EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000005258 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12523 bases
Position: chrFYBX02009556.1:1306311-1318833
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	1	7
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	2	7
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	3	7
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	4	7
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	5	7
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	6	7
ENSEBUP00000008083	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	7	7
ENSEBUP00000008083	zf-met	PF12874.7	1.8e-08	1	2
ENSEBUP00000008083	zf-met	PF12874.7	1.8e-08	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000008575	-	6923	-	ENSEBUP00000008083	392 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000005258's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000005258's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000005258	-	94	44.118	ENSEBUG00000009484	-	56	44.118
ENSEBUG00000005258	-	83	46.025	ENSEBUG00000003418	-	97	46.025
ENSEBUG00000005258	-	92	43.985	ENSEBUG00000005319	-	63	43.985
ENSEBUG00000005258	-	97	43.882	ENSEBUG00000005310	ZNF226	88	43.882
ENSEBUG00000005258	-	95	45.110	ENSEBUG00000008273	-	78	45.110
ENSEBUG00000005258	-	96	48.454	ENSEBUG00000014388	-	89	48.454
ENSEBUG00000005258	-	83	41.081	ENSEBUG00000007980	-	62	41.081
ENSEBUG00000005258	-	82	42.540	ENSEBUG00000002075	-	79	42.540
ENSEBUG00000005258	-	92	45.196	ENSEBUG00000012737	-	74	45.196
ENSEBUG00000005258	-	92	45.048	ENSEBUG00000003590	-	75	45.048
ENSEBUG00000005258	-	92	46.341	ENSEBUG00000000436	-	68	46.154
ENSEBUG00000005258	-	94	46.178	ENSEBUG00000003991	-	76	46.178
ENSEBUG00000005258	-	92	42.662	ENSEBUG00000016944	-	73	42.662
ENSEBUG00000005258	-	81	51.034	ENSEBUG00000006987	-	95	51.034
ENSEBUG00000005258	-	95	42.056	ENSEBUG00000011123	-	97	42.056
ENSEBUG00000005258	-	89	42.194	ENSEBUG00000001943	-	93	42.194
ENSEBUG00000005258	-	82	44.898	ENSEBUG00000007012	-	74	44.898
ENSEBUG00000005258	-	89	49.180	ENSEBUG00000010952	-	82	43.250
ENSEBUG00000005258	-	90	43.831	ENSEBUG00000011896	-	54	43.831
ENSEBUG00000005258	-	97	53.438	ENSEBUG00000009291	-	87	53.438
ENSEBUG00000005258	-	85	48.571	ENSEBUG00000015522	-	69	48.571
ENSEBUG00000005258	-	90	53.704	ENSEBUG00000006249	-	92	53.704
ENSEBUG00000005258	-	83	54.438	ENSEBUG00000008903	-	76	54.438
ENSEBUG00000005258	-	96	44.156	ENSEBUG00000016093	-	75	44.097
ENSEBUG00000005258	-	92	50.955	ENSEBUG00000006080	-	93	50.955
ENSEBUG00000005258	-	79	35.849	ENSEBUG00000016969	-	75	39.409
ENSEBUG00000005258	-	83	43.574	ENSEBUG00000001121	-	81	43.574
ENSEBUG00000005258	-	95	45.217	ENSEBUG00000014717	-	74	42.308
ENSEBUG00000005258	-	88	40.974	ENSEBUG00000003232	-	65	40.974
ENSEBUG00000005258	-	82	49.758	ENSEBUG00000003236	-	95	49.289
ENSEBUG00000005258	-	92	39.432	ENSEBUG00000007266	-	78	39.432
ENSEBUG00000005258	-	92	40.063	ENSEBUG00000010794	-	81	40.063
ENSEBUG00000005258	-	82	43.919	ENSEBUG00000009383	-	71	43.919
ENSEBUG00000005258	-	85	44.762	ENSEBUG00000007143	-	66	44.762
