EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000010829 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EHD1 (1 of many)
Alias: -
Full Name: EH domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 45497 bases
Position: chrFYBX02010220.1:579753-625249
Accession: 3242
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000017349	MMR_HSR1	PF01926.23	9.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000017925	EHD1 (1 of many)-201	1035	-	ENSEBUP00000017349	344 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000010829's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000010829's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	78.981	ENSEBUG00000009968	EHD1	58	78.981
ENSEBUG00000010829	EHD1	85	45.973	ENSEBUG00000006391	-	56	45.973
ENSEBUG00000010829	EHD1	74	35.433	ENSEBUG00000015937	srl	63	35.433

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	80.831	ENSG00000110047	EHD1	99	86.957	Homo_sapiens
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.479	ENSAPOG00000013440	ehd1a	58	79.479	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.449	ENSAMEG00000017785	EHD1	56	80.449	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.130	ENSACIG00000022182	ehd1a	58	80.130	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSAOCG00000016322	ehd1a	58	79.805	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSAPEG00000010363	ehd1a	58	79.805	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.130	ENSATEG00000013980	ehd1a	58	80.130	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSANAG00000034810	EHD1	59	81.090	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSACLG00000016016	ehd1a	58	79.805	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	78.526	ENSAMXG00000031892	-	59	78.526	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.386	ENSAMXG00000039344	ehd1a	58	80.386	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSBTAG00000050712	EHD1	58	81.090	Bos_taurus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	71.569	WBGene00004373	rme-1	55	71.569	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCJAG00000002660	EHD1	64	81.090	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	80.831	ENSCAFG00000014128	EHD1	66	81.090	Canis_familiaris
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCAFG00020014846	EHD1	58	81.090	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCHIG00000020707	-	58	81.090	Capra_hircus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCPOG00000008157	EHD1	58	81.090	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCCAG00000004590	EHD1	64	81.090	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCATG00000010658	EHD1	69	81.090	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCLAG00000016412	EHD1	58	81.090	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCSAG00000007397	EHD1	58	81.090	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.167	ENSCPBG00000023692	EHD1	59	79.167	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCANG00000042123	EHD1	63	81.090	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSCGRG00001019701	Ehd1	58	81.090	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000010829	EHD1	82	82.206	ENSCGRG00000000662	Ehd1	55	82.206	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.153	ENSCSEG00000006078	ehd1a	58	79.153	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSCVAG00000012152	ehd1a	58	79.805	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.350	ENSDARG00000014793	ehd1b	58	81.350	Danio_rerio
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	79.808	ENSDARG00000098853	ehd1a	58	79.808	Danio_rerio
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	80.831	ENSDNOG00000017834	EHD1	83	80.831	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSDORG00000030186	Ehd1	58	81.090	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000010829	EHD1	93	69.375	FBgn0016693	Past1	60	69.375	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSEASG00005018250	EHD1	58	81.090	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSECAG00000011638	EHD1	58	81.090	Equus_caballus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.870	ENSELUG00000016093	ehd1b	58	79.870	Esox_lucius
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	81.046	ENSELUG00000007973	-	57	81.046	Esox_lucius
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSFCAG00000027734	EHD1	57	81.090	Felis_catus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.769	ENSFDAG00000007697	EHD1	58	80.769	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSFHEG00000002690	ehd1a	58	79.805	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000010829	EHD1	88	79.934	ENSGMOG00000012192	ehd1a	58	79.934	Gadus_morhua
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.130	ENSGAFG00000000730	ehd1a	58	80.130	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000010829	EHD1	92	78.165	ENSGACG00000017605	ehd1a	60	78.165	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.487	ENSGAGG00000001677	-	54	79.487	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSHBUG00000012087	ehd1a	58	79.805	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSHGLG00000010254	EHD1	58	81.090	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSHGLG00100014206	EHD1	58	81.090	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000010829	EHD1	88	81.063	ENSHCOG00000006825	ehd1a	57	81.063	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.386	ENSIPUG00000002819	ehd1a	58	80.386	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	79.808	ENSIPUG00000017390	EHD1	58	80.064	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSSTOG00000009829	EHD1	58	81.090	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSJJAG00000022299	Ehd1	58	81.090	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.153	ENSKMAG00000004764	ehd1a	58	79.153	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000010829	EHD1	92	78.481	ENSLBEG00000004390	ehd1a	59	78.481	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.299	ENSLACG00000018148	EHD1	59	79.299	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	82.026	ENSLOCG00000000924	ehd1b	55	81.494	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	75.641	ENSLAFG00000011643	EHD1	58	75.641	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMFAG00000032608	EHD1	63	81.090	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMMUG00000003972	EHD1	57	81.090	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMNEG00000031673	EHD1	58	81.090	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMLEG00000031992	EHD1	69	81.090	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.479	ENSMAMG00000021737	ehd1a	58	79.479	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSMZEG00005004305	ehd1a	58	79.805	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMAUG00000013823	Ehd1	58	81.090	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.769	ENSMICG00000001239	EHD1	70	80.769	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMOCG00000015517	Ehd1	58	81.090	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	78.827	ENSMMOG00000003005	ehd1a	58	78.827	Mola_mola
