EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000015155 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12894 bases
Position: chrFYBX02009712.1:353292-366185
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000024566	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-30	1	4
ENSEBUP00000024566	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-30	2	4
ENSEBUP00000024566	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-30	3	4
ENSEBUP00000024566	zf-C2H2	PF00096.26	3.3e-30	4	4
ENSEBUP00000024566	zf-met	PF12874.7	2.3e-09	1	2
ENSEBUP00000024566	zf-met	PF12874.7	2.3e-09	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000025142	-	1913	-	ENSEBUP00000024566	542 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000015155's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000015155's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000015155	-	88	34.656	ENSEBUG00000005785	-	86	34.238
ENSEBUG00000015155	-	70	45.130	ENSEBUG00000015110	-	65	45.130
ENSEBUG00000015155	-	82	46.774	ENSEBUG00000012823	-	89	46.774
ENSEBUG00000015155	-	75	47.383	ENSEBUG00000006249	-	90	47.383
ENSEBUG00000015155	-	77	46.400	ENSEBUG00000003512	-	75	46.400
ENSEBUG00000015155	-	70	48.571	ENSEBUG00000001826	-	70	48.571
ENSEBUG00000015155	-	94	45.333	ENSEBUG00000006811	-	95	45.333
ENSEBUG00000015155	-	73	42.424	ENSEBUG00000007143	-	63	42.424
ENSEBUG00000015155	-	79	45.890	ENSEBUG00000001525	-	90	43.443
ENSEBUG00000015155	-	70	45.739	ENSEBUG00000007386	-	77	45.739
ENSEBUG00000015155	-	72	46.269	ENSEBUG00000001972	-	66	46.269
ENSEBUG00000015155	-	82	41.729	ENSEBUG00000014888	-	87	41.729
ENSEBUG00000015155	-	71	41.361	ENSEBUG00000007266	-	79	41.361
ENSEBUG00000015155	-	71	40.343	ENSEBUG00000000642	-	80	40.343
ENSEBUG00000015155	-	67	43.791	ENSEBUG00000011896	-	53	43.791
ENSEBUG00000015155	-	86	42.308	ENSEBUG00000005200	-	53	42.308
ENSEBUG00000015155	-	70	45.623	ENSEBUG00000015693	-	74	46.011
ENSEBUG00000015155	-	80	33.996	ENSEBUG00000016857	-	84	33.996
ENSEBUG00000015155	-	72	47.368	ENSEBUG00000011694	-	95	47.368
ENSEBUG00000015155	-	86	44.845	ENSEBUG00000016292	-	55	44.845
ENSEBUG00000015155	-	89	47.581	ENSEBUG00000009291	-	91	47.581
ENSEBUG00000015155	-	88	43.949	ENSEBUG00000012748	-	86	40.339
ENSEBUG00000015155	-	86	42.440	ENSEBUG00000015456	-	92	42.440
ENSEBUG00000015155	-	90	41.200	ENSEBUG00000002721	-	63	41.200
ENSEBUG00000015155	-	92	46.684	ENSEBUG00000011244	-	99	46.684
ENSEBUG00000015155	-	69	35.676	ENSEBUG00000014542	-	67	38.312
ENSEBUG00000015155	-	70	42.188	ENSEBUG00000007931	-	90	42.188
ENSEBUG00000015155	-	71	43.182	ENSEBUG00000017017	-	67	42.586