ENSEBUG00000005258	-	93	41.935	ENSEBUG00000003128	-	87	41.935
ENSEBUG00000005258	-	97	46.688	ENSEBUG00000006666	-	90	46.688
ENSEBUG00000005258	-	85	49.147	ENSEBUG00000007386	-	72	49.147
ENSEBUG00000005258	-	84	46.203	ENSEBUG00000015207	-	61	46.203
ENSEBUG00000005258	-	97	50.920	ENSEBUG00000005703	-	87	50.156
ENSEBUG00000005258	-	93	47.388	ENSEBUG00000012454	-	99	46.386
ENSEBUG00000005258	-	92	41.497	ENSEBUG00000011977	-	85	41.497
ENSEBUG00000005258	-	94	43.915	ENSEBUG00000001308	-	84	45.000
ENSEBUG00000005258	-	93	42.778	ENSEBUG00000013392	-	59	43.333
ENSEBUG00000005258	-	92	52.846	ENSEBUG00000015661	-	71	52.846
ENSEBUG00000005258	-	82	44.340	ENSEBUG00000013622	-	64	44.340
ENSEBUG00000005258	-	97	34.555	ENSEBUG00000016857	-	69	34.465
ENSEBUG00000005258	-	97	60.084	ENSEBUG00000010472	-	84	57.534
ENSEBUG00000005258	-	92	37.363	ENSEBUG00000013213	-	78	40.435
ENSEBUG00000005258	-	82	49.735	ENSEBUG00000012314	-	67	49.735
ENSEBUG00000005258	-	81	44.828	ENSEBUG00000003954	-	82	44.654
ENSEBUG00000005258	-	82	44.237	ENSEBUG00000007375	-	97	44.237
ENSEBUG00000005258	-	97	43.295	ENSEBUG00000011435	-	85	42.763
ENSEBUG00000005258	-	82	48.101	ENSEBUG00000010031	-	71	48.101
ENSEBUG00000005258	-	93	48.225	ENSEBUG00000011837	-	68	48.225
ENSEBUG00000005258	-	94	47.152	ENSEBUG00000006112	-	73	47.152
ENSEBUG00000005258	-	85	40.860	ENSEBUG00000012053	-	77	40.860
ENSEBUG00000005258	-	93	48.428	ENSEBUG00000008107	-	98	48.428
ENSEBUG00000005258	-	97	40.106	ENSEBUG00000002606	-	77	40.106
ENSEBUG00000005258	-	83	42.857	ENSEBUG00000003555	-	69	42.857
ENSEBUG00000005258	-	92	44.355	ENSEBUG00000015693	-	79	44.355
ENSEBUG00000005258	-	82	43.421	ENSEBUG00000002371	-	69	44.059
ENSEBUG00000005258	-	94	45.876	ENSEBUG00000006250	-	62	45.876
ENSEBUG00000005258	-	81	42.424	ENSEBUG00000016362	-	60	42.424
ENSEBUG00000005258	-	83	46.183	ENSEBUG00000006092	-	62	46.183
ENSEBUG00000005258	-	82	45.833	ENSEBUG00000012775	-	70	45.833
ENSEBUG00000005258	-	93	41.250	ENSEBUG00000017017	-	72	42.991
ENSEBUG00000005258	-	95	41.883	ENSEBUG00000010357	-	61	42.908
ENSEBUG00000005258	-	91	44.377	ENSEBUG00000011764	-	64	44.377
ENSEBUG00000005258	-	92	49.206	ENSEBUG00000015456	-	91	49.206
ENSEBUG00000005258	-	83	55.660	ENSEBUG00000008157	-	99	55.660
ENSEBUG00000005258	-	97	42.662	ENSEBUG00000015155	-	82	45.886
ENSEBUG00000005258	-	93	40.435	ENSEBUG00000015159	-	99	39.600
ENSEBUG00000005258	-	96	51.887	ENSEBUG00000014597	-	92	51.887
ENSEBUG00000005258	-	66	48.031	ENSEBUG00000011730	-	50	48.031
ENSEBUG00000005258	-	89	47.468	ENSEBUG00000004999	-	89	47.468
ENSEBUG00000005258	-	82	46.850	ENSEBUG00000004992	-	58	46.850
ENSEBUG00000005258	-	95	33.492	ENSEBUG00000003078	-	71	34.917
ENSEBUG00000005258	-	85	45.455	ENSEBUG00000014659	-	75	45.455
ENSEBUG00000005258	-	95	43.082	ENSEBUG00000012919	-	82	43.599
ENSEBUG00000005258	-	93	50.949	ENSEBUG00000007470	-	90	50.949
ENSEBUG00000005258	-	95	42.286	ENSEBUG00000002185	-	84	42.797
ENSEBUG00000005258	-	93	41.880	ENSEBUG00000013577	-	72	41.880
ENSEBUG00000005258	-	96	43.295	ENSEBUG00000013573	-	80	42.913