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSMALG00000012679	ehd1a	58	79.805	Monopterus_albus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	58	81.090	Mus_caroli
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMUSG00000024772	Ehd1	58	81.090	Mus_musculus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	58	81.090	Mus_pahari
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	58	81.090	Mus_spretus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSMPUG00000012497	EHD1	58	81.090	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSNGAG00000020358	Ehd1	58	81.090	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.130	ENSNBRG00000002933	ehd1a	58	80.130	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSNLEG00000005375	EHD1	63	81.090	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSOPRG00000011350	EHD1	59	81.090	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSODEG00000014527	EHD1	58	81.090	Octodon_degus
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	80.511	ENSOCUG00000029532	EHD1	92	80.511	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.519	ENSORLG00000022561	ehd1a	58	80.519	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.519	ENSORLG00020018451	ehd1a	58	80.519	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.519	ENSORLG00015017672	ehd1a	58	80.519	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.153	ENSOMEG00000019329	ehd1a	58	79.153	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.769	ENSOGAG00000009351	EHD1	58	80.769	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000010829	EHD1	77	84.211	ENSOARG00000010447	EHD1	54	84.211	Ovis_aries
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSPPAG00000037178	EHD1	63	81.090	Pan_paniscus
ENSEBUG00000010829	EHD1	88	79.276	ENSPPRG00000006031	EHD1	55	79.276	Panthera_pardus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSPTRG00000003851	EHD1	63	81.090	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSPANG00000023358	EHD1	63	81.090	Papio_anubis
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	81.639	ENSPKIG00000020297	-	75	81.639	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.844	ENSPKIG00000023165	-	58	80.844	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.128	ENSPSIG00000005727	EHD1	58	80.128	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.479	ENSPMGG00000017810	ehd1a	58	79.479	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSPEMG00000010917	Ehd1	58	81.090	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.769	ENSPCIG00000014850	EHD1	58	80.769	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000010829	EHD1	88	66.007	ENSPCIG00000017053	-	75	66.007	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSPFOG00000010613	ehd1a	57	79.805	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSPLAG00000023296	ehd1a	58	79.805	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSPMEG00000003397	ehd1a	58	79.805	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSPREG00000015893	ehd1a	58	79.805	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSPPYG00000003093	EHD1	58	81.090	Pongo_abelii
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.769	ENSPCOG00000010309	EHD1	69	80.769	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSPVAG00000007890	EHD1	58	81.090	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSPNYG00000015448	ehd1a	58	79.805	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.100	ENSPNAG00000023091	ehd1a	58	79.100	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000010829	EHD1	91	78.846	ENSPNAG00000007408	EHD1	59	78.846	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSRNOG00000043503	Ehd1	58	81.090	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSRBIG00000039111	EHD1	69	81.090	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSRROG00000026366	EHD1	63	81.090	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSSBOG00000023399	EHD1	64	81.090	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000010829	EHD1	87	66.667	ENSSHAG00000007430	-	70	66.667	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	80.707	ENSSFOG00015006481	-	58	80.707	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000010829	EHD1	78	83.895	ENSSFOG00015019587	EHD1	55	83.895	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.805	ENSSMAG00000018210	ehd1a	58	79.805	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.456	ENSSDUG00000016436	ehd1a	58	80.456	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.456	ENSSLDG00000015328	ehd1a	58	80.456	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	79.479	ENSSPAG00000008682	ehd1a	58	79.479	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSSSCG00000013017	EHD1	58	81.090	Sus_scrofa
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.130	ENSTRUG00000025890	ehd1a	58	80.130	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000010829	EHD1	88	81.063	ENSTNIG00000016792	ehd1a	56	81.063	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	76.129	ENSTBEG00000007057	EHD1	75	76.129	Tupaia_belangeri
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSTTRG00000008887	EHD1	58	81.090	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	81.090	ENSUAMG00000012071	EHD1	58	81.090	Ursus_americanus
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.233	ENSUMAG00000007890	EHD1	57	81.188	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	81.699	ENSXETG00000001638	ehd1	57	81.699	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.677	ENSXCOG00000001781	ehd1a	57	79.677	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000010829	EHD1	89	80.130	ENSXMAG00000005301	ehd1a	63	80.130	Xiphophorus_maculatus