EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000012181 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: gfm2
Alias: si:dkey-35i22.3|zgc:153835
Full Name: G elongation factor%2C mitochondrial 2
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 96421 bases
Position: chrFYBX02010747.1:1534879-1631299
Accession: ZDB-GENE-060201-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000019665	GTP_EFTU	PF00009.27	5e-66	1	1
ENSEBUP00000019665	EFG_IV	PF03764.18	1.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000020241	-	1992	-	ENSEBUP00000019665	663 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000012181's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000012181's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000012181	gfm2	62	39.264	ENSEBUG00000009369	-	57	38.650
ENSEBUG00000012181	gfm2	87	56.034	ENSEBUG00000012794	gfm1	87	56.250

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSG00000164347	GFM2	100	87.500	Homo_sapiens
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSAPOG00000005965	gfm2	83	79.487	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	67.822	ENSAMEG00000000544	GFM2	88	67.822	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	78.344	ENSACIG00000003338	gfm2	89	75.159	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSAOCG00000014342	gfm2	83	80.128	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.769	ENSAPEG00000000424	gfm2	83	80.128	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	78.846	ENSATEG00000010821	gfm2	81	78.846	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.051	ENSAPLG00000007221	GFM2	82	82.051	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.051	ENSACAG00000009011	GFM2	82	82.051	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSANAG00000027737	GFM2	87	69.307	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	79.245	ENSACLG00000027430	gfm2	88	75.723	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	81.410	ENSAMXG00000009979	gfm2	81	81.410	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSBTAG00000015519	GFM2	82	78.761	Bos_taurus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	60.897	WBGene00022491	Y119D3B.14	88	60.897	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSCJAG00000016802	GFM2	88	69.307	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.500	ENSCAFG00000008298	GFM2	88	69.500	Canis_familiaris
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.500	ENSCAFG00020016998	GFM2	90	69.500	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.652	ENSCHIG00000012765	GFM2	88	69.652	Capra_hircus
ENSEBUG00000012181	gfm2	59	70.297	ENSTSYG00000011664	GFM2	78	70.297	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000012181	gfm2	90	42.523	ENSCAPG00000003480	GFM2	90	42.368	Cavia_aperea
ENSEBUG00000012181	gfm2	96	77.844	ENSCPOG00000006332	GFM2	87	78.182	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSCCAG00000029580	GFM2	88	69.307	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSCATG00000036394	GFM2	88	69.802	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000012181	gfm2	96	77.844	ENSCLAG00000013440	GFM2	83	78.182	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSCSAG00000015464	GFM2	88	69.802	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000012181	gfm2	83	67.164	ENSCHOG00000002245	GFM2	74	67.164	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000012181	gfm2	98	74.332	ENSCPBG00000000761	GFM2	89	74.332	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000012181	gfm2	93	70.323	ENSCING00000003377	-	83	70.323	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	65.584	ENSCSAVG00000002108	-	88	65.584	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSCANG00000042500	GFM2	88	69.802	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	81.410	ENSCGRG00001022802	Gfm2	82	81.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	81.410	ENSCGRG00000001439	Gfm2	82	81.410	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.051	ENSCSEG00000013115	gfm2	85	82.051	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.645	ENSCVAG00000010057	gfm2	86	80.000	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSDARG00000005561	gfm2	83	80.128	Danio_rerio
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	65.025	ENSDNOG00000005118	GFM2	86	65.025	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.051	ENSDORG00000016231	Gfm2	83	82.051	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000012181	gfm2	93	66.452	FBgn0051159	mRRF2	85	66.452	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000012181	gfm2	68	80.769	ENSETEG00000004090	GFM2	60	80.769	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	55.096	ENSEASG00005018285	GFM2	96	55.096	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	45.580	ENSECAG00000006640	GFM2	97	45.480	Equus_caballus
ENSEBUG00000012181	gfm2	86	55.515	ENSEEUG00000004656	GFM2	78	55.515	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSELUG00000003075	gfm2	83	79.487	Esox_lucius