ENSEBUG00000005258	-	84	42.617	ENSEBUG00000014469	-	73	42.617
ENSEBUG00000005258	-	82	41.479	ENSEBUG00000007740	-	89	41.479
ENSEBUG00000005258	-	92	47.203	ENSEBUG00000014768	-	76	47.203
ENSEBUG00000005258	-	82	45.277	ENSEBUG00000009666	-	83	45.277
ENSEBUG00000005258	-	94	53.481	ENSEBUG00000012823	-	86	53.481
ENSEBUG00000005258	-	95	46.774	ENSEBUG00000002291	-	59	46.774
ENSEBUG00000005258	-	97	55.587	ENSEBUG00000015837	-	81	53.627
ENSEBUG00000005258	-	95	50.142	ENSEBUG00000015834	-	95	51.471
ENSEBUG00000005258	-	99	35.961	ENSEBUG00000011582	-	86	35.961
ENSEBUG00000005258	-	82	46.278	ENSEBUG00000008272	-	70	46.278
ENSEBUG00000005258	-	82	45.017	ENSEBUG00000008306	-	79	45.017
ENSEBUG00000005258	-	92	43.158	ENSEBUG00000002586	-	51	43.158
ENSEBUG00000005258	-	84	42.295	ENSEBUG00000009220	-	82	42.295
ENSEBUG00000005258	-	91	43.492	ENSEBUG00000013355	-	78	43.492
ENSEBUG00000005258	-	97	39.863	ENSEBUG00000014284	-	96	39.863
ENSEBUG00000005258	-	94	42.188	ENSEBUG00000014667	-	76	43.533
ENSEBUG00000005258	-	97	54.286	ENSEBUG00000016878	-	97	54.286
ENSEBUG00000005258	-	85	40.000	ENSEBUG00000010756	-	96	40.000
ENSEBUG00000005258	-	92	47.097	ENSEBUG00000007563	-	73	47.097
ENSEBUG00000005258	-	83	47.335	ENSEBUG00000011728	-	76	47.335
ENSEBUG00000005258	-	92	37.736	ENSEBUG00000004301	prdm5	73	37.736
ENSEBUG00000005258	-	98	41.317	ENSEBUG00000003842	-	90	40.588
ENSEBUG00000005258	-	83	51.042	ENSEBUG00000015110	-	69	51.042
ENSEBUG00000005258	-	83	47.423	ENSEBUG00000000642	-	78	47.423
ENSEBUG00000005258	-	96	44.969	ENSEBUG00000004011	-	90	44.969
ENSEBUG00000005258	-	96	45.211	ENSEBUG00000006702	-	73	44.983
ENSEBUG00000005258	-	81	43.922	ENSEBUG00000012704	-	69	43.902
ENSEBUG00000005258	-	81	45.249	ENSEBUG00000006847	-	77	45.249
ENSEBUG00000005258	-	99	46.835	ENSEBUG00000014309	-	86	46.835
ENSEBUG00000005258	-	82	43.046	ENSEBUG00000015953	-	65	43.046
ENSEBUG00000005258	-	82	45.638	ENSEBUG00000011751	-	73	45.638
ENSEBUG00000005258	-	82	42.475	ENSEBUG00000009330	-	57	42.475
ENSEBUG00000005258	-	92	52.960	ENSEBUG00000002454	-	89	52.960
ENSEBUG00000005258	-	94	52.667	ENSEBUG00000001525	-	86	52.667
ENSEBUG00000005258	-	82	46.296	ENSEBUG00000011112	-	80	46.296
ENSEBUG00000005258	-	82	47.876	ENSEBUG00000003512	-	75	46.082
ENSEBUG00000005258	-	97	52.215	ENSEBUG00000014648	-	79	52.215
ENSEBUG00000005258	-	92	47.634	ENSEBUG00000006212	-	88	47.634
ENSEBUG00000005258	-	92	40.752	ENSEBUG00000005264	-	80	42.138
ENSEBUG00000005258	-	97	62.232	ENSEBUG00000001826	-	75	62.232
ENSEBUG00000005258	-	84	43.172	ENSEBUG00000001329	-	95	43.172
ENSEBUG00000005258	-	82	46.980	ENSEBUG00000014730	-	59	46.980
ENSEBUG00000005258	-	95	36.875	ENSEBUG00000005186	-	82	40.498
ENSEBUG00000005258	-	97	44.237	ENSEBUG00000000704	-	88	44.237
ENSEBUG00000005258	-	97	52.850	ENSEBUG00000005655	-	84	52.850
ENSEBUG00000005258	-	86	46.617	ENSEBUG00000008991	-	79	46.617
ENSEBUG00000005258	-	95	49.221	ENSEBUG00000002537	-	98	49.221
ENSEBUG00000005258	-	97	46.417	ENSEBUG00000002146	-	87	46.417
ENSEBUG00000005258	-	96	57.033	ENSEBUG00000008988	ZNF845	93	57.033
