EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000010447 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pop4 (1 of many)
Alias: zgc:110597
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3793 bases
Position: chrFYBX02010311.1:1174189-1177981
Accession: ZDB-GENE-050522-505
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000016651	UPF0086	PF01868.16	1.2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000017227	-	1682	-	ENSEBUP00000016651	257 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000010447	pop4	84	89.302	ENSEBUG00000004305	pop4	94	89.302
ENSEBUG00000010447	pop4	90	79.221	ENSEBUG00000008575	pop4	97	77.922

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000010447	pop4	81	48.325	ENSG00000105171	POP4	99	61.053	Homo_sapiens
ENSEBUG00000010447	pop4	82	41.509	ENSAMEG00000003172	-	89	41.509	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.667	ENSAMEG00000018329	-	90	46.190	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000010447	pop4	82	47.170	ENSACIG00000008358	pop4	93	46.154	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	44.550	ENSAOCG00000010116	pop4	97	45.794	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000010447	pop4	84	44.144	ENSAPEG00000002829	pop4	89	45.333	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.445	ENSATEG00000013028	pop4	90	45.283	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	47.619	ENSAPLG00000014051	POP4	95	47.619	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSANAG00000020295	POP4	91	47.664	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.445	ENSACLG00000000526	pop4	90	45.024	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000010447	pop4	81	49.038	ENSAMXG00000002899	pop4	88	49.038	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.095	ENSBTAG00000002223	POP4	90	47.619	Bos_taurus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.729	ENSCJAG00000046750	POP4	84	56.954	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000010447	pop4	56	55.172	ENSCAFG00000007630	POP4	82	55.034	Canis_familiaris
ENSEBUG00000010447	pop4	82	47.143	ENSCHIG00000016743	POP4	90	47.143	Capra_hircus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.190	ENSTSYG00000003488	POP4	90	47.619	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000010447	pop4	83	34.112	ENSCAPG00000011105	POP4	91	34.112	Cavia_aperea
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.664	ENSCPOG00000002992	POP4	91	47.664	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000010447	pop4	55	48.936	ENSCCAG00000034244	-	91	41.589	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.131	ENSCCAG00000020285	-	91	48.131	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.585	ENSCATG00000036022	POP4	99	61.053	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSCLAG00000013162	POP4	91	47.196	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSCSAG00000004868	POP4	92	48.598	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	35.238	ENSCHOG00000002071	POP4	91	35.714	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.667	ENSCPBG00000016132	POP4	91	46.262	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000010447	pop4	77	30.732	ENSCING00000023871	-	94	31.373	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSCANG00000005924	POP4	98	49.048	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.131	ENSCGRG00001017185	Pop4	91	48.131	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.131	ENSCGRG00000008155	Pop4	91	48.131	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000010447	pop4	57	51.701	ENSCSEG00000002946	pop4	67	51.701	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000010447	pop4	88	31.278	ENSCVAG00000018602	POP4	60	38.926	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000010447	pop4	88	44.690	ENSDARG00000101472	pop4	95	45.133	Danio_rerio
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.262	ENSDNOG00000047663	POP4	81	46.729	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000010447	pop4	66	43.787	ENSDORG00000008577	Pop4	91	44.970	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000010447	pop4	61	31.902	FBgn0035831	CG8038	73	32.667	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000010447	pop4	81	38.462	ENSETEG00000003607	POP4	90	38.942	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000010447	pop4	68	44.886	ENSECAG00000020206	POP4	56	46.023	Equus_caballus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	33.810	ENSEEUG00000013109	POP4	99	34.762	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000010447	pop4	88	42.667	ENSELUG00000019812	pop4	95	42.667	Esox_lucius
ENSEBUG00000010447	pop4	83	45.794	ENSFCAG00000001619	POP4	91	46.262	Felis_catus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.729	ENSFALG00000000206	POP4	90	47.196	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.262	ENSFDAG00000017859	POP4	91	46.729	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000010447	pop4	58	52.667	ENSFHEG00000012745	pop4	67	52.667	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000010447	pop4	67	51.445	ENSGMOG00000000335	pop4	74	56.081	Gadus_morhua
ENSEBUG00000010447	pop4	83	44.860	ENSGALG00000041972	POP4	84	46.296	Gallus_gallus
ENSEBUG00000010447	pop4	65	40.120	ENSGAFG00000003571	pop4	57	52.885	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000010447	pop4	56	55.862	ENSGACG00000014510	pop4	95	44.493	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.729	ENSGAGG00000024544	POP4	73	47.196	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000010447	pop4	81	48.325	ENSGGOG00000038346	POP4	91	48.131	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.972	ENSHBUG00000021821	pop4	90	44.550	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSHGLG00000015798	POP4	91	47.664	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSHGLG00100009737	POP4	91	47.664	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000010447	pop4	87	43.860	ENSHCOG00000020937	pop4	95	42.982	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000010447	pop4	81	46.860	ENSIPUG00000013652	pop4	88	46.860	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.919	ENSSTOG00000011016	POP4	90	47.393	