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSFCAG00000011977	GFM2	88	69.802	Felis_catus
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	80.000	ENSFALG00000010106	GFM2	83	80.000	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000012181	gfm2	96	65.269	ENSFDAG00000004993	GFM2	83	65.455	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSFHEG00000006210	gfm2	83	80.128	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	78.846	ENSGMOG00000003177	gfm2	83	78.846	Gadus_morhua
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.192	ENSGALG00000014939	GFM2	88	69.192	Gallus_gallus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSGAFG00000000439	gfm2	81	80.128	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSGACG00000015889	gfm2	95	80.128	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	71.066	ENSGAGG00000012347	GFM2	88	71.066	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000012181	gfm2	97	69.307	ENSGGOG00000013739	GFM2	87	69.307	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	79.245	ENSHBUG00000011021	gfm2	86	78.395	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.892	ENSHGLG00000000419	GFM2	89	80.892	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.892	ENSHGLG00100018383	GFM2	89	80.892	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	76.282	ENSHCOG00000008208	gfm2	91	76.282	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	81.410	ENSIPUG00000024153	gfm2	85	81.410	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.652	ENSSTOG00000007931	GFM2	88	69.652	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSJJAG00000024278	Gfm2	89	69.802	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	77.564	ENSKMAG00000013277	gfm2	83	77.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSLBEG00000020327	gfm2	81	80.128	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	80.606	ENSLACG00000004622	GFM2	87	80.606	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000012181	gfm2	92	84.615	ENSLOCG00000005368	gfm2	83	84.615	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.317	ENSLAFG00000018575	GFM2	88	68.317	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSMFAG00000039713	GFM2	88	69.802	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSMMUG00000019998	GFM2	90	69.802	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSMNEG00000034666	GFM2	88	69.802	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSMLEG00000038075	GFM2	88	69.307	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	78.846	ENSMAMG00000000452	gfm2	84	78.846	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	79.245	ENSMZEG00005004469	gfm2	86	78.395	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	71.795	ENSMGAG00000015100	GFM2	82	71.795	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	57.664	ENSMAUG00000022103	Gfm2	90	57.664	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.812	ENSMICG00000000749	GFM2	88	68.812	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000012181	gfm2	63	67.822	ENSMOCG00000019032	-	72	77.576	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.317	ENSMOCG00000004402	-	86	68.317	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	83.704	ENSMMOG00000004758	gfm2	85	80.000	Mola_mola
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSMODG00000001892	GFM2	80	80.128	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	78.205	ENSMALG00000010323	gfm2	81	78.205	Monopterus_albus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.500	MGP_CAROLIEiJ_G0018814	Gfm2	88	68.500	Mus_caroli
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.000	ENSMUSG00000021666	Gfm2	88	69.000	Mus_musculus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.000	MGP_PahariEiJ_G0015889	Gfm2	88	69.000	Mus_pahari
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.000	MGP_SPRETEiJ_G0019696	Gfm2	88	69.000	Mus_spretus
ENSEBUG00000012181	gfm2	93	81.879	ENSMPUG00000005688	GFM2	90	81.879	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.205	ENSMLUG00000004761	GFM2	87	68.205	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000012181	gfm2	98	69.474	ENSNGAG00000013586	Gfm2	97	46.685	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	78.395	ENSNBRG00000009181	gfm2	86	78.395	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSNLEG00000004979	GFM2	88	69.307	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000012181	gfm2	73	71.875	ENSMEUG00000007885	-	62	71.875	Notamacropus_eugenii
ENSEBUG00000012181	gfm2	87	81.410	ENSOPRG00000001846	GFM2	73	81.410	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.692	ENSODEG00000002193	GFM2	84	82.692	Octodon_degus
