EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000012588 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 47949 bases
Position: chrFYBX02009786.1:564336-612284
Accession: ZDB-GENE-040801-225
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000020304	PRP38	PF03371.15	1.3e-61	1	1
ENSEBUP00000020286	PRP38	PF03371.15	1.6e-24	1	1

Transcripts

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Gene Model

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Orthologs

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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSG00000134748	PRPF38A	76	81.092	Homo_sapiens
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.166	ENSAPOG00000011652	prpf38a	77	81.590	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	76	81.092	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	78.475	ENSACIG00000012292	prpf38a	78	78.661	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.166	ENSAOCG00000018004	prpf38a	77	81.590	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.166	ENSAPEG00000021414	prpf38a	77	81.590	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000012588	prpf38a	60	85.027	ENSATEG00000004608	prpf38a	77	79.012	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	54	75.595	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	69	76.301	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	79.828	ENSACAG00000008249	PRPF38A	76	79.832	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSANAG00000027839	PRPF38A	76	81.092	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000012588	prpf38a	99	55.556	ENSANAG00000029204	-	99	55.696	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.372	ENSACLG00000021595	prpf38a	79	79.498	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.614	ENSAMXG00000029274	prpf38a	76	82.008	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	83	77.778	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	80	81.092	Bos_taurus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	62	63.402	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000012588	prpf38a	83	77.778	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	79	81.092	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	76	81.092	Canis_familiaris
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	76	81.092	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	76	81.092	Capra_hircus
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSTSYG00000009868	-	76	81.092	Carlito_syrichta
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	76	81.092	Cebus_capucinus
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCATG00000032296	PRPF38A	76	81.092	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	76	81.092	Chinchilla_lanigera
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	80.687	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	76	80.672	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000012588	prpf38a	66	73.684	ENSCSAVG00000009580	-	75	68.067	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCANG00000032608	PRPF38A	79	81.092	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCGRG00001018502	-	76	81.092	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000012588	prpf38a	74	70.870	ENSCGRG00001002557	-	80	70.168	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	76	81.092	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	78.475	ENSCSEG00000001269	prpf38a	81	79.079	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.166	ENSCVAG00000012305	prpf38a	77	81.172	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.372	ENSDARG00000039213	prpf38a	76	79.916	Danio_rerio
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	66.094	ENSDORG00000023857	-	72	66.807	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000012588	prpf38a	85	70.787	ENSDORG00000025371	-	83	73.251	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000012588	prpf38a	85	70.787	ENSDORG00000023691	-	83	73.251	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000012588	prpf38a	66	70.874	FBgn0050342	Prp38	57	74.074	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSEASG00005014427	PRPF38A	76	81.092	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSECAG00000022628	PRPF38A	76	81.092	Equus_caballus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	80.717	ENSELUG00000021094	prpf38a	80	80.753	Esox_lucius
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	76	81.092	Felis_catus
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	99	70.645	ENSFALG00000003612	-	79	76.050	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000012588	prpf38a	99	77.492	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	76	81.092	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000012588	prpf38a	85	72.491	ENSFHEG00000014317	prpf38a	80	80.335	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	53	89.157	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	89.157	Gadus_morhua
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.545	ENSGALG00000010627	PRPF38A	76	81.513	Gallus_gallus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	81.614	ENSGAFG00000012422	prpf38a	77	81.590	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.372	ENSGACG00000005423	prpf38a	77	79.498	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	80.687	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	76	80.672	Gopherus_agassizii
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ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.116	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	76	81.092	Heterocephalus_glaber_male
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