ENSEBUG00000005258	-	97	52.366	ENSEBUG00000009909	-	87	52.366
ENSEBUG00000005258	-	93	41.714	ENSEBUG00000005816	-	71	41.714
ENSEBUG00000005258	-	97	44.550	ENSEBUG00000013157	-	82	44.904
ENSEBUG00000005258	-	97	58.182	ENSEBUG00000003573	-	77	54.839
ENSEBUG00000005258	-	92	41.083	ENSEBUG00000002032	-	78	41.456
ENSEBUG00000005258	-	96	41.176	ENSEBUG00000013221	-	85	41.176
ENSEBUG00000005258	-	96	46.795	ENSEBUG00000004841	-	81	46.795
ENSEBUG00000005258	-	95	42.903	ENSEBUG00000014050	-	78	44.548
ENSEBUG00000005258	-	98	50.779	ENSEBUG00000007308	ZNF845	99	50.779
ENSEBUG00000005258	-	96	48.276	ENSEBUG00000007305	-	92	48.276
ENSEBUG00000005258	-	86	49.141	ENSEBUG00000004026	-	65	49.141
ENSEBUG00000005258	-	92	42.958	ENSEBUG00000009436	-	96	42.958
ENSEBUG00000005258	-	96	44.410	ENSEBUG00000013683	-	99	44.410
ENSEBUG00000005258	-	82	44.059	ENSEBUG00000011065	-	80	44.059
ENSEBUG00000005258	-	82	42.715	ENSEBUG00000013875	-	81	44.248
ENSEBUG00000005258	-	91	45.408	ENSEBUG00000013874	-	77	45.408
ENSEBUG00000005258	-	82	47.022	ENSEBUG00000008792	-	88	47.022
ENSEBUG00000005258	-	92	43.348	ENSEBUG00000007797	-	77	43.671
ENSEBUG00000005258	-	97	48.227	ENSEBUG00000008852	ZNF845	79	50.755
ENSEBUG00000005258	-	95	43.043	ENSEBUG00000014888	-	94	43.043
ENSEBUG00000005258	-	82	46.460	ENSEBUG00000014227	-	51	46.460
ENSEBUG00000005258	-	92	47.170	ENSEBUG00000012502	-	84	47.170
ENSEBUG00000005258	-	96	42.793	ENSEBUG00000014677	-	87	42.000
ENSEBUG00000005258	-	82	41.615	ENSEBUG00000015993	-	66	41.615
ENSEBUG00000005258	-	92	44.845	ENSEBUG00000010878	-	51	44.845
ENSEBUG00000005258	-	92	49.261	ENSEBUG00000005722	-	86	49.261
ENSEBUG00000005258	-	97	49.827	ENSEBUG00000012748	-	78	46.753
ENSEBUG00000005258	-	98	51.534	ENSEBUG00000009208	-	67	51.534
ENSEBUG00000005258	-	96	50.173	ENSEBUG00000003455	-	84	50.699
ENSEBUG00000005258	-	82	38.889	ENSEBUG00000003459	-	77	38.889
ENSEBUG00000005258	-	92	42.411	ENSEBUG00000008185	-	77	37.750
ENSEBUG00000005258	-	97	42.208	ENSEBUG00000003644	-	87	42.809
ENSEBUG00000005258	-	95	45.201	ENSEBUG00000004839	-	87	46.302
ENSEBUG00000005258	-	99	55.937	ENSEBUG00000014739	-	89	55.937
ENSEBUG00000005258	-	93	47.799	ENSEBUG00000000735	-	99	47.799
ENSEBUG00000005258	-	86	50.505	ENSEBUG00000001569	-	76	50.505
ENSEBUG00000005258	-	97	39.683	ENSEBUG00000016164	-	84	39.683
ENSEBUG00000005258	-	90	42.006	ENSEBUG00000010205	-	83	42.006
ENSEBUG00000005258	-	91	41.603	ENSEBUG00000010204	-	78	41.603
ENSEBUG00000005258	-	97	42.727	ENSEBUG00000008025	-	65	41.919
ENSEBUG00000005258	-	92	54.598	ENSEBUG00000005012	-	69	54.598
ENSEBUG00000005258	-	97	53.480	ENSEBUG00000001698	-	98	53.480
ENSEBUG00000005258	-	82	46.392	ENSEBUG00000015925	-	82	47.200
ENSEBUG00000005258	-	83	45.161	ENSEBUG00000011694	-	97	45.161
ENSEBUG00000005258	-	96	52.258	ENSEBUG00000011244	-	88	52.344
ENSEBUG00000005258	-	94	39.796	ENSEBUG00000006129	-	81	39.796
ENSEBUG00000005258	-	82	46.075	ENSEBUG00000013528	-	79	46.075
ENSEBUG00000005258	-	85	47.716	ENSEBUG00000007054	-	64	47.716
ENSEBUG00000005258	-	82	43.253	ENSEBUG00000014040	-	77	43.253
