EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000010077 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nom1
Alias: si:ch211-266o5.1
Full Name: nucleolar protein with MIF4G domain 1
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34139 bases
Position: chrFYBX02010807.1:64749-98887
Accession: ZDB-GENE-060503-321
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000016042	MA3	PF02847.17	9.8e-21	1	1
ENSEBUP00000016042	MIF4G	PF02854.19	3.5e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000016617	-	1362	-	ENSEBUP00000016042	453 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000010077	nom1	95	51.157	ENSG00000146909	NOM1	50	51.157	Homo_sapiens
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.797	ENSAPOG00000012073	nom1	51	50.797	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	48.611	ENSAMEG00000001412	NOM1	59	48.611	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.164	ENSACIG00000018050	nom1	56	52.164	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.342	ENSAOCG00000006229	nom1	51	50.342	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.797	ENSAPEG00000015994	nom1	51	50.797	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.688	ENSATEG00000005405	nom1	53	50.688	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.613	ENSAPLG00000006585	NOM1	66	51.613	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.459	ENSACAG00000011192	NOM1	50	50.459	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.847	ENSACLG00000000033	nom1	52	52.847	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.572	ENSAMXG00000041486	nom1	50	50.682	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	49.654	ENSBTAG00000016435	NOM1	50	49.654	Bos_taurus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	47.917	ENSCAFG00020005121	NOM1	50	47.917	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000010077	nom1	90	51.707	ENSCHIG00000020102	NOM1	51	49.885	Capra_hircus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.808	ENSTSYG00000000227	NOM1	51	50.808	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.465	ENSCAPG00000016273	NOM1	81	50.465	Cavia_aperea
ENSEBUG00000010077	nom1	94	51.408	ENSCCAG00000014944	NOM1	99	52.825	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	51.972	ENSCLAG00000000267	NOM1	50	51.972	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000010077	nom1	90	36.650	ENSCING00000005248	-	55	36.650	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000010077	nom1	95	49.537	ENSCANG00000041984	NOM1	73	49.537	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.116	ENSCGRG00001020293	Nom1	50	50.116	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.116	ENSCGRG00000005405	Nom1	80	50.116	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.114	ENSCVAG00000007562	nom1	52	50.114	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.114	ENSDARG00000060027	nom1	89	49.886	Danio_rerio
ENSEBUG00000010077	nom1	95	40.972	ENSDORG00000015682	Nom1	61	40.972	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000010077	nom1	95	51.732	ENSEASG00005001489	NOM1	50	51.732	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.716	ENSELUG00000006266	nom1	51	51.716	Esox_lucius
ENSEBUG00000010077	nom1	95	47.222	ENSFCAG00000006467	NOM1	52	47.222	Felis_catus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.142	ENSFALG00000006904	NOM1	62	51.142	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.348	ENSFDAG00000016241	NOM1	52	50.348	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000010077	nom1	96	49.315	ENSFHEG00000015974	nom1	52	49.315	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	52.194	ENSGMOG00000005129	nom1	56	51.708	Gadus_morhua
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.826	ENSGALG00000006437	NOM1	50	51.826	Gallus_gallus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	49.541	ENSGAFG00000003211	nom1	52	49.541	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.688	ENSGAGG00000014347	NOM1	52	50.688	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.847	ENSHBUG00000014616	nom1	52	52.847	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000010077	nom1	70	49.688	ENSHCOG00000011999	-	84	49.688	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000010077	nom1	96	49.091	ENSIPUG00000013980	nom1	52	49.091	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.000	ENSSTOG00000031736	NOM1	74	50.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	52.083	ENSJJAG00000011716	Nom1	86	52.083	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.227	ENSLBEG00000009252	nom1	51	50.227	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.376	ENSLACG00000011777	NOM1	52	51.376	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.752	ENSLOCG00000012452	nom1	54	52.752	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	48.409	ENSLAFG00000007119	NOM1	53	48.409	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.808	ENSMLEG00000037062	NOM1	81	50.808	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.688	ENSMAMG00000004118	nom1	51	50.688	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.847	ENSMZEG00005000384	nom1	52	52.847	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.835	ENSMGAG00000005051	NOM1	63	51.835	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.348	ENSMAUG00000017988	Nom1	51	50.348	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.233	ENSMICG00000017531	NOM1	51	50.233	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.000	ENSMOCG00000015962	Nom1	50	50.000	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000010077	nom1	96	45.796	ENSMMOG00000004419	nom1	53	45.796	Mola_mola