ENSEBUG00000015155	-	83	45.070	ENSEBUG00000012454	-	99	45.070
ENSEBUG00000015155	-	70	46.407	ENSEBUG00000013622	-	59	46.407
ENSEBUG00000015155	-	70	46.595	ENSEBUG00000013528	-	78	46.595
ENSEBUG00000015155	-	70	44.410	ENSEBUG00000009330	-	62	44.410
ENSEBUG00000015155	-	71	41.615	ENSEBUG00000013213	-	93	42.623
ENSEBUG00000015155	-	69	45.425	ENSEBUG00000001569	-	88	45.425
ENSEBUG00000015155	-	69	46.246	ENSEBUG00000008392	-	74	45.745
ENSEBUG00000015155	-	84	66.359	ENSEBUG00000005722	-	98	66.359
ENSEBUG00000015155	-	74	37.931	ENSEBUG00000014704	ZBTB17	88	37.931
ENSEBUG00000015155	-	69	48.921	ENSEBUG00000002589	-	76	48.921
ENSEBUG00000015155	-	71	40.722	ENSEBUG00000016164	-	70	40.722
ENSEBUG00000015155	-	83	39.394	ENSEBUG00000009383	-	74	39.485
ENSEBUG00000015155	-	70	42.541	ENSEBUG00000014597	-	77	42.541
ENSEBUG00000015155	-	72	40.123	ENSEBUG00000007980	-	63	40.123
ENSEBUG00000015155	-	71	43.114	ENSEBUG00000014050	-	75	43.114
ENSEBUG00000015155	-	69	41.250	ENSEBUG00000005099	-	80	41.250
ENSEBUG00000015155	-	97	40.741	ENSEBUG00000006233	-	84	40.741
ENSEBUG00000015155	-	70	43.145	ENSEBUG00000001943	-	93	43.145
ENSEBUG00000015155	-	71	43.407	ENSEBUG00000015953	-	52	43.407
ENSEBUG00000015155	-	87	34.167	ENSEBUG00000014665	-	91	34.167
ENSEBUG00000015155	-	87	46.410	ENSEBUG00000007308	ZNF845	99	46.410
ENSEBUG00000015155	-	71	37.410	ENSEBUG00000012939	-	72	37.410
ENSEBUG00000015155	-	70	43.299	ENSEBUG00000015472	-	66	43.299
ENSEBUG00000015155	-	69	43.777	ENSEBUG00000011065	-	79	43.777
ENSEBUG00000015155	-	71	42.614	ENSEBUG00000008306	-	79	42.614
ENSEBUG00000015155	-	87	42.308	ENSEBUG00000011435	-	94	42.308
ENSEBUG00000015155	-	74	43.216	ENSEBUG00000003236	-	92	43.216
ENSEBUG00000015155	-	70	41.502	ENSEBUG00000013221	-	82	41.502
ENSEBUG00000015155	-	69	42.400	ENSEBUG00000014768	-	75	42.400
ENSEBUG00000015155	-	88	43.689	ENSEBUG00000008039	-	70	43.689
ENSEBUG00000015155	-	70	46.070	ENSEBUG00000011728	-	77	46.070
ENSEBUG00000015155	-	98	45.974	ENSEBUG00000008988	ZNF845	96	47.656
ENSEBUG00000015155	-	83	38.144	ENSEBUG00000005310	ZNF226	92	37.959
ENSEBUG00000015155	-	98	44.504	ENSEBUG00000003455	-	93	44.504
ENSEBUG00000015155	-	80	40.860	ENSEBUG00000003128	-	89	40.860
ENSEBUG00000015155	-	84	38.754	ENSEBUG00000016969	-	75	38.754
ENSEBUG00000015155	-	86	38.279	ENSEBUG00000009220	-	97	38.279
ENSEBUG00000015155	-	70	44.179	ENSEBUG00000002291	-	67	44.179
ENSEBUG00000015155	-	77	43.714	ENSEBUG00000007797	-	78	43.714
ENSEBUG00000015155	-	70	43.883	ENSEBUG00000014388	-	88	43.883
ENSEBUG00000015155	-	71	42.593	ENSEBUG00000015925	-	83	42.593
ENSEBUG00000015155	-	87	45.763	ENSEBUG00000011479	-	90	45.669
