EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000012580 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 175017 bases
Position: chrFYBX02009581.1:600215-775231
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000020328	CRM1_C	PF08767.11	1e-133	1	1
ENSEBUP00000020359	CRM1_C	PF08767.11	1e-133	1	1
ENSEBUP00000020428	CRM1_C	PF08767.11	1.4e-133	1	1
ENSEBUP00000020428	Xpo1	PF08389.12	5.4e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000020935	-	4746	-	ENSEBUP00000020359	776 (aa)	-	-
ENSEBUT00000020904	-	5021	-	ENSEBUP00000020328	776 (aa)	-	-
ENSEBUT00000021004	-	2694	-	ENSEBUP00000020428	897 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSG00000082898	XPO1	90	79.046	Homo_sapiens
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSAPOG00000004984	-	95	79.668	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000012580	-	100	83.505	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	76.514	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSAMEG00000003460	XPO1	90	79.772	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSACIG00000010818	-	100	80.553	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000012580	-	100	86.598	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	79.065	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSAOCG00000010121	-	100	81.398	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSAOCG00000018914	xpo1a	90	78.008	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	78.008	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSAPEG00000007038	-	99	81.593	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000012580	-	100	86.469	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	78.814	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSATEG00000008816	-	95	79.564	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSAPLG00000004008	XPO1	90	79.979	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSACAG00000002501	XPO1	90	79.979	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSANAG00000020802	XPO1	90	79.046	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSACLG00000015192	-	95	79.564	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	78.746	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	81.270	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.629	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	79.555	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSBTAG00000013254	XPO1	90	79.772	Bos_taurus
ENSEBUG00000012580	-	93	60.000	WBGene00002078	xpo-1	91	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSCJAG00000008877	XPO1	90	79.046	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSCAFG00000003050	XPO1	90	79.772	Canis_familiaris
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSCAFG00020026910	XPO1	96	79.772	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSCHIG00000018132	XPO1	90	79.772	Capra_hircus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSTSYG00000004330	XPO1	90	79.938	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000012580	-	73	84.956	ENSCAPG00000006454	-	100	84.956	Cavia_aperea
ENSEBUG00000012580	-	100	86.856	ENSCPOG00000034053	XPO1	90	78.631	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000012580	-	94	69.577	ENSCCAG00000037445	XPO1	88	64.354	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSCATG00000032674	XPO1	100	79.915	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSCLAG00000012953	XPO1	90	79.772	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSCSAG00000014606	XPO1	90	79.046	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000012580	-	76	89.263	ENSCHOG00000012088	XPO1	73	84.483	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSCPBG00000026239	XPO1	97	79.979	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000012580	-	100	79.768	ENSCING00000024562	-	90	71.946	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000012580	-	100	79.510	ENSCSAVG00000005965	-	90	74.756	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000012580	-	97	85.714	ENSCANG00000028883	XPO1	100	88.673	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.371	ENSCGRG00001000263	Xpo1	90	78.942	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000012580	-	100	87.371	ENSCGRG00000001520	Xpo1	90	78.942	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000012580	-	100	87.887	ENSCSEG00000001693	XPO1	99	80.576	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSCVAG00000016788	-	90	79.772	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000012580	-	100	86.082	ENSCVAG00000016558	xpo1a	90	77.801	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSDARG00000063229	xpo1b	90	79.564	Danio_rerio
ENSEBUG00000012580	-	100	86.727	ENSDARG00000078041	xpo1a	90	78.216	Danio_rerio
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSDNOG00000005805	XPO1	90	79.876	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000012580	-	88	85.930	ENSDORG00000013050	Xpo1	88	76.051	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000012580	-	99	69.131	FBgn0020497	emb	90	62.629	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000012580	-	92	87.805	ENSETEG00000018045	XPO1	84	85.193	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSEASG00005007223	XPO1	90	79.772	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSECAG00000024920	XPO1	96	79.772	Equus_caballus
ENSEBUG00000012580	-	89	85.179	ENSEEUG00000009479	XPO1	73	85.179	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000012580	-	100	84.041	ENSELUG00000014306	-	99	76.316	Esox_lucius