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	78.616	ENSONIG00000011183	gfm2	84	78.616	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.769	ENSOANG00000015776	GFM2	81	80.769	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSOCUG00000005349	GFM2	88	69.307	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSORLG00000003360	gfm2	84	80.128	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000012181	gfm2	93	79.866	ENSORLG00020011110	gfm2	90	79.866	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSORLG00015018196	gfm2	90	79.866	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSOMEG00000013774	gfm2	84	79.487	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.966	ENSOGAG00000008961	GFM2	88	68.966	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSOARG00000004491	GFM2	88	69.307	Ovis_aries
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSPPAG00000036359	GFM2	88	69.307	Pan_paniscus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	70.149	ENSPPRG00000002671	GFM2	87	70.149	Panthera_pardus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	70.297	ENSPTIG00000021698	GFM2	88	70.297	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSPTRG00000016989	GFM2	88	69.307	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSPANG00000013600	GFM2	88	69.802	Papio_anubis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.911	ENSPKIG00000018878	gfm2	84	82.911	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	71.500	ENSPSIG00000012954	GFM2	90	70.707	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	73.457	ENSPMGG00000016783	gfm2	96	52.342	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	96	77.246	ENSPEMG00000000622	Gfm2	83	77.576	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000012181	gfm2	88	78.761	ENSPMAG00000000472	gfm2	85	78.761	Petromyzon_marinus
ENSEBUG00000012181	gfm2	56	55.673	ENSPCIG00000020810	-	64	55.820	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSPFOG00000012381	gfm2	81	79.487	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSPLAG00000014750	gfm2	83	79.487	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSPMEG00000005813	gfm2	87	79.195	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSPREG00000021026	gfm2	85	79.487	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSPPYG00000015556	GFM2	87	69.307	Pongo_abelii
ENSEBUG00000012181	gfm2	85	79.641	ENSPCAG00000015284	GFM2	75	79.641	Procavia_capensis
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	68.317	ENSPCOG00000022606	GFM2	88	68.317	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSPVAG00000005391	GFM2	88	69.307	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000012181	gfm2	95	78.616	ENSPNYG00000001950	gfm2	86	77.778	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSPNAG00000018467	gfm2	81	80.128	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	67.337	ENSRNOG00000025285	Gfm2	87	67.337	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSRBIG00000040962	GFM2	88	69.802	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSRROG00000036459	GFM2	88	69.307	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000012181	gfm2	93	59.006	YJL102W	-	84	59.006	Saccharomyces_cerevisiae
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.307	ENSSBOG00000021848	GFM2	88	69.307	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	81.410	ENSSHAG00000017593	GFM2	79	81.410	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	82.051	ENSSFOG00015016059	gfm2	87	82.051	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSSMAG00000010773	gfm2	86	80.128	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSSDUG00000021273	gfm2	87	79.487	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000012181	gfm2	84	67.033	ENSSLDG00000000387	-	85	67.033	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.128	ENSSLDG00000014952	gfm2	89	80.128	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000012181	gfm2	77	67.327	ENSSARG00000009381	GFM2	69	67.327	Sorex_araneus
ENSEBUG00000012181	gfm2	98	74.176	ENSSPUG00000000593	GFM2	82	74.176	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSSPAG00000014163	gfm2	89	75.904	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	70.297	ENSSSCG00000014074	GFM2	86	70.297	Sus_scrofa
ENSEBUG00000012181	gfm2	97	73.514	ENSTGUG00000005985	GFM2	86	73.514	Taeniopygia_guttata
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	80.769	ENSTRUG00000018513	gfm2	82	80.769	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	81.410	ENSTNIG00000013438	gfm2	85	81.410	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000012181	gfm2	90	64.671	ENSTBEG00000012713	GFM2	74	78.761	Tupaia_belangeri
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.802	ENSTTRG00000005188	GFM2	86	69.802	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	67.822	ENSUMAG00000007328	GFM2	88	67.822	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000012181	gfm2	89	61.922	ENSVPAG00000007367	GFM2	79	61.922	Vicugna_pacos
ENSEBUG00000012181	gfm2	99	69.000	ENSVVUG00000009245	GFM2	88	69.000	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000012181	gfm2	91	75.540	ENSXETG00000005076	gfm2	84	75.540	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSXCOG00000015007	gfm2	85	79.487	Xiphophorus_couchianus
ENSEBUG00000012181	gfm2	94	79.487	ENSXMAG00000000772	gfm2	82	79.487	Xiphophorus_maculatus