ENSEBUG00000015155	-	72	38.211	ENSEBUG00000011123	-	97	38.211
ENSEBUG00000015155	-	70	44.828	ENSEBUG00000002146	-	69	44.828
ENSEBUG00000015155	-	70	43.068	ENSEBUG00000005264	-	73	43.068
ENSEBUG00000015155	-	74	39.269	ENSEBUG00000001121	-	86	41.969
ENSEBUG00000015155	-	98	47.895	ENSEBUG00000014739	-	92	47.895
ENSEBUG00000015155	-	71	45.953	ENSEBUG00000011751	-	62	46.133
ENSEBUG00000015155	-	74	41.553	ENSEBUG00000015159	-	84	41.553
ENSEBUG00000015155	-	72	41.463	ENSEBUG00000014040	-	73	41.463
ENSEBUG00000015155	-	87	42.951	ENSEBUG00000016093	-	83	42.951
ENSEBUG00000015155	-	82	38.318	ENSEBUG00000006129	-	91	38.318
ENSEBUG00000015155	-	87	37.577	ENSEBUG00000006092	-	72	44.032
ENSEBUG00000015155	-	77	41.026	ENSEBUG00000014284	-	96	41.026
ENSEBUG00000015155	-	70	45.205	ENSEBUG00000007054	-	58	45.205
ENSEBUG00000015155	-	70	39.695	ENSEBUG00000010204	-	72	39.695
ENSEBUG00000015155	-	78	41.393	ENSEBUG00000010205	-	88	39.812
ENSEBUG00000015155	-	72	43.810	ENSEBUG00000015834	-	88	43.810
ENSEBUG00000015155	-	87	50.442	ENSEBUG00000003573	-	91	50.442
ENSEBUG00000015155	-	86	44.709	ENSEBUG00000006112	-	73	44.709
ENSEBUG00000015155	-	77	40.860	ENSEBUG00000008185	-	71	40.860
ENSEBUG00000015155	-	82	42.135	ENSEBUG00000003644	-	92	42.135
ENSEBUG00000015155	-	79	46.277	ENSEBUG00000015522	-	68	46.277
ENSEBUG00000015155	-	69	44.149	ENSEBUG00000013126	-	56	44.149
ENSEBUG00000015155	-	77	37.049	ENSEBUG00000012704	-	69	37.742
ENSEBUG00000015155	-	77	46.154	ENSEBUG00000010878	-	65	46.154
ENSEBUG00000015155	-	89	42.975	ENSEBUG00000013157	-	95	42.975
ENSEBUG00000015155	-	69	44.545	ENSEBUG00000008229	-	57	45.771
ENSEBUG00000015155	-	80	47.244	ENSEBUG00000002454	-	88	47.244
ENSEBUG00000015155	-	82	38.608	ENSEBUG00000015993	-	60	37.566
ENSEBUG00000015155	-	83	42.149	ENSEBUG00000008991	-	91	42.149
ENSEBUG00000015155	-	77	37.751	ENSEBUG00000009484	-	54	37.751
ENSEBUG00000015155	-	70	45.714	ENSEBUG00000008157	-	99	45.714
ENSEBUG00000015155	-	73	46.011	ENSEBUG00000011331	-	86	46.011
ENSEBUG00000015155	-	82	45.623	ENSEBUG00000006080	-	96	45.623
ENSEBUG00000015155	-	77	45.087	ENSEBUG00000004839	-	86	45.087
ENSEBUG00000015155	-	83	36.499	ENSEBUG00000007518	-	68	35.613
ENSEBUG00000015155	-	81	36.278	ENSEBUG00000002606	-	78	37.143
ENSEBUG00000015155	-	71	39.394	ENSEBUG00000004597	-	74	39.394
ENSEBUG00000015155	-	94	40.865	ENSEBUG00000013392	-	88	40.865
ENSEBUG00000015155	-	81	40.171	ENSEBUG00000001329	-	93	40.171
ENSEBUG00000015155	-	71	39.879	ENSEBUG00000014667	-	79	39.482
ENSEBUG00000015155	-	84	37.473	ENSEBUG00000015073	-	99	37.473
ENSEBUG00000015155	-	77	41.860	ENSEBUG00000013400	-	67	41.860