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	79.702	Esox_lucius
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSFCAG00000002702	XPO1	90	79.772	Felis_catus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSFALG00000010989	XPO1	90	79.876	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSFDAG00000014716	XPO1	90	79.938	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000012580	-	100	86.082	ENSFHEG00000002412	xpo1a	90	77.905	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000012580	-	62	90.674	ENSFHEG00000018974	-	97	90.674	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSGMOG00000019063	-	72	88.144	Gadus_morhua
ENSEBUG00000012580	-	100	86.856	ENSGMOG00000004441	xpo1a	90	78.216	Gadus_morhua
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSGALG00000029476	XPO1	90	79.979	Gallus_gallus
ENSEBUG00000012580	-	100	86.340	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	78.852	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSGAFG00000003355	-	98	79.564	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSGACG00000002743	-	90	79.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000012580	-	100	85.954	ENSGACG00000019736	xpo1a	90	77.697	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSGAGG00000017558	XPO1	90	79.876	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSGGOG00000034878	XPO1	90	79.046	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSHBUG00000020037	-	95	79.668	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSHBUG00000007128	xpo1a	90	78.008	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSHGLG00000003115	XPO1	90	79.772	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSHGLG00100012227	XPO1	90	79.772	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	79.915	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSIPUG00000012891	Xpo1	90	79.668	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	ENSIPUG00000024394	XPO1	90	78.734	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSSTOG00000016122	XPO1	90	79.668	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.015	ENSJJAG00000020468	Xpo1	90	79.564	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSKMAG00000016218	-	98	79.357	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000012580	-	100	86.469	ENSKMAG00000004830	xpo1a	90	78.216	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	ENSLBEG00000005740	-	90	79.668	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000012580	-	100	86.026	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	76.508	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000012580	-	100	62.025	ENSLACG00000018213	XPO1	90	58.589	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSLOCG00000016095	xpo1b	89	79.668	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSLAFG00000014553	XPO1	90	79.668	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSMFAG00000038679	XPO1	90	79.046	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSMMUG00000006941	XPO1	90	79.791	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	ENSMNEG00000030909	XPO1	90	79.046	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000012580	-	100	85.128	ENSMLEG00000032004	XPO1	90	77.169	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	ENSMAMG00000010568	-	99	80.745	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSMAMG00000023037	xpo1a	95	78.008	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSMZEG00005005105	xpo1a	90	78.008	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSMZEG00005018158	-	98	79.564	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000012580	-	94	88.721	ENSMGAG00000001496	-	100	88.721	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000012580	-	100	87.371	ENSMAUG00000006769	Xpo1	94	78.942	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSMICG00000027770	XPO1	90	79.772	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	ENSMOCG00000012169	Xpo1	90	79.314	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSMMOG00000008001	-	100	80.532	Mola_mola
ENSEBUG00000012580	-	100	86.598	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	79.065	Mola_mola
ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	ENSMODG00000002831	XPO1	90	78.942	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSMALG00000007085	-	97	79.314	Monopterus_albus
ENSEBUG00000012580	-	100	85.586	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	78.238	Monopterus_albus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	78.700	Mus_caroli
ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	ENSMUSG00000020290	Xpo1	99	78.700	Mus_musculus
ENSEBUG00000012580	-	100	87.113	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	78.700	Mus_pahari
ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	78.700	Mus_spretus
ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	ENSMPUG00000005560	XPO1	90	79.772	Mustela_putorius_furo
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ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	ENSNGAG00000022158	Xpo1	90	79.668	Nannospalax_galili
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ENSEBUG00000012580	-	100	86.211	ENSNBRG00000003776	xpo1a	90	78.008	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000012580	-	100	82.836	ENSNLEG00000009680	XPO1	90	75.504	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000012580	-	56	86.154	ENSMEUG00000013277	-	54	86.154	Notamacropus_eugenii
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