EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000010204 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24167 bases
Position: chrFYBX02009681.1:1180743-1204909
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000016244	zf-C2H2	PF00096.26	8.1e-47	9	9
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ENSEBUP00000016244	zf-met	PF12874.7	4.1e-07	2	3
ENSEBUP00000016244	zf-met	PF12874.7	4.1e-07	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000016820	-	1617	-	ENSEBUP00000016244	412 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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Orthologs

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ENSEBUG00000010204	-	68	52.128	ENSXCOG00000010950	si:dkey-210j14.3	56	52.128	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000010204	-	54	52.830	ENSXCOG00000016589	-	98	52.830	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000010204	-	68	48.810	ENSXMAG00000022137	-	85	48.810	Xiphophorus_maculatus