.757	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000004955	pelo	95	77.778	ENSCPBG00000007544	PELO	71	77.778	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000004955	pelo	95	71.345	ENSCING00000001979	-	71	71.345	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000004955	pelo	99	73.099	ENSCSAVG00000006158	-	72	73.099	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSCANG00000023382	PELO	71	81.287	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000004955	pelo	95	82.143	ENSCGRG00001024665	Pelo	71	82.143	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000004955	pelo	95	82.456	ENSCGRG00000004570	Pelo	71	82.456	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSCSEG00000008807	pelo	71	79.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSCVAG00000016082	pelo	71	79.532	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	75.269	ENSDARG00000055477	pelo	80	74.074	Danio_rerio
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSDNOG00000036721	PELO	71	81.287	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	ENSDORG00000016689	Pelo	71	81.871	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000004955	pelo	95	67.836	FBgn0011207	pelo	69	67.836	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSEASG00005013348	PELO	71	81.287	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.193	ENSELUG00000023229	pelo	71	77.193	Esox_lucius
ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.702	ENSFCAG00000032341	PELO	71	80.702	Felis_catus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.117	ENSFALG00000004559	PELO	71	80.117	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000004955	pelo	63	81.871	ENSFDAG00000002076	PELO	53	81.871	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSFHEG00000009769	pelo	74	79.532	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000004955	pelo	95	77.193	ENSGMOG00000005849	pelo	71	77.193	Gadus_morhua
ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.117	ENSGAFG00000019350	pelo	77	80.117	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	ENSGACG00000007245	pelo	91	79.532	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000004955	pelo	95	77.193	ENSGAGG00000004018	PELO	71	77.193	Gopherus_agassizii
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ENSEBUG00000004955	pelo	99	50.140	ENSHGLG00100017627	PELO	91	51.020	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000004955	pelo	100	78.947	ENSHCOG00000016782	pelo	71	78.947	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.947	ENSIPUG00000020627	pelo	71	78.947	Ictalurus_punctatus
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ENSEBUG00000004955	pelo	63	81.871	ENSJJAG00000015032	Pelo	71	81.871	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.193	ENSKMAG00000021305	pelo	71	77.193	Kryptolebias_marmoratus
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ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	71	81.871	Mus_pahari
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	71	81.871	Mus_spretus
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ENSEBUG00000004955	pelo	99	76.608	ENSORLG00020016456	pelo	71	76.608	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000004955	pelo	99	76.023	ENSORLG00015014447	pelo	74	76.048	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.778	ENSOMEG00000021567	pelo	71	77.778	Oryzias_melastigma
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ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.702	ENSPTIG00000019988	PELO	71	80.702	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSPTRG00000034409	PELO	71	81.287	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSPANG00000010902	PELO	71	81.287	Papio_anubis
ENSEBUG00000004955	pelo	99	74.731	ENSPKIG00000015190	pelo	74	74.731	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000004955	pelo	95	78.363	ENSPSIG00000004971	PELO	71	78.363	Pelodiscus_sinensis
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ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.871	ENSPEMG00000015584	Pelo	71	81.871	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	ENSRROG00000035507	PELO	71	81.287	Rhinopithecus_roxellana
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