EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSEBUG00000015661 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Eptatretus_burgeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3006 bases
Position: chrFYBX02010360.1:13494-16499
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSEBUP00000025394	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-27	1	6
ENSEBUP00000025394	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-27	2	6
ENSEBUP00000025394	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-27	3	6
ENSEBUP00000025394	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-27	4	6
ENSEBUP00000025394	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-27	5	6
ENSEBUP00000025394	zf-C2H2	PF00096.26	5.3e-27	6	6
ENSEBUP00000025394	zf-met	PF12874.7	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSEBUT00000025970	-	867	-	ENSEBUP00000025394	288 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSEBUG00000015661's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSEBUG00000015661's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSEBUG00000015661	-	75	52.555	ENSEBUG00000013400	-	75	52.555
ENSEBUG00000015661	-	73	51.741	ENSEBUG00000008272	-	66	51.741
ENSEBUG00000015661	-	70	50.754	ENSEBUG00000008273	-	79	50.754
ENSEBUG00000015661	-	84	47.236	ENSEBUG00000017017	-	64	47.500
ENSEBUG00000015661	-	73	44.776	ENSEBUG00000010205	-	79	44.776
ENSEBUG00000015661	-	86	43.500	ENSEBUG00000014888	-	58	43.500
ENSEBUG00000015661	-	70	49.751	ENSEBUG00000007563	-	67	49.751
ENSEBUG00000015661	-	88	41.546	ENSEBUG00000006129	-	86	41.791
ENSEBUG00000015661	-	79	49.010	ENSEBUG00000007266	-	80	49.010
ENSEBUG00000015661	-	73	52.451	ENSEBUG00000002537	-	87	52.451
ENSEBUG00000015661	-	73	46.354	ENSEBUG00000011694	-	94	46.354
ENSEBUG00000015661	-	73	50.286	ENSEBUG00000005785	-	69	50.286
ENSEBUG00000015661	-	74	51.759	ENSEBUG00000010031	-	66	51.759
ENSEBUG00000015661	-	73	52.475	ENSEBUG00000014648	-	74	52.475
ENSEBUG00000015661	-	75	44.560	ENSEBUG00000014042	-	56	44.388
ENSEBUG00000015661	-	73	51.163	ENSEBUG00000014040	-	67	51.163
ENSEBUG00000015661	-	70	49.751	ENSEBUG00000014388	-	91	49.751
ENSEBUG00000015661	-	73	47.126	ENSEBUG00000013126	-	60	47.126
ENSEBUG00000015661	-	84	50.649	ENSEBUG00000007470	-	89	50.649
ENSEBUG00000015661	-	67	51.497	ENSEBUG00000014730	-	61	51.497
ENSEBUG00000015661	-	73	56.784	ENSEBUG00000014739	-	88	56.784
ENSEBUG00000015661	-	81	45.274	ENSEBUG00000007012	-	76	45.274
ENSEBUG00000015661	-	76	42.157	ENSEBUG00000005186	-	77	40.976
ENSEBUG00000015661	-	70	42.079	ENSEBUG00000011582	-	72	41.872
ENSEBUG00000015661	-	74	51.111	ENSEBUG00000003555	-	69	49.438
ENSEBUG00000015661	-	74	48.241	ENSEBUG00000004011	-	90	48.241
ENSEBUG00000015661	-	72	48.295	ENSEBUG00000004844	-	61	48.295
ENSEBUG00000015661	-	70	42.500	ENSEBUG00000016164	-	69	42.500
ENSEBUG00000015661	-	70	51.031	ENSEBUG00000012737	-	74	51.031
ENSEBUG00000015661	-	72	41.071	ENSEBUG00000007518	-	69	41.071
ENSEBUG00000015661	-	70	52.736	ENSEBUG00000012748	-	68	52.736
