EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000015402 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7792 bases
Position: chrFYBX02009705.1:1772568-1780359
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000024944	SYF2	PF08231.12	1.6e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000025520	-	573	-	ENSEBUP00000024944	190 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000015402's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000015402's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSG00000117614	SYF2	89	55.495	Homo_sapiens
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSAPOG00000001174	syf2	83	59.391	Acanthochromis_polyacanthus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSAMEG00000010115	-	81	60.914	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000015402	syf2	94	58.974	ENSAMEG00000010134	-	100	58.974	Ailuropoda_melanoleuca
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.868	ENSACIG00000023688	syf2	79	57.868	Amphilophus_citrinellus
ENSEBUG00000015402	syf2	89	55.376	ENSAOCG00000010912	syf2	58	55.376	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSAOCG00000022046	syf2	84	59.898	Amphiprion_ocellaris
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSAPEG00000018858	syf2	76	59.898	Amphiprion_percula
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSATEG00000007745	syf2	83	57.360	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSAPLG00000016435	SYF2	98	59.391	Anas_platyrhynchos
ENSEBUG00000015402	syf2	79	51.205	ENSACAG00000026777	-	100	51.205	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSACAG00000013653	-	97	60.914	Anolis_carolinensis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSANAG00000032473	SYF2	89	56.044	Aotus_nancymaae
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSACLG00000019916	syf2	83	58.376	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSAMXG00000004051	syf2	83	60.406	Astyanax_mexicanus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSBTAG00000001651	SYF2	83	59.898	Bos_taurus
ENSEBUG00000015402	syf2	96	37.500	WBGene00019402	syf-2	85	37.500	Caenorhabditis_elegans
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSCJAG00000046570	SYF2	89	56.044	Callithrix_jacchus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSCAFG00000012895	-	80	60.914	Canis_familiaris
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSCAFG00000030331	-	86	57.360	Canis_familiaris
ENSEBUG00000015402	syf2	87	55.135	ENSCAFG00020021094	-	95	55.135	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSCAFG00020021091	-	80	60.914	Canis_lupus_dingo
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSCHIG00000020874	SYF2	82	59.898	Capra_hircus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSTSYG00000005114	SYF2	81	59.391	Carlito_syrichta
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.204	ENSCAPG00000010006	SYF2	99	60.204	Cavia_aperea
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSCPOG00000005326	SYF2	81	60.406	Cavia_porcellus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSCCAG00000022459	SYF2	89	56.044	Cebus_capucinus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSCATG00000026917	SYF2	81	59.898	Cercocebus_atys
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSCLAG00000008474	SYF2	81	60.406	Chinchilla_lanigera
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSCSAG00000000948	SYF2	81	59.898	Chlorocebus_sabaeus
ENSEBUG00000015402	syf2	59	48.837	ENSCHOG00000005273	-	79	48.837	Choloepus_hoffmanni
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSCPBG00000025073	SYF2	79	60.914	Chrysemys_picta_bellii
ENSEBUG00000015402	syf2	100	44.712	ENSCING00000003017	-	86	46.154	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015402	syf2	100	44.019	ENSCSAVG00000006627	-	94	43.269	Ciona_savignyi
ENSEBUG00000015402	syf2	95	56.906	ENSCANG00000037322	SYF2	87	51.205	Colobus_angolensis_palliatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSCGRG00001020733	Syf2	81	59.391	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.184	ENSCGRG00000005095	Syf2	97	58.706	Cricetulus_griseus_crigri
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.868	ENSCSEG00000000117	syf2	82	57.868	Cynoglossus_semilaevis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSCVAG00000019543	syf2	82	59.391	Cyprinodon_variegatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSDARG00000004706	syf2	83	57.360	Danio_rerio
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSDNOG00000047605	SYF2	80	59.391	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSDORG00000001274	Syf2	81	60.406	Dipodomys_ordii
ENSEBUG00000015402	syf2	95	45.729	FBgn0033556	CG12343	88	45.729	Drosophila_melanogaster
ENSEBUG00000015402	syf2	88	48.087	ENSETEG00000015729	SYF2	80	48.087	Echinops_telfairi
ENSEBUG00000015402	syf2	95	61.224	ENSEASG00005004224	-	80	61.224	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	52.041	ENSEASG00005004232	-	81	52.041	Equus_asinus_asinus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSECAG00000012023	-	80	60.406	Equus_caballus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	61.224	ENSECAG00000010440	-	82	61.224	Equus_caballus
ENSEBUG00000015402	syf2	63	50.735	ENSEEUG00000015084	SYF2	74	50.735	Erinaceus_europaeus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSELUG00000003465	syf2	83	60.406	Esox_lucius
