EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000006281 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 293186 bases
Position: chrFYBX02010833.1:1218303-1511488
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000010064	Xpo1	PF08389.12	4e-23	1	1
ENSEBUP00000009808	Xpo1	PF08389.12	4.7e-23	1	1
ENSEBUP00000009973	Xpo1	PF08389.12	4.8e-23	1	1
ENSEBUP00000010032	Xpo1	PF08389.12	4.9e-23	1	1
ENSEBUP00000009927	Xpo1	PF08389.12	5.5e-23	1	1
ENSEBUP00000009848	Xpo1	PF08389.12	5.5e-23	1	1
ENSEBUP00000009893	Xpo1	PF08389.12	5.6e-23	1	1
ENSEBUP00000009778	Xpo1	PF08389.12	5.6e-23	1	1
ENSEBUP00000010032	IBN_N	PF03810.19	2.9e-06	1	1
ENSEBUP00000009973	IBN_N	PF03810.19	4.6e-06	1	1
ENSEBUP00000009927	IBN_N	PF03810.19	5e-06	1	1
ENSEBUP00000009893	IBN_N	PF03810.19	5.1e-06	1	1
ENSEBUP00000009778	IBN_N	PF03810.19	5.7e-06	1	1
ENSEBUP00000009848	IBN_N	PF03810.19	5.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000010508	-	5076	-	ENSEBUP00000009973	911 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010602	-	4989	-	ENSEBUP00000010064	882 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010460	-	5175	-	ENSEBUP00000009927	944 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010339	-	4639	-	ENSEBUP00000009808	913 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010379	-	4538	-	ENSEBUP00000009848	938 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010569	-	5067	-	ENSEBUP00000010032	908 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010309	-	4720	-	ENSEBUP00000009778	954 (aa)	-	-
ENSEBUT00000010425	-	5202	-	ENSEBUP00000009893	953 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSG00000117408	IPO13	98	67.155	Homo_sapiens
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	59.378	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	59.689	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.143	ENSAPOG00000003308	ipo13	99	68.894	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.234	ENSAMEG00000001123	IPO13	98	67.050	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.458	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	58.891	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.588	ENSACIG00000008146	ipo13	100	66.093	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.135	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	98	58.446	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.819	ENSAOCG00000004943	ipo13	99	68.685	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	70.400	ENSAPEG00000011282	ipo13	99	68.685	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.135	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	98	58.446	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.495	ENSATEG00000018367	ipo13	99	68.267	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000006281	ipo13	98	57.878	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	58.193	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.450	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	66.771	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.956	ENSACAG00000014300	IPO13	98	67.786	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.558	ENSANAG00000034183	IPO13	98	67.223	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.711	ENSACLG00000011458	ipo13	100	68.314	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.714	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	58.714	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.996	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	68.140	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	55.671	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	55.671	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.909	ENSBTAG00000018887	IPO13	98	66.736	Bos_taurus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.450	ENSCJAG00000007453	IPO13	98	67.119	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.126	ENSCAFG00000004875	IPO13	98	66.946	Canis_familiaris
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.126	ENSCAFG00020017359	IPO13	98	66.946	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.909	ENSCHIG00000008341	IPO13	98	66.736	Capra_hircus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSTSYG00000035980	IPO13	98	67.155	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	64.842	ENSCAPG00000001972	IPO13	98	66.532	Cavia_aperea
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	65.646	ENSCPOG00000012445	IPO13	97	66.490	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.450	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	67.012	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSCATG00000041276	IPO13	98	67.155	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.234	ENSCLAG00000002914	IPO13	98	67.050	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSCSAG00000001190	IPO13	98	67.155	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.847	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	67.281	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	36.247	ENSCING00000001863	-	100	37.010	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	35.631	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.307	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSCANG00000009091	IPO13	98	67.155	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.584	ENSCGRG00001021177	Ipo13	98	66.423	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.584	ENSCGRG00000012411	Ipo13	98	66.423	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	53.138	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	98	53.975	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.063	ENSCSEG00000007713	ipo13	99	67.672	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.927	ENSCVAG00000013039	ipo13	99	68.607	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	96	56.745	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	57.066	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	56.348	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	56.663	Danio_rerio
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.219	ENSDARG00000060618	ipo13	100	68.634	Danio_rerio
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.558	ENSDNOG00000016583	IPO13	98	67.364	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSDORG00000005471	Ipo13	98	67.015	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSEASG00005001738	IPO13	98	67.155	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSECAG00000015508	IPO13	98	67.155	Equus_caballus
ENSEBUG00000006281	ipo13	71	71.200	ENSEEUG00000011681	IPO13	80	71.200	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.387	ENSELUG00000001498	ipo13	99	67.983	Esox_lucius
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.154	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	98	58.359	Esox_lucius
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.234	ENSFCAG00000006488	IPO13	98	67.050	Felis_catus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.739	ENSFALG00000005368	IPO13	100	67.172	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.017	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	66.563	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.035	ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.685	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	57.796	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	98	58.004	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.457	ENSGMOG00000015856	ipo13	98	68.476	Gadus_morhua
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	50.701	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	98	52.301	Gadus_morhua
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.956	ENSGALG00000010087	IPO13	99	67.786	Gallus_gallus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	57.796	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	98	57.796	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.035	ENSGAFG00000006361	ipo13	99	68.607	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.186	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	98	58.186	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.451	ENSGACG00000014562	ipo13	98	66.840	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.667	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	67.513	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSGGOG00000016375	IPO13	98	67.155	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.819	ENSHBUG00000018605	ipo13	99	68.476	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	58.010	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	98	58.220	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.801	ENSHGLG00000001822	IPO13	98	66.632	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.801	ENSHGLG00100015830	IPO13	98	66.632	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	65.551	ENSHCOG00000018408	ipo13	99	66.736	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	54.230	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	55.508	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	52.599	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	99	53.222	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.603	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	68.444	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSSTOG00000003611	IPO13	98	67.155	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.667	ENSJJAG00000018591	Ipo13	98	67.469	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	57.960	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	98	57.960	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	67.974	ENSKMAG00000007869	ipo13	98	68.737	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	57.775	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	57.467	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.523	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	67.427	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	63.209	ENSLACG00000016657	IPO13	98	63.674	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000006281	ipo13	68	36.478	ENSLACG00000002351	TNPO3	78	36.478	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	64.547	ENSLOCG00000010620	ipo13	98	65.449	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	64.941	ENSLAFG00000017144	IPO13	98	65.661	Loxodonta_africana
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ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSMMUG00000015142	IPO13	98	67.155	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSMNEG00000041971	IPO13	98	67.155	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	ENSMLEG00000044330	IPO13	98	67.155	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.711	ENSMAMG00000017290	ipo13	99	68.476	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	59.047	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	59.129	Mastacembelus_armatus
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ENSEBUG00000006281	ipo13	86	66.709	ENSMAUG00000013018	Ipo13	98	67.172	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	62.870	ENSMICG00000011003	IPO13	98	63.386	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.017	ENSMOCG00000008881	Ipo13	98	66.841	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000006281	ipo13	99	56.289	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	100	56.289	Mola_mola
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