ENSEBUG00000015661	-	72	56.098	ENSEBUG00000008903	-	72	56.098
ENSEBUG00000015661	-	75	54.286	ENSEBUG00000014284	-	96	54.286
ENSEBUG00000015661	-	73	44.371	ENSEBUG00000004301	prdm5	75	45.270
ENSEBUG00000015661	-	74	57.143	ENSEBUG00000003455	-	76	57.143
ENSEBUG00000015661	-	74	44.500	ENSEBUG00000003459	-	75	44.500
ENSEBUG00000015661	-	74	56.977	ENSEBUG00000012823	-	80	56.977
ENSEBUG00000015661	-	70	42.282	ENSEBUG00000016969	-	84	42.282
ENSEBUG00000015661	-	72	47.093	ENSEBUG00000002371	-	70	47.093
ENSEBUG00000015661	-	73	50.476	ENSEBUG00000001525	-	89	50.476
ENSEBUG00000015661	-	75	46.766	ENSEBUG00000011112	-	78	46.766
ENSEBUG00000015661	-	73	44.118	ENSEBUG00000005816	-	67	44.118
ENSEBUG00000015661	-	75	51.724	ENSEBUG00000012543	-	56	45.912
ENSEBUG00000015661	-	70	51.587	ENSEBUG00000003573	-	70	51.587
ENSEBUG00000015661	-	74	55.429	ENSEBUG00000005703	-	85	55.429
ENSEBUG00000015661	-	74	50.575	ENSEBUG00000014659	-	71	50.575
ENSEBUG00000015661	-	70	51.667	ENSEBUG00000007054	-	63	51.667
ENSEBUG00000015661	-	73	47.668	ENSEBUG00000014469	-	80	46.701
ENSEBUG00000015661	-	73	54.271	ENSEBUG00000009909	-	81	54.271
ENSEBUG00000015661	-	73	49.718	ENSEBUG00000012454	-	92	49.718
ENSEBUG00000015661	-	73	48.756	ENSEBUG00000013683	-	99	48.756
ENSEBUG00000015661	-	75	54.680	ENSEBUG00000009208	-	55	54.680
ENSEBUG00000015661	-	73	47.945	ENSEBUG00000007305	-	92	47.945
ENSEBUG00000015661	-	74	55.738	ENSEBUG00000002146	-	67	55.738
ENSEBUG00000015661	-	73	48.259	ENSEBUG00000016093	-	85	48.259
ENSEBUG00000015661	-	73	47.712	ENSEBUG00000013573	-	93	48.718
ENSEBUG00000015661	-	77	48.744	ENSEBUG00000012775	-	66	48.744
ENSEBUG00000015661	-	76	49.143	ENSEBUG00000016857	-	66	49.143
ENSEBUG00000015661	-	86	52.113	ENSEBUG00000014597	-	86	52.113
ENSEBUG00000015661	-	67	47.799	ENSEBUG00000005099	-	69	47.799
ENSEBUG00000015661	-	73	46.890	ENSEBUG00000015953	-	51	46.890
ENSEBUG00000015661	-	74	48.241	ENSEBUG00000001741	-	70	48.241
ENSEBUG00000015661	-	70	49.254	ENSEBUG00000009330	-	60	49.254
ENSEBUG00000015661	-	83	54.918	ENSEBUG00000004992	-	70	54.918
ENSEBUG00000015661	-	76	47.260	ENSEBUG00000004999	-	86	48.259
ENSEBUG00000015661	-	71	52.299	ENSEBUG00000011751	-	64	52.299
ENSEBUG00000015661	-	73	44.221	ENSEBUG00000002075	-	77	44.221
ENSEBUG00000015661	-	79	52.475	ENSEBUG00000005131	-	67	52.475
ENSEBUG00000015661	-	74	46.193	ENSEBUG00000011896	-	50	46.193
ENSEBUG00000015661	-	74	53.960	ENSEBUG00000008852	ZNF845	74	53.960
ENSEBUG00000015661	-	73	47.283	ENSEBUG00000010357	-	63	46.766
ENSEBUG00000015661	-	72	53.333	ENSEBUG00000015110	-	67	53.333
ENSEBUG00000015661	-	74	54.455	ENSEBUG00000000642	-	80	54.455
ENSEBUG00000015661	-	71	50.562	ENSEBUG00000006250	-	67	50.562
ENSEBUG00000015661	-	74	58.416	ENSEBUG00000005655	-	74	53.171
ENSEBUG00000015661	-	87	58.209	ENSEBUG00000006249	-	87	58.209
ENSEBUG00000015661	-	73	49.254	ENSEBUG00000003512	-	75	49.254
ENSEBUG00000015661	-	70	51.744	ENSEBUG00000008185	-	61	51.744
ENSEBUG00000015661	-	78	53.691	ENSEBUG00000011123	-	97	53.691