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000010447	pop4	81	47.847	ENSJJAG00000013376	Pop4	89	49.282	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000010447	pop4	86	46.396	ENSKMAG00000012250	pop4	95	45.740	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000010447	pop4	56	51.034	ENSLBEG00000014139	pop4	90	40.376	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000010447	pop4	56	51.034	ENSLBEG00000018846	-	90	40.845	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.714	ENSLACG00000008581	POP4	89	47.143	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000010447	pop4	83	45.794	ENSLOCG00000005597	pop4	91	45.794	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSLAFG00000000084	POP4	91	47.196	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSMFAG00000029606	POP4	91	48.598	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSMMUG00000017424	POP4	91	48.598	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSMNEG00000031374	POP4	91	48.598	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSMLEG00000043454	POP4	91	48.611	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000010447	pop4	58	56.376	ENSMAMG00000011716	pop4	95	44.444	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.445	ENSMZEG00005002360	pop4	90	45.024	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.238	ENSMGAG00000005337	POP4	90	45.327	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.598	ENSMAUG00000020110	Pop4	91	49.533	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	47.143	ENSMICG00000035730	POP4	88	47.642	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000010447	pop4	56	54.483	ENSMMOG00000015321	pop4	89	42.180	Mola_mola
ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.714	ENSMODG00000029406	POP4	85	46.190	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000010447	pop4	87	43.304	ENSMALG00000012571	pop4	95	44.444	Monopterus_albus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	49.065	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	91	48.624	Mus_caroli
ENSEBUG00000010447	pop4	83	49.533	ENSMUSG00000030423	Pop4	91	48.624	Mus_musculus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.598	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	91	49.537	Mus_spretus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	42.326	ENSMPUG00000008063	-	91	42.326	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.262	ENSMPUG00000008041	-	91	46.262	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000010447	pop4	82	36.967	ENSMLUG00000010774	POP4	91	36.744	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.113	ENSOPRG00000004736	POP4	99	48.113	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSODEG00000013025	POP4	95	47.196	Octodon_degus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.972	ENSONIG00000003458	pop4	88	44.550	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.131	ENSOCUG00000015974	POP4	91	48.598	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	44.076	ENSORLG00000020317	pop4	67	53.020	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000010447	pop4	82	44.076	ENSORLG00015011624	pop4	67	53.020	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000010447	pop4	82	43.602	ENSOMEG00000002538	pop4	67	53.020	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000010447	pop4	83	46.262	ENSOGAG00000011168	POP4	91	46.759	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000010447	pop4	84	46.296	ENSOARG00000004041	POP4	92	46.296	Ovis_aries
ENSEBUG00000010447	pop4	81	48.325	ENSPPAG00000040372	POP4	89	48.804	Pan_paniscus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	45.794	ENSPPRG00000010502	POP4	91	46.262	Panthera_pardus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	45.794	ENSPTIG00000016598	POP4	91	46.262	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000010447	pop4	81	48.325	ENSPTRG00000010779	POP4	89	48.804	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSPANG00000008546	POP4	91	48.598	Papio_anubis
ENSEBUG00000010447	pop4	87	44.444	ENSPKIG00000004468	pop4	94	44.444	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000010447	pop4	83	47.196	ENSPSIG00000015690	POP4	98	48.095	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000010447	pop4	81	44.976	ENSPMGG00000008608	pop4	96	45.498	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000010447	pop4	83	39.720	ENSPEMG00000019982	-	91	39.720	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000010447	pop4	88	45.815	ENSPEMG00000014034	-	99	46.256	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000010447	pop4	57	60.544	ENSPMAG00000006265	pop4	96	51.579	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	47.143	ENSPCIG00000024738	POP4	85	47.143	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000010447	pop4	62	51.250	ENSPFOG00000000925	pop4	67	53.691	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000010447	pop4	62	51.250	ENSPLAG00000003161	pop4	67	53.691	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000010447	pop4	62	51.250	ENSPMEG00000002475	pop4	67	53.691	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000010447	pop4	63	49.383	ENSPREG00000022403	pop4	65	52.349	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.095	ENSPPYG00000009805	POP4	90	48.571	Pongo_abelii
ENSEBUG00000010447	pop4	81	47.115	ENSPCAG00000007737	POP4	89	47.115	Procavia_capensis
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.667	ENSPCOG00000018055	POP4	90	46.667	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.095	ENSPVAG00000006069	POP4	90	48.095	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.445	ENSPNYG00000020038	pop4	90	45.024	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000010447	pop4	81	46.377	ENSPNAG00000005591	pop4	88	45.673	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000010447	pop4	83	48.598	ENSRNOG00000027646	Pop4	91	48.165	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000010447	pop4	66	47.337	ENSRBIG00000044769	POP4	81	47.929	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000010447	pop4	82	48.571	ENSRROG00000028903	POP4	91	48.598	Rhinopithecus_roxellana
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