EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000012775 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 73296 bases
Position: chrFYBX02009912.1:358345-431640
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSEBUP00000020650	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-66	10	10
ENSEBUP00000020650	zf-met	PF12874.7	8.7e-23	1	5
ENSEBUP00000020650	zf-met	PF12874.7	8.7e-23	2	5
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ENSEBUP00000020650	zf-met	PF12874.7	8.7e-23	4	5
ENSEBUP00000020650	zf-met	PF12874.7	8.7e-23	5	5

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000021226	-	4733	-	ENSEBUP00000020650	467 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000012775	-	91	50.667	ENSEBUG00000002589	-	94	50.667
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ENSEBUG00000012775	-	71	47.087	ENSEBUG00000003236	-	95	46.667
ENSEBUG00000012775	-	70	44.393	ENSEBUG00000001698	-	93	44.393
ENSEBUG00000012775	-	60	51.309	ENSEBUG00000012314	-	69	51.309
ENSEBUG00000012775	-	77	47.059	ENSEBUG00000015834	-	98	47.059
ENSEBUG00000012775	-	92	44.000	ENSEBUG00000015837	-	99	44.000
ENSEBUG00000012775	-	98	66.594	ENSEBUG00000015576	-	97	66.594
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ENSEBUG00000012775	-	81	37.958	ENSEBUG00000007518	-	69	37.958
ENSEBUG00000012775	-	93	47.423	ENSEBUG00000005913	-	73	47.423
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ENSEBUG00000012775	-	88	61.951	ENSEBUG00000007980	-	94	61.951
ENSEBUG00000012775	-	69	49.402	ENSEBUG00000003232	-	58	49.402
ENSEBUG00000012775	-	67	45.089	ENSEBUG00000016164	-	69	45.089
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