ENSEBUG00000015661	-	74	48.744	ENSEBUG00000002032	-	78	49.419
ENSEBUG00000015661	-	71	53.266	ENSEBUG00000016287	-	51	53.266
ENSEBUG00000015661	-	70	47.692	ENSEBUG00000001308	-	75	47.692
ENSEBUG00000015661	-	75	56.250	ENSEBUG00000002454	-	86	56.250
ENSEBUG00000015661	-	89	49.000	ENSEBUG00000011764	-	60	49.000
ENSEBUG00000015661	-	77	48.980	ENSEBUG00000013355	-	77	48.980
ENSEBUG00000015661	-	71	50.556	ENSEBUG00000016362	-	57	50.556
ENSEBUG00000015661	-	74	52.023	ENSEBUG00000006847	-	77	52.023
ENSEBUG00000015661	-	74	54.726	ENSEBUG00000001972	-	75	54.726
ENSEBUG00000015661	-	73	46.784	ENSEBUG00000015472	-	67	46.784
ENSEBUG00000015661	-	73	51.244	ENSEBUG00000006212	-	92	51.244
ENSEBUG00000015661	-	70	48.864	ENSEBUG00000011331	-	86	48.864
ENSEBUG00000015661	-	74	54.819	ENSEBUG00000008157	-	97	54.819
ENSEBUG00000015661	-	71	46.330	ENSEBUG00000003842	-	86	46.330
ENSEBUG00000015661	-	73	44.000	ENSEBUG00000013875	-	78	44.000
ENSEBUG00000015661	-	74	46.262	ENSEBUG00000008306	-	79	46.262
ENSEBUG00000015661	-	70	51.515	ENSEBUG00000001943	-	97	50.943
ENSEBUG00000015661	-	86	43.056	ENSEBUG00000012053	-	75	43.056
ENSEBUG00000015661	-	80	46.269	ENSEBUG00000014717	-	71	46.269
ENSEBUG00000015661	-	74	48.485	ENSEBUG00000014050	-	75	48.052
ENSEBUG00000015661	-	74	56.395	ENSEBUG00000010472	-	76	56.395
ENSEBUG00000015661	-	86	52.261	ENSEBUG00000015522	-	68	52.261
ENSEBUG00000015661	-	71	54.412	ENSEBUG00000014309	-	61	54.412
ENSEBUG00000015661	-	82	51.079	ENSEBUG00000002586	-	62	51.079
ENSEBUG00000015661	-	72	52.683	ENSEBUG00000011728	-	75	52.683
ENSEBUG00000015661	-	73	51.244	ENSEBUG00000005310	ZNF226	77	51.244
ENSEBUG00000015661	-	71	44.724	ENSEBUG00000005319	-	59	44.724
ENSEBUG00000015661	-	74	56.571	ENSEBUG00000006233	-	63	56.571
ENSEBUG00000015661	-	78	47.656	ENSEBUG00000003128	-	89	47.656
ENSEBUG00000015661	-	74	49.425	ENSEBUG00000014768	-	75	49.425
ENSEBUG00000015661	-	73	55.556	ENSEBUG00000016944	-	59	56.250
ENSEBUG00000015661	-	73	49.296	ENSEBUG00000004597	-	72	49.296
ENSEBUG00000015661	-	71	52.846	ENSEBUG00000005258	-	92	52.846
ENSEBUG00000015661	-	74	49.749	ENSEBUG00000000554	-	75	49.749
ENSEBUG00000015661	-	78	47.778	ENSEBUG00000015993	-	67	47.778
ENSEBUG00000015661	-	74	51.875	ENSEBUG00000003078	-	70	51.875
ENSEBUG00000015661	-	72	43.023	ENSEBUG00000007931	-	59	43.023
ENSEBUG00000015661	-	74	51.295	ENSEBUG00000003232	-	60	51.295
ENSEBUG00000015661	-	74	45.729	ENSEBUG00000002185	-	84	45.729
ENSEBUG00000015661	-	73	54.396	ENSEBUG00000012704	-	70	54.396
ENSEBUG00000015661	-	73	47.159	ENSEBUG00000014667	-	82	50.000
ENSEBUG00000015661	-	74	47.872	ENSEBUG00000014665	-	86	47.872
ENSEBUG00000015661	-	81	60.317	ENSEBUG00000007308	ZNF845	92	60.317
ENSEBUG00000015661	-	71	50.769	ENSEBUG00000009383	-	56	50.769
ENSEBUG00000015661	-	74	43.275	ENSEBUG00000001329	-	93	43.275
ENSEBUG00000015661	-	74	49.000	ENSEBUG00000006092	-	65	49.000
ENSEBUG00000015661	-	70	52.907	ENSEBUG00000016281	-	89	52.907
ENSEBUG00000015661	-	79	52.736	ENSEBUG00000003954	-	72	52.736