ENSEBUG00000015155	-	89	45.312	ENSEBUG00000005703	-	98	45.312
ENSEBUG00000015155	-	70	44.149	ENSEBUG00000006702	-	73	44.149
ENSEBUG00000015155	-	83	44.324	ENSEBUG00000007305	-	99	44.324
ENSEBUG00000015155	-	87	45.455	ENSEBUG00000011764	-	71	45.455
ENSEBUG00000015155	-	71	43.750	ENSEBUG00000003590	-	71	43.750
ENSEBUG00000015155	-	71	46.884	ENSEBUG00000015207	-	70	46.884
ENSEBUG00000015155	-	70	44.415	ENSEBUG00000010031	-	71	44.415
ENSEBUG00000015155	-	72	49.615	ENSEBUG00000000735	-	99	49.615
ENSEBUG00000015155	-	70	45.048	ENSEBUG00000003418	-	98	45.048
ENSEBUG00000015155	-	88	34.944	ENSEBUG00000005131	-	86	34.572
ENSEBUG00000015155	-	71	43.949	ENSEBUG00000000554	-	77	43.949
ENSEBUG00000015155	-	72	45.778	ENSEBUG00000006987	-	96	45.778
ENSEBUG00000015155	-	70	45.405	ENSEBUG00000001698	-	91	45.405
ENSEBUG00000015155	-	77	46.032	ENSEBUG00000007563	-	70	46.032
ENSEBUG00000015155	-	69	48.056	ENSEBUG00000006212	-	89	48.056
ENSEBUG00000015155	-	96	44.178	ENSEBUG00000015837	-	90	44.178
ENSEBUG00000015155	-	87	35.219	ENSEBUG00000003954	-	85	42.138
ENSEBUG00000015155	-	79	41.243	ENSEBUG00000010756	-	92	41.243
ENSEBUG00000015155	-	85	45.187	ENSEBUG00000008272	-	80	45.187
ENSEBUG00000015155	-	69	46.078	ENSEBUG00000008273	-	78	46.078
ENSEBUG00000015155	-	70	36.533	ENSEBUG00000004301	prdm5	86	36.533
ENSEBUG00000015155	-	77	38.564	ENSEBUG00000002032	-	78	38.564
ENSEBUG00000015155	-	77	40.921	ENSEBUG00000013683	-	99	40.921
ENSEBUG00000015155	-	87	41.401	ENSEBUG00000001741	-	96	34.937
ENSEBUG00000015155	-	80	41.479	ENSEBUG00000012775	-	69	41.479
ENSEBUG00000015155	-	71	44.101	ENSEBUG00000005146	-	96	44.101
ENSEBUG00000015155	-	70	43.662	ENSEBUG00000012314	-	62	43.662
ENSEBUG00000015155	-	75	41.343	ENSEBUG00000016944	-	61	41.343
ENSEBUG00000015155	-	70	41.573	ENSEBUG00000007740	-	88	39.496
ENSEBUG00000015155	-	68	42.857	ENSEBUG00000003232	-	61	42.857
ENSEBUG00000015155	-	77	41.888	ENSEBUG00000002185	-	85	41.888
ENSEBUG00000015155	-	86	46.524	ENSEBUG00000007470	-	99	46.524
ENSEBUG00000015155	-	83	43.043	ENSEBUG00000012919	-	86	43.043
ENSEBUG00000015155	-	71	44.848	ENSEBUG00000000967	-	51	44.848
ENSEBUG00000015155	-	70	46.419	ENSEBUG00000012502	-	90	46.419
ENSEBUG00000015155	-	72	47.756	ENSEBUG00000008852	ZNF845	79	45.789
ENSEBUG00000015155	-	70	43.883	ENSEBUG00000016281	-	88	43.883
ENSEBUG00000015155	-	73	40.506	ENSEBUG00000011582	-	75	39.161
ENSEBUG00000015155	-	79	44.444	ENSEBUG00000010357	-	64	45.059
ENSEBUG00000015155	-	70	44.838	ENSEBUG00000014309	-	71	44.414
ENSEBUG00000015155	-	73	42.268	ENSEBUG00000005012	-	60	42.268
ENSEBUG00000015155	-	70	46.073	ENSEBUG00000005655	-	98	36.008
