EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000005913 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22201 bases
Position: chrFYBX02000152.1:1257631-1279831
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSEBUP00000009178	zf-met	PF12874.7	2.4e-06	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000009689	-	5230	-	ENSEBUP00000009168	458 (aa)	-	-
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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000005913	-	83	42.268	ENSEBUG00000012919	-	99	42.268
ENSEBUG00000005913	-	99	48.454	ENSEBUG00000015110	-	99	48.454
ENSEBUG00000005913	-	98	50.515	ENSEBUG00000007563	-	99	50.515
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ENSEBUG00000005913	-	73	40.397	ENSEBUG00000002371	-	94	39.869
ENSEBUG00000005913	-	98	40.887	ENSEBUG00000015993	-	84	44.318
ENSEBUG00000005913	-	59	52.062	ENSEBUG00000006666	-	99	52.727
ENSEBUG00000005913	-	73	47.778	ENSEBUG00000007012	-	99	47.778
ENSEBUG00000005913	-	99	48.438	ENSEBUG00000001741	-	95	51.412
ENSEBUG00000005913	-	99	48.969	ENSEBUG00000014469	-	86	48.969
ENSEBUG00000005913	-	73	42.308	ENSEBUG00000010205	-	98	42.308
ENSEBUG00000005913	-	57	40.206	ENSEBUG00000010204	-	84	40.206
ENSEBUG00000005913	-	73	44.845	ENSEBUG00000005264	-	97	44.845
ENSEBUG00000005913	-	74	42.938	ENSEBUG00000016688	-	79	42.938
ENSEBUG00000005913	-	63	41.000	ENSEBUG00000005319	-	84	41.000
ENSEBUG00000005913	-	99	42.373	ENSEBUG00000000860	-	99	42.373

Orthologs

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ENSEBUG00000005913	-	51	42.029	ENSAPOG00000022234	-	95	42.029	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	60	43.350	ENSAPOG00000001742	-	59	43.350	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	64	32.399	ENSAPOG00000001725	-	96	46.392	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	65	43.850	ENSAPOG00000014378	-	69	43.850	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	53	46.746	ENSAPOG00000007955	-	78	46.746	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	65	46.218	ENSAPOG00000020864	-	77	46.218	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	57	45.399	ENSAPOG00000002691	-	59	45.399	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	52	46.392	ENSAPOG00000007983	-	54	46.392	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000005913	-	61	42.268	ENSACIG00000016182	-	97	42.268	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000005913	-	55	45.775	ENSACIG00000022625	-	94	45.775	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000005913	-	50	47.904	ENSACIG00000019447	-	74	47.904	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000005913	-	64	43.269	ENSACIG00000003556	-	82	43.269	Amphilophus_citrinellus
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