EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000010205 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 50557 bases
Position: chrFYBX02009007.1:2016256-2066812
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000016253	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-95	16	17
ENSEBUP00000016253	zf-C2H2	PF00096.26	6.7e-95	17	17
ENSEBUP00000016253	zf-met	PF12874.7	2.5e-22	1	2
ENSEBUP00000016253	zf-met	PF12874.7	2.5e-22	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000016830	-	4545	-	ENSEBUP00000016253	669 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000010205	-	82	45.340	ENSEBUG00000016878	-	96	45.340
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ENSEBUG00000010205	-	85	45.133	ENSEBUG00000012454	-	95	46.581
ENSEBUG00000010205	-	99	39.773	ENSEBUG00000014717	-	90	41.118
ENSEBUG00000010205	-	83	48.502	ENSEBUG00000006080	-	87	48.502
ENSEBUG00000010205	-	83	48.691	ENSEBUG00000008903	-	72	49.162
ENSEBUG00000010205	-	84	48.593	ENSEBUG00000007470	-	86	48.593
ENSEBUG00000010205	-	79	48.601	ENSEBUG00000015110	-	66	48.346
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