ENSEBUG00000015661	-	72	57.471	ENSEBUG00000001569	-	86	57.471
ENSEBUG00000015661	-	70	50.360	ENSEBUG00000012502	-	84	51.515
ENSEBUG00000015661	-	73	45.055	ENSEBUG00000015159	-	82	45.055
ENSEBUG00000015661	-	71	52.980	ENSEBUG00000001698	-	93	52.980
ENSEBUG00000015661	-	73	48.718	ENSEBUG00000009436	-	86	48.718
ENSEBUG00000015661	-	79	41.294	ENSEBUG00000014704	ZBTB17	91	45.833
ENSEBUG00000015661	-	91	54.067	ENSEBUG00000008988	ZNF845	91	54.067
ENSEBUG00000015661	-	74	54.301	ENSEBUG00000011479	-	69	54.301
ENSEBUG00000015661	-	86	55.705	ENSEBUG00000007386	-	76	55.705
ENSEBUG00000015661	-	74	49.048	ENSEBUG00000015837	-	78	49.048
ENSEBUG00000015661	-	70	51.136	ENSEBUG00000004026	-	70	51.136
ENSEBUG00000015661	-	74	49.289	ENSEBUG00000015576	-	83	49.289
ENSEBUG00000015661	-	73	48.241	ENSEBUG00000004841	-	83	48.241
ENSEBUG00000015661	-	71	46.154	ENSEBUG00000010878	-	52	46.154
ENSEBUG00000015661	-	70	52.023	ENSEBUG00000014677	-	84	52.419
ENSEBUG00000015661	-	76	43.750	ENSEBUG00000010794	-	78	43.750
ENSEBUG00000015661	-	70	52.632	ENSEBUG00000014542	-	68	52.632
ENSEBUG00000015661	-	74	46.000	ENSEBUG00000012919	-	75	48.744
ENSEBUG00000015661	-	70	50.581	ENSEBUG00000015925	-	80	48.925
ENSEBUG00000015661	-	75	57.416	ENSEBUG00000012628	ZNF845	81	57.416
ENSEBUG00000015661	-	70	47.264	ENSEBUG00000001121	-	78	47.518
ENSEBUG00000015661	-	73	52.764	ENSEBUG00000004839	-	85	55.000
ENSEBUG00000015661	-	73	51.244	ENSEBUG00000007143	-	65	51.244
ENSEBUG00000015661	-	73	48.603	ENSEBUG00000015403	-	70	48.603
ENSEBUG00000015661	-	74	54.348	ENSEBUG00000015834	-	84	54.348
ENSEBUG00000015661	-	73	44.724	ENSEBUG00000015073	-	77	45.685
ENSEBUG00000015661	-	81	46.269	ENSEBUG00000001219	-	84	46.269
ENSEBUG00000015661	-	73	47.000	ENSEBUG00000008792	-	86	47.000
ENSEBUG00000015661	-	71	51.777	ENSEBUG00000005012	-	59	51.777
ENSEBUG00000015661	-	86	51.741	ENSEBUG00000013528	-	94	51.741
ENSEBUG00000015661	-	70	49.254	ENSEBUG00000002291	-	56	49.254
ENSEBUG00000015661	-	70	49.749	ENSEBUG00000008039	-	69	49.749
ENSEBUG00000015661	-	73	48.256	ENSEBUG00000006702	-	73	48.256
ENSEBUG00000015661	-	73	47.739	ENSEBUG00000008107	-	91	47.739
ENSEBUG00000015661	-	86	47.716	ENSEBUG00000006080	-	87	47.475
ENSEBUG00000015661	-	70	50.249	ENSEBUG00000011837	-	58	50.249
ENSEBUG00000015661	-	75	45.500	ENSEBUG00000015155	-	71	45.500
ENSEBUG00000015661	-	77	55.941	ENSEBUG00000016878	-	84	55.941
ENSEBUG00000015661	-	74	42.262	ENSEBUG00000002606	-	76	42.262
ENSEBUG00000015661	-	75	53.000	ENSEBUG00000015456	-	90	53.000
ENSEBUG00000015661	-	79	56.522	ENSEBUG00000006811	-	88	56.522
ENSEBUG00000015661	-	70	48.276	ENSEBUG00000007740	-	89	48.276
ENSEBUG00000015661	-	73	53.333	ENSEBUG00000010952	-	71	53.081
ENSEBUG00000015661	-	70	42.714	ENSEBUG00000012939	-	75	42.714
ENSEBUG00000015661	-	70	52.239	ENSEBUG00000006666	-	93	52.239
ENSEBUG00000015661	-	70	51.741	ENSEBUG00000006112	-	73	51.741
ENSEBUG00000015661	-	74	50.857	ENSEBUG00000008991	-	81	50.857
ENSEBUG00000015661	-	70	52.000	ENSEBUG00000003236	-	91	48.023