ENSEBUG00000005258	-	82	51.795	ENSEBUG00000014042	-	69	51.795
ENSEBUG00000005258	-	95	44.620	ENSEBUG00000011331	-	80	44.620
ENSEBUG00000005258	-	82	46.809	ENSEBUG00000001219	-	71	46.809
ENSEBUG00000005258	-	96	46.729	ENSEBUG00000008392	-	89	46.729
ENSEBUG00000005258	-	95	43.344	ENSEBUG00000000422	-	64	43.344
ENSEBUG00000005258	-	97	45.570	ENSEBUG00000015576	-	84	45.570
ENSEBUG00000005258	-	94	46.497	ENSEBUG00000005131	-	64	46.497
ENSEBUG00000005258	-	89	45.492	ENSEBUG00000015403	-	84	45.492
ENSEBUG00000005258	-	81	34.146	ENSEBUG00000011562	-	90	36.620
ENSEBUG00000005258	-	82	42.264	ENSEBUG00000005785	-	68	42.264
ENSEBUG00000005258	-	88	39.365	ENSEBUG00000004597	-	73	39.365
ENSEBUG00000005258	-	96	44.620	ENSEBUG00000005146	-	96	44.620
ENSEBUG00000005258	-	94	52.532	ENSEBUG00000001972	-	78	52.532
ENSEBUG00000005258	-	97	37.984	ENSEBUG00000008169	-	78	37.984
ENSEBUG00000005258	-	95	40.426	ENSEBUG00000014542	-	79	40.426
ENSEBUG00000005258	-	82	46.181	ENSEBUG00000000554	-	80	46.181
ENSEBUG00000005258	-	96	52.964	ENSEBUG00000002589	-	85	52.964
ENSEBUG00000005258	-	90	37.931	ENSEBUG00000014665	-	79	39.344
ENSEBUG00000005258	-	98	43.925	ENSEBUG00000006233	-	65	43.925
ENSEBUG00000005258	-	80	43.671	ENSEBUG00000001741	-	71	43.671
ENSEBUG00000005258	-	93	44.654	ENSEBUG00000006811	-	94	46.372
ENSEBUG00000005258	-	89	42.958	ENSEBUG00000004844	-	70	42.958
ENSEBUG00000005258	-	95	46.875	ENSEBUG00000015472	-	70	46.875
ENSEBUG00000005258	-	92	40.271	ENSEBUG00000014704	ZBTB17	87	40.271
ENSEBUG00000005258	-	99	54.890	ENSEBUG00000012628	ZNF845	89	57.778
ENSEBUG00000005258	-	97	52.564	ENSEBUG00000011479	-	81	52.564
ENSEBUG00000005258	-	81	48.413	ENSEBUG00000013400	-	60	48.413
ENSEBUG00000005258	-	93	45.513	ENSEBUG00000008039	-	84	45.513
ENSEBUG00000005258	-	89	45.211	ENSEBUG00000015073	-	90	42.412
ENSEBUG00000005258	-	82	45.149	ENSEBUG00000016287	-	56	45.149
ENSEBUG00000005258	-	97	48.425	ENSEBUG00000016281	-	89	48.101
ENSEBUG00000005258	-	92	41.071	ENSEBUG00000012939	-	68	41.071
ENSEBUG00000005258	-	94	40.129	ENSEBUG00000007518	-	64	40.129

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000005258	-	85	43.836	ENSACLG00000020975	-	85	43.836	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000005258	-	93	50.883	ENSAMXG00000017609	-	84	50.883	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000005258	-	97	48.684	ENSGAGG00000001387	-	61	48.684	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000005258	-	84	48.580	ENSPCIG00000018955	-	77	48.580	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000005258	-	97	46.688	ENSSHAG00000014216	-	91	46.688	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000005258	-	96	46.983	ENSTGUG00000014292	-	99	46.983	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000005258	-	94	48.108	ENSTGUG00000016220	-	100	48.108	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000005258	-	82	46.774	ENSTGUG00000018385	-	99	46.774	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000005258	-	82	44.625	ENSUMAG00000019336	-	96	44.625	Ursus_maritimus