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSFCAG00000010324	-	68	60.914	Felis_catus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	61.421	ENSFCAG00000043095	-	88	56.593	Felis_catus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSFALG00000000460	SYF2	80	60.914	Ficedula_albicollis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSFDAG00000008310	SYF2	81	60.406	Fukomys_damarensis
ENSEBUG00000015402	syf2	76	58.385	ENSFHEG00000007238	syf2	72	58.385	Fundulus_heteroclitus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSGMOG00000019138	syf2	88	58.883	Gadus_morhua
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSGALG00000013639	SYF2	78	59.391	Gallus_gallus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSGAFG00000019435	syf2	83	57.360	Gambusia_affinis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSGACG00000007305	syf2	82	58.883	Gasterosteus_aculeatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSGAGG00000010670	SYF2	79	60.914	Gopherus_agassizii
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSGGOG00000012796	SYF2	89	55.495	Gorilla_gorilla
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSHBUG00000020477	syf2	85	58.376	Haplochromis_burtoni
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.204	ENSHGLG00000014393	SYF2	81	59.204	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000015402	syf2	95	54.167	ENSHGLG00000004304	-	81	54.688	Heterocephalus_glaber_female
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.204	ENSHGLG00100014722	SYF2	81	59.204	Heterocephalus_glaber_male
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSHCOG00000012904	syf2	64	58.883	Hippocampus_comes
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSIPUG00000019859	syf2	83	59.391	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000015402	syf2	67	51.389	ENSSTOG00000023984	SYF2	99	51.389	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSJJAG00000013301	Syf2	93	60.406	Jaculus_jaculus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSKMAG00000013856	syf2	83	58.883	Kryptolebias_marmoratus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSLBEG00000014425	syf2	83	58.376	Labrus_bergylta
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSLACG00000012064	SYF2	83	59.898	Latimeria_chalumnae
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSLOCG00000002728	syf2	78	58.883	Lepisosteus_oculatus
ENSEBUG00000015402	syf2	81	41.176	ENSLAFG00000030814	-	93	41.176	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSLAFG00000023150	-	80	59.898	Loxodonta_africana
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSMFAG00000041831	SYF2	89	54.945	Macaca_fascicularis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSMMUG00000002968	SYF2	89	54.945	Macaca_mulatta
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSMNEG00000030180	SYF2	89	54.945	Macaca_nemestrina
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSMLEG00000030248	SYF2	81	59.898	Mandrillus_leucophaeus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSMAMG00000010403	syf2	82	57.360	Mastacembelus_armatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSMZEG00005006429	syf2	83	58.376	Maylandia_zebra
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSMGAG00000002019	SYF2	99	59.391	Meleagris_gallopavo
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSMAUG00000018974	Syf2	81	59.898	Mesocricetus_auratus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSMICG00000016191	SYF2	99	60.406	Microcebus_murinus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSMOCG00000022938	Syf2	81	59.898	Microtus_ochrogaster
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSMMOG00000002396	syf2	82	57.360	Mola_mola
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.286	ENSMODG00000013951	-	87	57.286	Monodelphis_domestica
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.586	ENSMALG00000010706	syf2	82	59.091	Monopterus_albus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	81	60.406	Mus_caroli
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSMUSG00000028821	Syf2	81	60.406	Mus_musculus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	81	60.406	Mus_pahari
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	81	60.406	Mus_spretus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSMPUG00000015802	-	80	60.914	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSMPUG00000015801	-	80	60.406	Mustela_putorius_furo
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSMLUG00000001885	SYF2	81	60.406	Myotis_lucifugus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSNGAG00000007912	Syf2	80	59.898	Nannospalax_galili
ENSEBUG00000015402	syf2	95	62.431	ENSNBRG00000010720	syf2	83	62.366	Neolamprologus_brichardi
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSNLEG00000035185	SYF2	89	55.495	Nomascus_leucogenys
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSOPRG00000012870	SYF2	81	60.406	Ochotona_princeps
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSODEG00000017664	-	83	59.391	Octodon_degus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	54.497	ENSODEG00000014338	-	80	54.497	Octodon_degus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSONIG00000008213	syf2	83	57.360	Oreochromis_niloticus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSOANG00000009552	SYF2	98	59.898	Ornithorhynchus_anatinus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSOCUG00000013050	SYF2	81	60.406	Oryctolagus_cuniculus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSORLG00000028820	syf2	85	59.898	Oryzias_latipes