ENSEBUG00000015155	-	83	42.088	ENSEBUG00000008792	-	99	42.088
ENSEBUG00000015155	-	82	45.055	ENSEBUG00000016878	-	98	45.055
ENSEBUG00000015155	-	71	37.107	ENSEBUG00000012053	-	74	37.107
ENSEBUG00000015155	-	70	45.136	ENSEBUG00000000704	-	84	45.136
ENSEBUG00000015155	-	70	45.050	ENSEBUG00000014042	-	52	45.050
ENSEBUG00000015155	-	69	42.763	ENSEBUG00000014659	-	80	42.763
ENSEBUG00000015155	-	75	47.879	ENSEBUG00000008903	-	78	47.879
ENSEBUG00000015155	-	84	46.465	ENSEBUG00000013874	-	70	46.465
ENSEBUG00000015155	-	81	42.345	ENSEBUG00000013875	-	95	42.345
ENSEBUG00000015155	-	70	46.561	ENSEBUG00000004026	-	71	46.561
ENSEBUG00000015155	-	82	38.889	ENSEBUG00000003459	-	90	38.889
ENSEBUG00000015155	-	72	40.580	ENSEBUG00000011730	-	50	40.580
ENSEBUG00000015155	-	85	43.243	ENSEBUG00000015403	-	85	43.243
ENSEBUG00000015155	-	93	36.429	ENSEBUG00000009436	-	91	36.755
ENSEBUG00000015155	-	69	43.883	ENSEBUG00000009666	-	83	43.883
ENSEBUG00000015155	-	69	44.512	ENSEBUG00000000436	-	67	44.512
ENSEBUG00000015155	-	74	43.416	ENSEBUG00000004844	-	63	43.416
ENSEBUG00000015155	-	72	46.011	ENSEBUG00000004841	-	80	46.011
ENSEBUG00000015155	-	77	37.500	ENSEBUG00000016362	-	57	37.500
ENSEBUG00000015155	-	82	44.681	ENSEBUG00000014469	-	94	44.681
ENSEBUG00000015155	-	72	41.108	ENSEBUG00000013355	-	74	43.038
ENSEBUG00000015155	-	73	43.145	ENSEBUG00000007012	-	71	43.145
ENSEBUG00000015155	-	70	36.000	ENSEBUG00000011562	-	89	36.000
ENSEBUG00000015155	-	83	45.876	ENSEBUG00000006250	-	94	45.876
ENSEBUG00000015155	-	79	34.416	ENSEBUG00000003078	-	73	34.328
ENSEBUG00000015155	-	78	44.819	ENSEBUG00000010472	-	76	44.819
ENSEBUG00000015155	-	87	46.729	ENSEBUG00000009909	-	94	46.729
ENSEBUG00000015155	-	67	46.547	ENSEBUG00000003991	-	88	46.547
ENSEBUG00000015155	-	96	43.200	ENSEBUG00000009208	-	80	43.020
ENSEBUG00000015155	-	89	38.791	ENSEBUG00000005186	-	88	38.791
ENSEBUG00000015155	-	79	47.573	ENSEBUG00000002537	-	95	47.573
ENSEBUG00000015155	-	69	45.000	ENSEBUG00000000422	-	72	45.000
ENSEBUG00000015155	-	71	42.120	ENSEBUG00000007375	-	84	42.120
ENSEBUG00000015155	-	70	45.418	ENSEBUG00000004992	-	54	46.111
ENSEBUG00000015155	-	82	41.704	ENSEBUG00000004999	-	83	45.706
ENSEBUG00000015155	-	71	42.577	ENSEBUG00000002075	-	75	42.577
ENSEBUG00000015155	-	78	42.105	ENSEBUG00000005319	-	62	42.105
ENSEBUG00000015155	-	71	45.500	ENSEBUG00000015661	-	75	45.500
ENSEBUG00000015155	-	82	45.886	ENSEBUG00000005258	-	97	42.662
ENSEBUG00000015155	-	70	41.472	ENSEBUG00000012737	-	75	41.472
ENSEBUG00000015155	-	83	40.693	ENSEBUG00000002371	-	88	40.693
ENSEBUG00000015155	-	71	42.604	ENSEBUG00000008169	-	85	42.604
