EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000011986 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 99558 bases
Position: chrFYBX02009922.1:178463-278020
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000019279	PAZ	PF02170.22	1.4e-27	1	1
ENSEBUP00000019260	PAZ	PF02170.22	1.5e-27	1	1
ENSEBUP00000019279	Piwi	PF02171.17	1.7e-114	1	1
ENSEBUP00000019260	Piwi	PF02171.17	1.5e-109	1	2
ENSEBUP00000019260	Piwi	PF02171.17	1.5e-109	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000019836	-	3024	-	ENSEBUP00000019260	857 (aa)	-	-
ENSEBUT00000019855	-	2877	-	ENSEBUP00000019279	808 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000011986's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000011986's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000011986	-	86	90.202	ENSEBUG00000014654	ago2	100	90.202
ENSEBUG00000011986	-	96	57.143	ENSEBUG00000014681	ago2	94	57.143
ENSEBUG00000011986	-	85	87.627	ENSEBUG00000008202	-	99	87.627
ENSEBUG00000011986	-	85	87.645	ENSEBUG00000006807	-	100	87.645

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSG00000123908	AGO2	94	86.757	Homo_sapiens
ENSEBUG00000011986	-	100	86.015	ENSAPOG00000017586	ago2	92	86.015	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.543	ENSAMEG00000005019	AGO2	94	86.543	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000011986	-	86	87.050	ENSACIG00000001179	ago2	96	87.050	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.510	ENSAOCG00000015307	ago2	92	86.510	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000011986	-	100	86.510	ENSAPEG00000018425	ago2	92	86.510	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSATEG00000000529	ago2	92	86.262	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSAPLG00000010465	AGO2	94	86.262	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000011986	-	100	86.156	ENSACAG00000000167	AGO2	93	86.156	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSANAG00000027399	AGO2	94	86.757	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000011986	-	85	88.047	ENSACLG00000024684	ago2	98	88.047	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000011986	-	100	86.386	ENSAMXG00000014587	ago2	94	86.386	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSBTAG00000001579	AGO2	95	86.510	Bos_taurus
ENSEBUG00000011986	-	99	68.010	WBGene00000106	alg-2	92	68.010	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000011986	-	99	68.182	WBGene00000105	alg-1	83	68.182	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCJAG00000004132	AGO2	94	86.757	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCAFG00000001196	AGO2	99	86.757	Canis_familiaris
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCAFG00020014198	AGO2	94	86.757	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCHIG00000010156	AGO2	95	86.510	Capra_hircus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSTSYG00000007281	AGO2	97	84.258	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000011986	-	92	87.072	ENSCAPG00000013707	AGO2	93	87.072	Cavia_aperea
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCPOG00000010428	AGO2	94	86.757	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCCAG00000035031	AGO2	95	86.757	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000011986	-	100	83.684	ENSCATG00000038820	AGO2	96	83.684	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCLAG00000001381	AGO2	94	86.757	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCSAG00000009574	AGO2	89	86.757	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000011986	-	75	84.713	ENSCHOG00000008938	-	77	84.713	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	ENSCPBG00000019183	AGO2	93	86.279	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000011986	-	99	72.927	ENSCING00000007310	-	95	72.927	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000011986	-	99	73.594	ENSCSAVG00000005282	-	96	73.594	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000011986	-	100	83.540	ENSCANG00000030899	AGO2	94	83.540	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCGRG00001013557	Ago2	94	86.757	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSCGRG00000002120	Ago2	95	86.757	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000011986	-	100	85.396	ENSCSEG00000012273	ago2	93	85.396	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.015	ENSCVAG00000008763	ago2	97	85.767	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.015	ENSDARG00000061268	ago2	93	86.015	Danio_rerio
ENSEBUG00000011986	-	98	85.063	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	85.063	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSDORG00000011242	Ago2	95	86.634	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000011986	-	99	76.707	FBgn0262739	AGO1	86	76.707	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSEASG00005021922	AGO2	99	86.757	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSECAG00000006078	AGO2	94	86.634	Equus_caballus
ENSEBUG00000011986	-	73	82.231	ENSEEUG00000008564	-	69	82.231	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.156	ENSELUG00000019378	ago2	93	86.156	Esox_lucius
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSFCAG00000002782	AGO2	95	86.757	Felis_catus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.156	ENSFALG00000002838	AGO2	94	86.156	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSFDAG00000004759	AGO2	95	86.757	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000011986	-	96	86.211	ENSFHEG00000016080	ago2	93	86.211	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSGMOG00000013651	ago2	94	86.139	Gadus_morhua
ENSEBUG00000011986	-	100	86.156	ENSGALG00000040957	AGO2	94	86.156	Gallus_gallus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSGAFG00000018026	ago2	93	86.262	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSGACG00000006796	ago2	94	86.139	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	86.718	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSGGOG00000011412	AGO2	95	86.757	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSHBUG00000018515	ago2	98	88.047	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSHGLG00000005548	AGO2	94	86.757	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSHGLG00100015994	-	94	86.634	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000011986	-	100	77.847	ENSHGLG00100000694	-	94	77.847	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000011986	-	100	86.386	ENSHCOG00000006200	ago2	95	86.386	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000011986	-	100	86.386	ENSIPUG00000001018	ago2	94	86.386	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSSTOG00000008113	AGO2	95	86.757	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSJJAG00000018712	Ago2	94	86.634	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSKMAG00000019999	ago2	95	86.262	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSLBEG00000005112	ago2	93	86.262	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000011986	-	100	79.218	ENSLACG00000001277	-	94	79.218	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000011986	-	100	85.644	ENSLOCG00000007766	ago2	94	85.644	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSLAFG00000012905	AGO2	95	86.757	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMFAG00000015384	AGO2	95	86.757	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMMUG00000008045	AGO2	93	86.757	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMNEG00000019904	AGO2	95	86.757	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMLEG00000038874	AGO2	94	86.757	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSMAMG00000008662	ago2	96	84.425	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSMZEG00005008998	ago2	98	88.047	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSMGAG00000012942	AGO2	94	86.262	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000011986	-	100	79.084	ENSMAUG00000007785	Ago2	94	79.084	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMICG00000004427	AGO2	94	86.757	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMOCG00000000300	Ago2	95	86.757	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000011986	-	100	83.231	ENSMMOG00000020165	ago2	97	83.231	Mola_mola
ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	ENSMODG00000000748	AGO2	94	86.279	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000011986	-	100	86.510	ENSMALG00000020610	ago2	94	86.510	Monopterus_albus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	94	86.757	Mus_caroli
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMUSG00000036698	Ago2	94	86.757	Mus_musculus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.510	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	94	86.510	Mus_pahari
ENSEBUG00000011986	-	99	86.608	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	94	86.608	Mus_spretus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSMPUG00000001930	AGO2	95	86.757	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000011986	-	70	77.856	ENSMLUG00000004552	-	100	77.856	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSNGAG00000014556	Ago2	95	86.757	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSNBRG00000006100	ago2	93	86.634	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000011986	-	100	82.673	ENSNLEG00000001461	AGO2	99	78.487	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000011986	-	76	91.463	ENSMEUG00000001395	AGO2	77	91.463	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000011986	-	100	75.743	ENSOPRG00000008795	-	95	75.743	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSODEG00000014145	AGO2	95	86.757	Octodon_degus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSONIG00000010747	ago2	93	86.634	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSOANG00000007125	AGO2	94	86.262	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000011986	-	100	84.653	ENSOCUG00000006066	AGO2	95	84.653	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000011986	-	100	85.767	ENSORLG00000004615	ago2	95	85.767	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000011986	-	100	85.767	ENSORLG00020003449	ago2	95	85.767	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000011986	-	100	85.767	ENSORLG00015015319	ago2	95	85.767	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000011986	-	100	85.767	ENSOMEG00000017751	ago2	97	86.059	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSOGAG00000007933	AGO2	95	86.757	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000011986	-	100	85.043	ENSOARG00000003763	AGO2	95	85.043	Ovis_aries
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSPPAG00000037787	AGO2	95	86.757	Pan_paniscus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSPPRG00000002594	AGO2	95	86.757	Panthera_pardus
ENSEBUG00000011986	-	100	85.520	ENSPTIG00000007438	AGO2	94	85.520	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSPTRG00000020622	AGO2	94	86.757	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000011986	-	100	83.911	ENSPANG00000005604	AGO2	97	82.083	Papio_anubis
ENSEBUG00000011986	-	100	85.891	ENSPKIG00000001824	ago2	96	87.627	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000011986	-	100	84.796	ENSPSIG00000004064	AGO2	94	84.796	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSPEMG00000008137	Ago2	95	86.757	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	ENSPCIG00000026513	AGO2	94	86.279	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSPFOG00000005321	ago2	93	86.262	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSPLAG00000007911	ago2	93	86.262	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSPMEG00000007977	ago2	93	86.262	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000011986	-	100	85.644	ENSPREG00000002072	ago2	97	86.582	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000011986	-	52	79.688	ENSPPYG00000018908	-	88	89.474	Pongo_abelii
ENSEBUG00000011986	-	100	82.054	ENSPCAG00000002880	AGO2	95	82.054	Procavia_capensis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSPCOG00000023047	AGO2	95	86.757	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000011986	-	100	70.916	ENSPVAG00000013238	AGO2	88	80.126	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSPNYG00000019928	ago2	98	88.047	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000011986	-	100	86.510	ENSPNAG00000029030	ago2	93	86.510	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSRNOG00000008533	Ago2	92	86.757	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSRBIG00000028225	AGO2	95	86.757	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSRROG00000003162	AGO2	95	86.757	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSSBOG00000018934	AGO2	95	86.757	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	ENSSHAG00000009593	AGO2	94	86.279	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000011986	-	100	86.262	ENSSFOG00015012817	ago2	94	86.262	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.386	ENSSMAG00000014089	ago2	93	86.386	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.386	ENSSDUG00000005726	ago2	93	86.386	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000011986	-	100	86.386	ENSSLDG00000025582	ago2	96	86.386	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000011986	-	92	68.809	ENSSARG00000007232	-	100	68.809	Sorex_araneus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSSPUG00000006608	AGO2	94	86.139	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.510	ENSSPAG00000019543	ago2	92	86.510	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSSSCG00000005935	AGO2	95	86.757	Sus_scrofa
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSTGUG00000012652	-	95	86.139	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000011986	-	100	82.054	ENSTRUG00000007370	ago2	98	86.765	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSTNIG00000017760	ago2	94	86.139	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000011986	-	74	85.000	ENSTBEG00000003401	-	84	85.000	Tupaia_belangeri
ENSEBUG00000011986	-	100	86.634	ENSTTRG00000002872	AGO2	95	86.634	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSUAMG00000010074	AGO2	100	86.607	Ursus_americanus
ENSEBUG00000011986	-	100	81.312	ENSUMAG00000019572	AGO2	95	80.665	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	ENSVVUG00000014692	AGO2	99	86.757	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000011986	-	100	84.653	ENSXETG00000023755	ago2	94	84.653	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSXCOG00000000634	ago2	92	86.139	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000011986	-	100	86.139	ENSXMAG00000000787	ago2	93	86.139	Xiphophorus_maculatus