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSORLG00020018333	syf2	83	59.898	Oryzias_latipes_hni
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSORLG00015014665	syf2	83	59.898	Oryzias_latipes_hsok
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSOMEG00000013911	syf2	83	59.391	Oryzias_melastigma
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSOGAG00000009962	SYF2	81	60.406	Otolemur_garnettii
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.799	ENSOARG00000006348	-	81	59.799	Ovis_aries
ENSEBUG00000015402	syf2	94	41.538	ENSOARG00000006269	-	100	41.538	Ovis_aries
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSPPAG00000036579	SYF2	89	55.495	Pan_paniscus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSPPRG00000001638	-	80	60.914	Panthera_pardus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	61.421	ENSPPRG00000001651	-	88	56.593	Panthera_pardus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSPTIG00000005711	-	72	60.914	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000015402	syf2	95	61.421	ENSPTIG00000007036	-	80	61.421	Panthera_tigris_altaica
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSPTRG00000000352	SYF2	89	55.495	Pan_troglodytes
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSPANG00000008139	SYF2	89	54.945	Papio_anubis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSPKIG00000008130	syf2	84	60.914	Paramormyrops_kingsleyae
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSPSIG00000011816	SYF2	77	60.914	Pelodiscus_sinensis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSPMGG00000008755	syf2	77	60.914	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSPEMG00000008283	Syf2	81	59.391	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSPCIG00000014235	SYF2	79	60.406	Phascolarctos_cinereus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	56.853	ENSPFOG00000004116	syf2	81	56.853	Poecilia_formosa
ENSEBUG00000015402	syf2	95	56.853	ENSPLAG00000006691	syf2	85	56.853	Poecilia_latipinna
ENSEBUG00000015402	syf2	95	53.807	ENSPMEG00000011684	syf2	84	53.807	Poecilia_mexicana
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSPREG00000003009	syf2	83	57.360	Poecilia_reticulata
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSPPYG00000001713	SYF2	81	60.406	Pongo_abelii
ENSEBUG00000015402	syf2	76	55.172	ENSPCOG00000027011	SYF2	76	55.172	Propithecus_coquereli
ENSEBUG00000015402	syf2	95	50.251	ENSPVAG00000005841	SYF2	80	50.251	Pteropus_vampyrus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSPNYG00000004979	syf2	83	58.376	Pundamilia_nyererei
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSPNAG00000015570	syf2	83	58.883	Pygocentrus_nattereri
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSRNOG00000060597	Syf2	81	60.406	Rattus_norvegicus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	ENSRBIG00000042970	SYF2	89	52.198	Rhinopithecus_bieti
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSRROG00000001347	SYF2	89	54.945	Rhinopithecus_roxellana
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSSBOG00000020184	SYF2	89	56.044	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSSHAG00000007152	-	96	59.898	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSSHAG00000015630	-	79	59.391	Sarcophilus_harrisii
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSSFOG00015023647	syf2	83	60.406	Scleropages_formosus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSSMAG00000009867	syf2	83	59.391	Scophthalmus_maximus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSSDUG00000013072	syf2	88	57.416	Seriola_dumerili
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSSLDG00000012677	syf2	88	57.416	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000015402	syf2	74	57.325	ENSSARG00000012889	SYF2	64	57.325	Sorex_araneus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	ENSSPUG00000005251	SYF2	78	58.883	Sphenodon_punctatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSSPAG00000009626	syf2	83	59.391	Stegastes_partitus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSSSCG00000037481	SYF2	80	59.898	Sus_scrofa
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	ENSTRUG00000001499	syf2	79	59.391	Takifugu_rubripes
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSTNIG00000016912	syf2	88	58.376	Tetraodon_nigroviridis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	42.541	ENSTBEG00000017370	SYF2	77	42.541	Tupaia_belangeri
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	ENSTTRG00000003550	SYF2	81	60.406	Tursiops_truncatus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSUAMG00000002897	SYF2	80	60.914	Ursus_americanus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSUMAG00000013108	SYF2	80	60.914	Ursus_maritimus
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSVPAG00000005705	SYF2	81	59.898	Vicugna_pacos
ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	ENSVVUG00000027175	-	80	60.914	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	ENSVVUG00000027181	-	79	59.898	Vulpes_vulpes
ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.868	ENSXETG00000022797	syf2	79	57.868	Xenopus_tropicalis
ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	ENSXMAG00000022698	syf2	83	58.376	Xiphophorus_maculatus