ENSEBUG00000015155	-	77	40.845	ENSEBUG00000016287	-	89	40.845
ENSEBUG00000015155	-	69	44.643	ENSEBUG00000014227	-	51	43.062
ENSEBUG00000015155	-	74	42.857	ENSEBUG00000015576	-	86	42.857
ENSEBUG00000015155	-	97	44.504	ENSEBUG00000008107	-	99	44.504
ENSEBUG00000015155	-	83	38.312	ENSEBUG00000003842	-	94	35.452
ENSEBUG00000015155	-	70	45.594	ENSEBUG00000011112	-	77	45.594
ENSEBUG00000015155	-	70	41.748	ENSEBUG00000001308	-	86	41.532
ENSEBUG00000015155	-	75	45.879	ENSEBUG00000011837	-	66	45.879
ENSEBUG00000015155	-	87	42.287	ENSEBUG00000004011	-	92	43.408
ENSEBUG00000015155	-	68	39.514	ENSEBUG00000010952	-	70	39.514
ENSEBUG00000015155	-	73	39.925	ENSEBUG00000006847	-	80	39.925
ENSEBUG00000015155	-	96	45.067	ENSEBUG00000012628	ZNF845	97	46.194
ENSEBUG00000015155	-	87	31.193	ENSEBUG00000013577	-	91	31.193
ENSEBUG00000015155	-	77	42.584	ENSEBUG00000013573	-	80	42.584
ENSEBUG00000015155	-	80	43.681	ENSEBUG00000006666	-	90	43.681
ENSEBUG00000015155	-	75	46.392	ENSEBUG00000014717	-	86	46.392
ENSEBUG00000015155	-	95	39.544	ENSEBUG00000010794	-	95	39.544
ENSEBUG00000015155	-	83	34.507	ENSEBUG00000003555	-	75	40.373
ENSEBUG00000015155	-	72	45.646	ENSEBUG00000014648	-	78	45.646
ENSEBUG00000015155	-	72	40.741	ENSEBUG00000001219	-	74	40.741

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000015155	-	82	41.667	ENSATEG00000003344	-	84	41.667	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000015155	-	68	40.719	ENSACLG00000011642	-	81	40.719	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000015155	-	70	43.684	ENSACLG00000019270	-	82	43.684	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000015155	-	76	41.722	ENSCING00000020618	-	95	41.722	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015155	-	72	42.806	ENSCING00000000609	-	97	42.105	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015155	-	70	42.908	ENSCING00000003072	-	99	42.544	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015155	-	72	44.170	ENSDARG00000110710	CU210890.1	97	44.170	Danio_rerio
ENSEBUG00000015155	-	80	45.430	ENSDNOG00000045100	-	96	45.430	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000015155	-	70	41.905	ENSIPUG00000007934	-	95	41.905	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000015155	-	70	41.475	ENSIPUG00000005581	-	71	41.475	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000015155	-	80	44.041	MGP_CAROLIEiJ_G0015655	-	91	44.041	Mus_caroli
ENSEBUG00000015155	-	72	43.382	ENSSLDG00000005868	-	78	43.382	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000015155	-	72	43.382	ENSSLDG00000006217	-	76	43.382	Seriola_lalandi_dorsalis