ENSEBUG00000015661	-	74	41.237	ENSEBUG00000007980	-	58	42.132
ENSEBUG00000015661	-	73	53.846	ENSEBUG00000000422	-	72	53.846
ENSEBUG00000015661	-	77	52.542	ENSEBUG00000003991	-	83	52.542
ENSEBUG00000015661	-	74	54.726	ENSEBUG00000006987	-	95	54.726
ENSEBUG00000015661	-	73	52.273	ENSEBUG00000008392	-	74	52.273
ENSEBUG00000015661	-	74	52.299	ENSEBUG00000015207	-	61	52.299
ENSEBUG00000015661	-	84	54.726	ENSEBUG00000009220	-	79	54.726
ENSEBUG00000015661	-	73	50.746	ENSEBUG00000000735	-	98	50.746
ENSEBUG00000015661	-	75	49.246	ENSEBUG00000013622	-	66	49.246
ENSEBUG00000015661	-	73	49.254	ENSEBUG00000003590	-	74	49.000
ENSEBUG00000015661	-	70	53.299	ENSEBUG00000003418	-	92	53.299
ENSEBUG00000015661	-	74	45.699	ENSEBUG00000008169	-	74	45.699
ENSEBUG00000015661	-	73	51.613	ENSEBUG00000009484	-	55	51.613
ENSEBUG00000015661	-	73	45.146	ENSEBUG00000005722	-	96	48.352
ENSEBUG00000015661	-	86	55.224	ENSEBUG00000011244	-	86	55.224
ENSEBUG00000015661	-	74	44.845	ENSEBUG00000011435	-	81	44.670
ENSEBUG00000015661	-	70	50.365	ENSEBUG00000012314	-	63	50.365
ENSEBUG00000015661	-	74	54.950	ENSEBUG00000009291	-	80	54.950
ENSEBUG00000015661	-	83	49.123	ENSEBUG00000010204	-	72	49.123
ENSEBUG00000015661	-	66	47.239	ENSEBUG00000000436	-	69	47.239
ENSEBUG00000015661	-	75	52.518	ENSEBUG00000001826	-	70	52.518
ENSEBUG00000015661	-	70	46.305	ENSEBUG00000013221	-	80	46.305
ENSEBUG00000015661	-	77	49.000	ENSEBUG00000015693	-	79	49.000
ENSEBUG00000015661	-	76	43.443	ENSEBUG00000010756	-	91	43.443
ENSEBUG00000015661	-	70	53.757	ENSEBUG00000008025	-	62	53.757
ENSEBUG00000015661	-	75	50.459	ENSEBUG00000011977	-	76	50.459
ENSEBUG00000015661	-	73	54.011	ENSEBUG00000002589	-	76	54.011
ENSEBUG00000015661	-	70	48.756	ENSEBUG00000014227	-	53	48.756

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSEBUG00000015661	-	73	54.000	ENSATEG00000003344	-	70	54.545	Anabas_testudineus
ENSEBUG00000015661	-	74	56.716	ENSACLG00000011642	-	81	56.716	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000015661	-	71	48.000	ENSACLG00000019270	-	81	48.000	Astatotilapia_calliptera
ENSEBUG00000015661	-	71	48.701	ENSCING00000003072	-	95	48.701	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015661	-	75	44.538	ENSCING00000020618	-	94	44.538	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015661	-	70	43.038	ENSCING00000000609	-	99	41.294	Ciona_intestinalis
ENSEBUG00000015661	-	71	58.291	ENSDARG00000110710	CU210890.1	93	58.291	Danio_rerio
ENSEBUG00000015661	-	73	56.296	ENSDNOG00000045100	-	96	56.296	Dasypus_novemcinctus
ENSEBUG00000015661	-	88	50.000	ENSIPUG00000005581	-	87	50.282	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000015661	-	73	52.809	ENSIPUG00000007934	-	93	52.809	Ictalurus_punctatus
ENSEBUG00000015661	-	71	59.204	MGP_CAROLIEiJ_G0015655	-	78	59.204	Mus_caroli
ENSEBUG00000015661	-	73	52.672	ENSSLDG00000006217	-	77	52.672	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSEBUG00000015661	-	73	52.672	ENSSLDG00000005868	-	79	52.672	Seriola_lalandi_dorsalis