EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000007740 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 38894 bases
Position: chrFYBX02010206.1:317575-356468
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000012134	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-48	3	10
ENSEBUP00000012134	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-48	4	10
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ENSEBUP00000012134	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-48	8	10
ENSEBUP00000012134	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-48	9	10
ENSEBUP00000012134	zf-C2H2	PF00096.26	5.1e-48	10	10
ENSEBUP00000012141	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-48	1	10
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ENSEBUP00000012141	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-48	5	10
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ENSEBUP00000012141	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-48	9	10
ENSEBUP00000012141	zf-C2H2	PF00096.26	7.1e-48	10	10
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ENSEBUP00000012134	zf-met	PF12874.7	0.00017	2	2
ENSEBUP00000012141	zf-met	PF12874.7	0.00022	1	2
ENSEBUP00000012141	zf-met	PF12874.7	0.00022	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000012717	-	5773	-	ENSEBUP00000012141	359 (aa)	-	-
ENSEBUT00000012710	-	5740	-	ENSEBUP00000012134	348 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000007740	-	95	43.416	ENSEBUG00000009484	-	61	43.416
ENSEBUG00000007740	-	89	49.398	ENSEBUG00000005816	-	69	49.398
ENSEBUG00000007740	-	95	46.575	ENSEBUG00000008025	-	72	46.575
ENSEBUG00000007740	-	95	47.195	ENSEBUG00000012823	-	91	47.195
ENSEBUG00000007740	-	96	43.431	ENSEBUG00000002291	-	76	43.431
ENSEBUG00000007740	-	95	45.902	ENSEBUG00000005722	-	96	45.902
ENSEBUG00000007740	-	90	55.000	ENSEBUG00000012737	-	74	52.542
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ENSEBUG00000007740	-	88	46.154	ENSEBUG00000014677	-	83	46.154
ENSEBUG00000007740	-	98	46.237	ENSEBUG00000006811	-	82	46.237
ENSEBUG00000007740	-	87	43.028	ENSEBUG00000013221	-	83	43.781
ENSEBUG00000007740	-	96	41.509	ENSEBUG00000007266	-	90	41.509
ENSEBUG00000007740	-	99	45.806	ENSEBUG00000004011	-	96	48.472
ENSEBUG00000007740	-	95	46.875	ENSEBUG00000011065	-	90	46.875
ENSEBUG00000007740	-	98	43.066	ENSEBUG00000015693	-	77	43.066
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ENSEBUG00000007740	-	98	46.205	ENSEBUG00000000704	-	98	46.205
ENSEBUG00000007740	-	88	51.020	ENSEBUG00000015953	-	55	51.020
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ENSEBUG00000007740	-	90	41.453	ENSEBUG00000008107	-	99	41.631
ENSEBUG00000007740	-	94	42.236	ENSEBUG00000001826	-	79	42.236
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