ENSEBUG00000010077	nom1	95	51.157	ENSMODG00000005177	NOM1	50	51.157	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.580	MGP_CAROLIEiJ_G0027043	Nom1	50	50.580	Mus_caroli
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.580	ENSMUSG00000001569	Nom1	50	50.580	Mus_musculus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.812	MGP_SPRETEiJ_G0028039	Nom1	50	50.812	Mus_spretus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	48.611	ENSMPUG00000009745	NOM1	62	48.611	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.000	ENSMLUG00000009129	NOM1	71	50.000	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.620	ENSNBRG00000016429	nom1	78	52.620	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000010077	nom1	95	52.668	ENSODEG00000009399	NOM1	61	52.668	Octodon_degus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.835	ENSONIG00000005958	nom1	55	51.835	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000010077	nom1	94	51.174	ENSOANG00000006139	-	88	51.174	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	42.299	ENSOCUG00000021448	-	58	42.299	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.231	ENSOCUG00000004071	-	51	50.231	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000010077	nom1	89	53.713	ENSORLG00000010541	nom1	52	51.376	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000010077	nom1	89	53.713	ENSORLG00020010789	nom1	56	51.376	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000010077	nom1	89	53.713	ENSORLG00015010475	nom1	56	51.376	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000010077	nom1	89	53.465	ENSOMEG00000004219	nom1	52	51.481	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000010077	nom1	95	49.769	ENSOGAG00000001124	NOM1	70	49.769	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000010077	nom1	95	49.423	ENSOARG00000007261	NOM1	55	50.980	Ovis_aries
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.463	ENSPPAG00000041374	NOM1	50	50.463	Pan_paniscus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	47.575	ENSPTIG00000013532	NOM1	58	47.575	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.463	ENSPTRG00000019917	NOM1	50	50.463	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.569	ENSPKIG00000005825	nom1	52	50.569	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.294	ENSPSIG00000017848	NOM1	72	52.294	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.459	ENSPMGG00000002577	nom1	53	50.459	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	51.157	ENSPEMG00000024180	Nom1	50	51.157	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000010077	nom1	59	49.301	ENSPMAG00000002136	-	96	50.896	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	49.083	ENSPFOG00000015771	nom1	52	49.083	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000010077	nom1	96	48.853	ENSPLAG00000007856	nom1	53	48.853	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000010077	nom1	96	49.312	ENSPMEG00000014155	nom1	53	49.312	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000010077	nom1	96	48.853	ENSPREG00000008850	nom1	52	48.975	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000010077	nom1	95	49.885	ENSPCOG00000015222	NOM1	81	49.885	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000010077	nom1	95	49.192	ENSPVAG00000014760	NOM1	50	49.192	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.620	ENSPNYG00000006975	nom1	78	52.620	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000010077	nom1	95	46.636	ENSRNOG00000048969	AABR07059041.1	53	46.636	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.808	ENSRBIG00000037042	NOM1	50	50.808	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.346	ENSRROG00000037293	NOM1	50	50.346	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000010077	nom1	68	48.710	ENSSHAG00000002835	-	74	48.710	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000010077	nom1	95	50.926	ENSSHAG00000017998	-	63	50.926	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.572	ENSSFOG00015003196	nom1	89	50.572	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	52.164	ENSSMAG00000011047	nom1	51	52.164	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.376	ENSSDUG00000006834	nom1	51	51.376	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.917	ENSSLDG00000021812	nom1	51	50.917	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000010077	nom1	75	50.877	ENSSPUG00000002556	NOM1	79	50.877	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.797	ENSSPAG00000000953	nom1	50	50.797	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000010077	nom1	56	49.606	ENSTGUG00000016587	-	72	49.606	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.370	ENSTGUG00000000702	-	62	51.370	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000010077	nom1	96	49.771	ENSTRUG00000010239	nom1	52	49.771	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000010077	nom1	96	50.459	ENSTNIG00000012783	nom1	56	50.459	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000010077	nom1	95	48.611	ENSUMAG00000014275	NOM1	62	48.611	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000010077	nom1	95	48.148	ENSVVUG00000002608	NOM1	50	48.148	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000010077	nom1	96	51.835	ENSXETG00000021611	nom1	59	48.322	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000010077	nom1	96	48.624	ENSXMAG00000002451	nom1	52	48.624	Xiphophorus_maculatus